Bio-informaticien (H/F) - Cdd

il y a 2 semaines


Bordeaux, France Institut Bergonié Temps plein

MISSION PRINCIPALE:
Vous travaillerez dans le cadre du projet PREDIVAR sur l’automatisation de l’interprétation des variants, en collaboration avec un biologiste rattaché à l’Unité de Pathologie Moléculaire et un data scientist sur les missions suivantes:

- Participer à la mise à disposition des bases de données nécessaires pour le développement des algorithmes d’aide à l’interprétation des données génétiques.
- Gérer les évolutions nécessaires au développement de ces algorithmes sur les fonctionnalités du logiciel d’interprétation des données développé par l’institut : GenVarXplorer (GVX).
- Vous travaillerez en collaboration étroite avec les biologistes et pathologistes de l’unité de Pathologie Moléculaire du département de Biopathologie de l’institut Bergonié.

ACTIVITÉS GÉNÉRALES:

- Récupérer et structurer les (bases de) données nécessaires à l’interprétation des variants génétiques
- Effectuer du data mining sur les données de littérature
- Intégrer des données cliniques / multi-omiques dans le logiciel GVX pour l’interprétation des données NGS, en assurant l’interopérabilité des données
- Assurer la configuration et le développement de nouvelles fonctionnalités de GVX.

ACTIVITÉS SPÉCIFIQUES:

- Assurer la cohérence des traitements de données avec la réglementation.
- Rédiger la documentation liée aux activités et former les utilisateurs.
- Interagir avec les biologistes et cliniciens en adéquation avec les besoins des projets.
- Travailler en équipe avec les autres bio-informaticiens de l’unité pour la bonne articulation des différents projets.

PROFIL ATTENDU:

- Ingénieur informatique (biologie/santé), Master bio-informatique.
- Appétence pour les données
- Expérience dans la compréhension et la manipulation des données génomiques
- Connaissance en cancérologie sera appréciée favorablement

COMPÉTENCES REQUISES:

- Travail sous environnement linux
- Maitrise du langage Python
- Développement web (angularjs,Python Flask)
- Gestion de version Git
- Connaissance des SGBD
- Expérience en data mining est un plus
- Autonomie et capacité d’apprentissage rapide

ATOUTS DU POSTE:

- Accessibilité: transports en commun à proximité, places de parking, parking vélos sécurisé.
- Prise en charge de l’abonnement transport en commun à 60%
- Comité Social et Économique : chèques cadeaux, chèques rentrée scolaire, places de cinéma
- Restauration collective sur place avec tarif préférentiel (3,41€)

RÉMUNÉRATION & ORGANISATION DU POSTE:

- Contrat de 39h/semaine avec 22 RTT/an

**CANDIDATER**:

- L’Institut Bergonié s’engage en faveur de la diversité culturelle, l’égalité hommes-femmes et l’emploi des travailleurs handicapés.

**CDD 12 MOIS**

**TEMPS COMPLET**

**A POURVOIR DES LE 1ER MAI 2023



  • Bordeaux, France Halle Bio d'Aquitaine SAS Temps plein

    Halle Bio d'Aquitaine, grossiste en fruits, légumes et épicerie 100% bio installé sur le MIN de Bordeaux Brienne. Nous recrutons pour renforcer notre équipe composée actuellement de 13 personnes, un/e vendeur/euse H/F carreau. **Vos missions**: - Accueil et conseils clients - Négociations des tarifs (sur le fruits et légumes) et ventes -...

  • Directeur Adjoint

    il y a 1 mois


    Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout.Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble.Depuis 2005,...


  • Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis 2005,...

  • Responsable Marchandises

    il y a 1 mois


    Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis...


  • Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis...

  • Assistant Adv

    il y a 1 mois


    Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis...


  • Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis...


  • Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis...


  • Bordeaux, France SO BIO Temps plein

    Bienvenue chez So-bio Rejoindre So-bio, c’est participer à une belle aventure humaine au service de LA Bio, une Bio spécialisée inclusive où le lien social prime avant tout. Chez So-bio, LA Bio ne s’impose pas, c’est LA Bio qui s’adapte à chacun. Nous pensons que nos clients doivent vivre leur propre Bio, celle qui leur ressemble. Depuis...


  • Bordeaux, France GLASS&BIO Temps plein

    L'entreprise: Dans le cadre de son développement, GLASS&BIO acteur reconnu dans le mode du pare-brise et la vente de différentes solutions écologiques ( éthanol, décalaminage, climatisation..)., recherche dans le cadre de sa croissance, **une assistante commerciale et administrative EN ALTERNANCE à Nérac (47600) **30 minutes de AGEN**.** **Démarrage...


