Offre de Thèse

Il y a 2 mois

Montpellier, France CNRS Temps plein

Cette offre est disponible dans les langues suivantes:

- Français
- Anglais

Date Limite Candidature : jeudi 24 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris

**Informations générales**:
**Intitulé de l'offre **:Offre de thèse (H/F) : Profilage Intégratif de Virus par Analyse Mutationnelle de Génome Entier**
Référence : UMR5048-MANLEP-004
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : jeudi 3 octobre 2024
Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral
Durée du contrat : 36 mois
Date de début de la thèse : 1 janvier 2025
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : La rémunération est d'un minimum de 2135,00 € mensuel
Section(s) CN : Organisation, expression, évolution des génomes

**Description du sujet de thèse**:
Profilage Intégratif de Virus par Analyse Mutationnelle de Génome Entier

**Contexte de travail**:
Les résultats attendus sont un grand ensemble de données liant des centaines de milliers de mutations à une douzaine de phénotypes différents. Cela pourrait conduire au développement de variants viraux avec des propriétés améliorées pour le contrôle biologique et la thérapie génique.

**Contraintes et risques**:
La génomique synthétique vise à élucider les organisations génomiques à l'aide de techniques de biologie synthétique. Vu la taille des génomes, les modifications introduites sont arbitraires et loin d'être systématiques. La technique de balayage mutagène en profondeur consiste elle à construire des bibliothèques de variants systématiques autour de séquences hors contexte et à utiliser le séquençage en profondeur pour le phénotypage à haut débit. Ce projet se concentre sur un petit génome viral en tant que modèle pour combiner et étendre ces deux approches.
Les densovirus sont de petits virus de la famille des Parvoviridae infectant les invertébrés. Le densovirus de Junonia Coenia (JcDV) peut infecter plusieurs espèces de lépidoptères et est hautement pathogène contre la légionnaire d’automne (Spodoptera frugiperda), un ravageur de cultures multi-résistant envahissant le monde. JcDV présente un génome d'ADN simple brin de 6 kb flanqué de deux télomères. Il produit deux transcrits se chevauchants tête-bêche : l'un porte trois protéines non structurales, dont deux se chevauchent entièrement sur des cadres de lecture différents et ne sont exprimées qu'après épissage, l'autre code pour quatre versions d'une protéine capsidique portant différentes extensions N-terminales, suivant le codon de départ utilisé. La capside, dont la structure a été résolue, est nue et directement impliquée dans la reconnaissance de l'hôte. Une fois mieux compris et contrôlé, le JcDV pourrait fournir des alternatives durables et programmables aux insecticides chimiques contre les principaux ravageurs d'insectes. Il est également étroitement lié aux vecteurs de thérapie génique AAV et pourrait offrir des opportunités intéressantes dans ce domaine car présentant une moindre antigénicité et plus d’espace de stockage. Nous avons construit une bibliothèque de 300 000 mutants qui couvrent l'ensemble du génome et sont tous marqué par un code-barre ADN unique. Le séquençage de ces codes-barres permet de mesurer efficacement les variations de fréquences des mutants viraux en réponse à divers cribles, permettant ainsi la quantification de divers phénotypes pour tous les mutants en parallèle sur l’ensemble du cycle de vie viral. Cette approche générique permet de quantifier la réplication ou la pathogénicité en utilisant l'ADN viral cellulaire, déterminer les abondances, les sites de début, de fin et d'épissage des transcrits viraux, mesurer l'assemblage, l'encapsidation et la stabilité de la capside, ainsi que les capacités des mutants à entrer dans les cellules et les noyaux à partir de l'ADN des virions. La bibliothèque comprend toutes les substitutions de nucléotides simples ainsi que toutes les suppressions et insertions de nucléotides/ amino-acides simples dans les régions non codantes/codantes. Ces mutations peuvent avoir des effets directs ou en cascade sur de multiples phénotypes.

  • Offre de Thèse

    Il y a 2 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 14 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Offre de thèse (H/F) : biologie du développement, biophysique et imagerie quantitative** Référence : UMR5237-ALBTSA-003 Nombre de Postes : 1 Lieu de...

  • Offre de Thèse en Biophysique

    Il y a 2 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : samedi 28 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Offre de thèse en biophysique (H/F)** Référence : UMR5048-FLOLEP-102 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication :...

  • Catalogueur en charge des thèses médicales

    il y a 2 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Université de Montpellier Temps plein

    MissionL'université de Montpellier est une institution d'excellence dans le domaine de la recherche et de l'enseignement supérieur. Nous sommes à la recherche d'un catalogueur en charge des thèses médicales pour rejoindre notre équipe de bibliothécaires.FonctionsLe catalogueur en charge des thèses médicales aura pour mission de cataloguer et...

  • Thèse Sur La Pharmacologie de Automatisme

    Il y a 3 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 26 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse sur la pharmacologie de automatisme cardiaque H/F** Référence : UMR5203-MATMAN-009 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de...

