Offre de Thèse: Analyse de L'imagerie en Direct Des Organoïdes Grâce à L'ia

il y a 2 semaines


Paris e, France Institut de la Vision Temps plein

Publié le : 11 décembre 2024

**Offre de thèse: Analyse de l'imagerie en direct des organoïdes grâce à l'IA**:
**Contexte**:
Dans le cadre du programme doctoral international du DIM C-BRAINS, Kate GRIEVE recherche un.e doctorant.e pour son projet ORGAI: Analyse de l'imagerie en direct des organoïdes grâce à l'IA.

Le projet ORGAI rassemble deux équipes de l'Institut de la Vision expertes en imagerie et en développement d'organoïdes, et vise à développer des outils d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique pour quantifier les données spécifiques aux cellules. Notre objectif est de valider notre nouvelle approche d'imagerie en direct appelée DFFOCT pour l'imagerie longitudinale sans étiquette de modèles d'organoïdes dérivés de patients. Notre objectif est de démontrer que le DFFOCT, combiné à une analyse pilotée par l'IA, peut créer des jumeaux numériques pertinents d'organoïdes pour prédire quels médicaments seront les plus efficaces pour les patients individuels. Le doctorant développera de nouveaux modèles d'apprentissage automatique et d'IA, permettant une analyse automatique des données à haut débit. Ces techniques permettront de quantifier la morphologie et la viabilité de chacune des cellules de l'organoïde, d'identifier leurs types cellulaires et de suivre leur devenir. Ces outils numériques permettront d'augmenter la spécificité des microscopes sans étiquette, de prédire des résultats biologiques à partir d'un nombre mínimal de données expérimentales et de généraliser les résultats.

Sujet de thèse détaillé: DIM C-BRAINS

**L’équipe de recherche**:
L’équipe de Kate Grieve, "Imagerie en direct chez les patients et les cellules", développe des technologies d’imagerie innovantes pour découvrir la santé des cellules de la rétine vivante du patient ou en laboratoire.

Imagerie en direct chez les patients et les cellules | Institut de la vision

**Missions**:
L'étudiant.e apprendra à utiliser le microscope DFFOCT pour imager les organoïdes rétiniens et construire la base de données d'images pour l'analyse. En parallèle, l'étudiant.e sera responsable du développement des outils d'intelligence artificielle et d'apprentissage automatique pour l'analyse des données. Il/Elle interagira avec l'équipe pluridisciplinaire du projet afin d'obtenir un retour d'information sur les résultats et leur interprétation.

Le projet de doctorat comprendra les étapes suivantes, dont certaines se dérouleront en parallèle:
1. Utilisation du microscope DFFOCT (M1-M12)
2. Manipulation d'organoïdes rétiniens et obtention de bonnes images (M1-M12)
3. Gestion de la base de données d'images (M1-M30)
4. Développement d'outils d'IA et d'apprentissage automatique (M6-M24)
5. Analyse des données à l'aide des outils développés et retour d'information à l'équipe de projet (M12-M30)
6. Diffusion des résultats (M25-M36)

**Compétences recherchées**:
Connaissances en informatique, programmation et traitement d'images exigées.

**Formation et expérience**:
Une expérience et/ou un intérêt pour l'optique, la microscopie et la biologie seraient appréciés.

**Conditions de travail exceptionnelles**:
Contrat doctoral de 3 ans

Type de contrat:
**CDD**

Lieu du poste:
**Paris 12ème**

Date de début de fonction:
**01/10/2025**

Rémunération:
**selon grille Inserm



  • Paris, France BIOVIA Temps plein

    **Description du rôle et responsabilités**: ***MEDITWIN est un projet qui associe partenaires académiques et industriels. Il vise à proposer des jumeaux virtuels personnalisés des organes, du métabolisme, des tumeurs cancéreuses, pour mieux diagnostiquer et mieux soigner. Avec MEDITWIN les médecins pourront en particulier simuler les scénarios...


  • Paris, Île-de-France LE MERCATO DE L'EMPLOI Temps plein

    L'objectif principal de cette position est la gestion et l'organisation des activités du Centre d'Imagerie Médicale.Compétences requises :Diplôme de Cadre de Santé Infirmier(e) Diplômé(e) d'Etat, de Cadre Manipulateur ou un Master en encadrement des Unités de Soins.Expérience significative d'au moins 2 ans dans un rôle...


  • Paris, Île-de-France THALES Temps plein

    Sur le marché du numérique en plein essor, Thales Digital Factory est engagée dans une transformation de grande envergure. Le groupe ambitionne de se positionner comme un acteur incontournable et exemplaire du digital sur ses divers marchés.Nos bureaux sont répartis entre Paris, Singapour et Montréal, au cœur d'écosystèmes innovants. Nous nous...

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    Dans le cadre d’expérimentations autour de l’intelligence artificielle générative d’images, nous recherchons un profil ayant une bonne vision de l’ensemble du domaine et déjà quelques expériences significatives. Parmi les expériences ou connaissances recherchées: - expériences d'utilisation d'IA générative et en particulier d'IA...


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    Description du posteNous recherchons un expert en menuiserie et ébénisterie pour occuper le rôle de Chef d'atelier H/F. Vous serez responsable de la gestion de l'atelier, de l'encadrement de l'équipe et du suivi de la production.Les responsabilités incluent :Gestion de l'atelier : Superviser et organiser le travail de l'équipe,...

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    il y a 3 semaines


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  • Paris 5e, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 30 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse sur la régulation génique et l'organisation 3D des chromosomes (H/F)** Référence : UMR3664-ANTCOU-006 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail...


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    Bienvenue chez B&M France, où nous recherchons un Chef d'Équipe de Magasin passionné par le commerce et la gestion. Notre équipe est composée de professionnels expérimentés qui partagent notre ambition de fournir aux clients une expérience exceptionnelle.L'offre :Salaire mensuel estimé : 35 000 €Travail en magasin (5j/7)Avantages sociaux...


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    Poste proposé : RSM, 6ème réseau mondial en Audit, Expertise Comptable et Conseil, accompagne les entreprises et leurs dirigeants dans leurs projets de transformation organisationnelle et financière.Nous recherchons un Auditeur Senior en Gestion d'Actifs pour rejoindre notre équipe à Paris. Vous travaillerez auprès de clients diversifiés,...