  • Bordeaux, France PAVILLON DE LA MUTUALITÉ Temps plein

    Le 1er GROUPE Mutualiste Aquitain recrute, un/une Informaticien (H/F) / Support Informatique utilisateurs à temps plein (35h) dont les missions sont notamment les suivantes: **Information générale** **Définition : Deux axes** Axe 2 : Piloter les ressources d'une unité d'exploitation informatique, assurer leur gestion et les évolutions en garantissant...

  • Agent D'entretien

    il y a 1 mois


    Bordeaux, France arcade Temps plein

    société de nettoyage recherche un employé pour un remplacement en CDD: du lundi au vendredi de 17h à 20h à l'adresse indiqué sur l'annonce nettoyage sur un LYCEE, salle de classe, CDI, laboratoire, salle de sport, escaliers, bureaux informaticiens et ascenseurs. Type d'emploi : CDD Durée du contrat : 1 mois Salaire : 11,75€ par heure Exigences...


  • Bordeaux, France Pôle Emploi Temps plein

    Société agricole d'arboriculture spécialisée dans le pruneau BIO cherche son CHEF DE CULTURE H/F pour la gestion de ses vergers de Gironde (localisé à SAINT ANDRÉ ET APPELLES, environ 60 ha) et, distant d'environ 40 km, de celui du Lot et Garonne (à PUYMICLAN environ 60ha). Rattaché(e) au président de la SCEA, le chef de culture arboricole gère...

  • Chargé de Relations Clients

    il y a 4 semaines


    Bordeaux, France ecotone Temps plein

    Ecotone est pionnier et leader européen de l’alimentation bio, végétale et équitable. Sa mission est de nourrir la biodiversité, à travers des marques fortes et engagées comme par exemple Bjorg, Bonneterre, Clipper, Allos, Alter Eco, Danival, Destination, El Granero, Isola Bio, Kallø, Whole Earth, Zonnatura... En 2019, elle est la 1ère entreprise...

  • Manutentionnaire Cdd 6 Mois

    il y a 1 semaine


    Bordeaux, France Brasserie LALUNE Temps plein

    **OFFRE D’EMPLOI : Manutentionnaire CDD 6 mois (F/H)** **(Évolution possible en CDI)** Localisation : Bordeaux Horaire : 37 heures hebdomadaires Salaire : 1750 € brut mensuel Date d’embauche souhaitée : début mai 2023 Expérience demandée : pas d’expérience - Brasserie artisanale 100 % bio en fort développement, la brasserie LALUNE cherche...

  • Vendeur Polyvalent F/H

    il y a 2 semaines


    Bordeaux, France Bio c’ Bon Temps plein

    Mission Bienvenue chez Bio C'Bon Depuis 2008, Bio c’ Bon se démarque par son approche conviviale et joyeuse de la consommation Bio en France. Nous prenons soin de proposer des produits bénéfiques pour la santé et propice au respect de l’environnement. Avec une centaine de magasins bio implantés au cœur des centres ville, nous...

  • Preparateur de Commandes

    il y a 1 mois


    Bordeaux, France Halle Bio d'Aquitaine SAS Temps plein

    Halle Bio d'Aquitaine, grossiste en fruits, légumes et épicerie 100% bio recrute pour renforcer son équipe composée actuellement de 9 personnes, un/e préparateur/trice de commande H/F. **Missions** - assurer en autonomie et en équipe la préparation des commandes - assister le réceptionniste pour le contrôle et le rangement des produits entrants en...


  • Bordeaux, France Ecotone Temps plein

    **Date**: 19 mars 2024 **Lieu**: Bordeaux, france **Entreprise**: Ecotone Rejoignez le mouvement et faites la différence ! #ImIn Ecotone est pionnier et leader européen de l’alimentation bio, végétale et équitable. Sa mission est de nourrir la biodiversité, à travers des marques fortes et engagées comme par exemple Bjorg, Bonneterre, Clipper,...

  • Preparateur de Commandes

    il y a 1 mois


    Bordeaux, France Halle Bio d'Aquitaine SAS Temps plein

    Halle Bio d'Aquitaine, grossiste en fruits, légumes et épicerie 100% bio recrute pour renforcer son équipe composée actuellement de 10 personnes, un/e préparateur/trice de commande H/F. **Missions** - assurer en autonomie et en équipe la préparation des commandes - assister le réceptionniste pour le contrôle et le rangement des produits entrants en...


  • Bordeaux, France Léa Nature Temps plein

    LÉA NATURE, ça vous parle ? Vous connaissez sûrement nos marques phares comme Jardin BiO, SO’BiO étic, Floressance, Eau Thermale Jonzac… Ce que vous allez trouver de différent chez nous ? • Nous concevons, fabriquons et commercialisons plus de 1600 références de produits bio et naturels. • Nous déclinons notre expertise des plantes en 4...