Bio Informaticien

**Détails de l’offre**:
**POSTE PROPOSÉ**

Bio informaticien : Analyse de Données de Séquençage Haut Débit - H/F

**CONTRAT**

CDD

**DESCRIPTIF**

Descriptif du poste:
Missions:
Développer, optimiser et automatiser des pipelines bioinformatiques internes pour le traitement des données NGS.
Analyser et interpréter les données de séquençage haut débit provenant d'échantillons tumoraux et hématologiques.
Collaborer avec les biologistes, généticiens et cliniciens pour identifier et valider des biomarqueurs diagnostiques et pronostiques.
Gérer les bases de données et créer des outils pour la visualisation et l'intégration des données multi-omiques (génomique, transcriptomique, épigénomique).
Assurer la maintenance des logiciels, bases de données et pipelines bioinformatiques.
Contribuer à la rédaction de publications scientifiques et à la diffusion des résultats.
Gérer les ressources de calcul et de stockage en lien avec le service informatique (serveurs, machines virtuelles).
Participer aux validations de méthodes pour l'accréditation COFRAC NF EN ISO 15189.
Assurer une veille technologique sur les méthodes bioinformatiques et les nouvelles technologies.
Accompagner les techniciens dans la gestion des dysfonctionnements et problèmes techniques d'équipement.
Participer à la conception et l'élaboration des projets de recherche clinique

Profil recherché:
Formation Bac +5 en bioinformatique ou équivalent.
Expérience en analyse de données NGS et connaissance des technologies de séquençage, principalement Illumina et Ion Torrent.
Maîtrise des systèmes Linux et compétences avancées en programmation (Python, R, Bash).
Bonne connaissance des étapes clés de l'analyse NGS et des principaux outils bioinformatiques (GATK, BWA, SAMtools, etc.).
Compétences en création et gestion de bases de données (SQL).
Sens de l'initiative, rigueur scientifique et capacité à résoudre des problèmes complexes.
Maîtrise de l'anglais
Une première expérience dans le domaine est souhaitée, mais pas obligatoire

**PERSONNE À CONTACTER**

**ETABLISSEMENT**

Groupe hospitalier Sud
avenue de Magellan
33600 Pessac