  • Thèse (H/F)

    Il y a 3 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 26 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse (H/F) : Génomique de l'adaptation à l'envrionnement portuaire** Référence : UMR5554-NICBIE-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...

  • Thèse de Doctorat

    Il y a 2 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 14 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse de doctorat (H/F) en biologie: visualiser les choix cellulaires par l'imagerie de la transcription** Référence : UMR9002-EDOBER-008 Nombre de...

  • Catalogueur en charge des thèses de médecine

    il y a 4 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Université de Montpellier Temps plein

    MissionL'Université de Montpellier recherche un catalogueur en charge des thèses de médecine pour rejoindre son équipe de professionnels passionnés par la gestion des collections documentaires. En tant que catalogueur, vous serez chargé de cataloguer et d'enrichir les notices bibliographiques de thèses de médecine, ainsi que de participer aux...

  • Thèse (H/F)

    Il y a 2 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 10 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse (H/F) Simulations du couplage fluide-solide dans les matériaux nanogranulaires** Référence : UMR5508-LAUDIM-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de...

  • (H/F) Thèse en Génétique de La Drosophile Et en

    Il y a 3 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 26 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F Thèse en génétique de la Drosophile et en Biologie moléculaire** Référence : UMR9002-JERMAN-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...

  • Catalogueur en charge des thèses de médecine

    il y a 3 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Université de Montpellier Temps plein

    MissionLe Service commun de documentation de l'Université de Montpellier recherche un catalogueur en charge des thèses de médecine pour rejoindre son équipe.Mission principale : Rattaché.e au Service commun de la documentation, placé.e sous la responsabilité hiérarchique de la cheffe du bureau des Catalogues, le ou la catalogueur-euse aura pour...

  • Offre de thèse

    Il y a 2 mois

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Offre de thèse (H/F) : Profilage Intégratif de Virus par Analyse Mutationnelle de Génome Entier Référence : UMR5048-MANLEP-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : jeudi 3 octobre 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois...

  • Projet These

    il y a 2 semaines

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 26 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:PROJET THESE H/F: Développement de biosenseurs fluorescents pour la détection de kinases chez les virus géants (Pandoravirus)** Référence :...

  • These - Vers Une Meilleure Intégration de La

    il y a 1 mois

    Montpellier, France INRAE Temps plein

    34196 Montpellier cedex 5 _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales,...

  • These - Reconsidérer La Modélisation Des Dommages

    Il y a 5 mois

    Montpellier, France INRAE Temps plein

    34000 Montpellier _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales,...

  • These - Evaluation Environnementale de Stratégies

    Il y a 5 mois

    Montpellier, France INRAE Temps plein

    34000 Montpellier _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales,...

  • Catalogueur en charge des thèses de médecine

    il y a 3 semaines

    Montpellier, Occitanie, France Université de Montpellier Temps plein

    MissionL'Université de Montpellier recherche un catalogueur en charge des thèses de médecine pour rejoindre son équipe de professionnels passionnés par la documentation et la recherche.Compétences requisesConnaître les missions et fonctions des bibliothèquesConnaître le circuit bibliothéconomiqueConnaitre les règles de catalogage et...

  • Thèse Cifre Synthèse de Nouvelles Alternatives de

    Il y a 5 mois

    Montpellier, France TotalEnergies Temps plein

    **Pays** France **Lieu de travail** MONTPELLIER-RUE BOURRELY(FRA) **Domaine** Recherche Innovation&Développt **Lieu** 34 - Hérault **Durée du contrat** 36 Mois **Expérience** Moins de 3 ans - Appuyez sur les touches espace ou entrée pour alterner la visibilité de la section.Vous êtes **passionné/e par la recherche et développement **et...

  • PROJET THESE H/F: Développement de biosenseurs fluorescents pour la détection de kinases chez les virus géants

    il y a 2 semaines

    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : PROJET THESE H/F: Développement de biosenseurs fluorescents pour la détection de kinases chez les virus géants (Pandoravirus) Référence : UMR5247-CATMOR-006 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : mardi 5 novembre 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat...

  • Offre de Stage

    il y a 2 semaines

    Montpellier, France COLLABIORATION Temps plein

    _**OFFRE DE STAGE**:_ **DÉVELOPPEMENT D’UN ÉCO-EMBALLAGE À BASE DE CELLULOSE D’ALGUES BRUNES** - **COLLABIORATION EN BREF**_ Créé en 2019, COLLABIORATION S.A.S est un bureau d’innovations en biotechnologies, basé en Martinique dont l’ambition est de transformer les idées en innovations saines et durables dans les domaines de la **Santé, le...

  • Modélisation hybride et optimisation opérationnelle des réseaux couplés d'électricité et de chaleur

    il y a 4 semaines

    Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps plein

    Offre de thèseLa thèse proposée vise à développer des modèles de simulation hybrides pour optimiser l'exploitation des réseaux d'alimentation électrique et des réseaux de chaleur urbains.Les objectifs de la thèse sont multiples :Étudier les interactions entre les réseaux d'alimentation électrique et les réseaux de chaleur urbains Développer...