Gestion Et Intégration de Données Phénotypiques

il y a 3 semaines

GifsurYvette, France INRAE Temps plein

91190 GIF-SUR-YVETTE _

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**Présentation INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

**Environnement de travail, missions et activités**:
Vous serez accueilli-e au sein de l’équipe Génétique quantitative et méthodologie de la sélection (GQMS) de l'unité mixte de recherche Génétique Quantitative et Evolution. Celle-ci comprend 70 agents : et développe des programmes de génétique pour la valorisation de la diversité des plantes cultivées. Elle fait partie de l’Institut Diversité, Ecologie, Evolution du Vivant (IDEEV) situé sur le campus de l’Université Paris-Saclay. Au cours des dernières années, de nombreuses expérimentations de phénotypage au champ et en plateforme ont été réalisées pour caractériser le comportement de panels représentatifs de la diversité du maïs, dans des conditions environnementales contrastées (température, alimentation hydrique, etc). Ces projets ont été conduits par l’équipe et ses partenaires (Cornfed, Drops Amaizing, Cornfed, C4Future ) mais aussi d’autres initiatives internationales (Genome to Field notamment). L’ensemble constitue une riche source d’informations pour mieux comprendre les bases génétiques de l’adaptation aux stress abiotiques et guider la création de nouvelles variétés adaptées au changement climatique et à la transition agroécologique. Pour pouvoir exploiter cette information, il est nécessaire de la rendre accessible auprès de la communauté scientifique. Vous serez en charge de la gestion et l’intégration de nombreuses données phénotypiques acquises au champ et en plateforme sur des panels de plusieurs centaines d’individus chez le maïs, ainsi que de données résumant les conditions environnementales dans lesquelles les observations ont été effectuées. Pour les principaux jeux de données et variables identifiés par les chercheurs concernés, vos missions seront de:

- Pour les jeux de données qui le nécessiteront, prétraitement de données pour estimer les valeurs des individus dans une condition donnée.
- Harmonisation des identifiants des individus entre les différentes expériences de phénotypage et de génotypage. L’évaluation de la cohérence des données de génotypage entre études sera réalisée en collaboration avec une collègue de l’équipe.
- Intégration des données phénotypiques, environnementales et de génotypage dans la base de données Thalia.

Premières analyses des corrélations et des interactions génotype x environnement à l’aide d’approches multivariées. Interaction avec les chercheurs en charge des analyses de génétique d’association et de prédiction génomique. Préparation des données en vue de leur publication dans des répertoires en libre accès (dataverse INRAE). Contribution à l’écriture de publications

Note : Tout au long de l’étude vous participerez avec les chercheurs concernés à l’identification de projets additionnels susceptibles d’enrichir la base de données constituée.

**Formations et compétences recherchées**:
**Master/Ingénieur (Bac+5)**
- Ingénieur ou Master 2 ayant des connaissances en bioinformatique et/ou agronomie et génétique
- Compétences en statistiques (ACP, ANOVA, modèle mixte), connaissance du langage R.
- Des compétences en gestion de données de « grandes dimension » et en développement collaboratif (Usage de GIT pour versionnage, R markdown pour rapports automatisés, etc.) seront un plus
- Sens de l’organisation et rigueur

**Votre qualité de vie à INRAE**:
En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée):

- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

**Modalités pour postuler**:
**J'ENVOIE MON CV ET MA LETTRE DE MOTIVATION**

**RÉFÉRENCE DE L'OFFRE**:

- **Contrat**: Mission temporaire
- **Durée**: 18
- **Début du contrat **:Dès que possible
- **R

  • Stagiaire Biologically constrained de novo generation of molecules

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Servier Temps plein

    Fondé pour servir la santé, Servier est un groupe pharmaceutique international gouverné par une Fondation, qui aspire à avoir un impact sociétal significatif pour les patients et pour un monde durable. Son modèle unique de gouvernance lui permet de servir pleinement sa vocation avec une vision à long terme : être engagé pour le progrès...

  • Directeur Development

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France L-ACOUSTICS SAS Temps plein

    Nous recrutons un(e) un Directeur Development & Integration Votre poste et vos missions Membre du management de la division IT & Digital, vous intervenez au cœur des différents projets de développement du Groupe sur un périmètre international (3 BU Business EMEA, AMERICAS & APAC – 3 centres R&D France, Royaume-Uni & Allemagne – 4 sites...

  • Technicien.ne de gestion des données multimédia

    il y a 3 semaines

    Bry-sur-Marne, France Institut national de l'audiovisuel Temps plein

    L'entreprise EPIC créé en 1975, l’INA est chargé de conserver, de valoriser et de transmettre le patrimoine audiovisuel français. Premier centre d’archives numérisées au monde avec plus de 3 millions et demi d’heures de télévision et de radio auxquelles s’ajoutent chaque année 800 000 heures au titre du dépôt légal, l’INA...

  • Directeur Data

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France L-ACOUSTICS SAS Temps plein

    Nous recrutons un(e) un Directeur Data & BI Services Votre poste et vos missions Membre du management de la division IT & Digital, vous intervenez au cœur des différents projets de développement du Groupe sur un périmètre international (3 BU Business EMEA, AMERICAS & APAC – 3 centres R&D France, Royaume-Uni & Allemagne – 4 sites industriels...

  • Cdd Assistant en Gestion Des Resources Humaines

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France CNRS Temps plein

    Date Limite Candidature : jeudi 15 février 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:CDD Assistant en gestion des resources humaines dans une unité de recherche H/F** Référence : UMR9198-CHROUL1-111 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : GIF SUR YVETTE CEDEX Date de publication : jeudi 25 janvier 2024 Type de contrat : CDD...

  • Assistant(E) Commercial(E)

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Toit et Moi Temps plein

    **pour notre agence de GIF-SUR-YVETTE (91190) - CDI, statut salarié** Vous aimez les **contacts humains** et le** travail en équipe** ? Vous avez déjà exprimé un vrai talent en matière d'**organisation**, et de **communication** ? Vous travaillez déjà dans l'immobilier, ou cet univers vous attire fortement ? **TOIT ET MOI est sûrement...

  • Chef de Projet gestion des risques qualité

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Servier Temps plein

    Fondé pour servir la santé, Servier est un groupe pharmaceutique international gouverné par une Fondation, qui aspire à avoir un impact sociétal significatif pour les patients et pour un monde durable. Son modèle unique de gouvernance lui permet de servir pleinement sa vocation avec une vision à long terme : être engagé pour le progrès...

  • Ingénieur.e Web Full Stack

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Synchrotron SOLEIL Temps plein

    SOLEIL est le centre français de rayonnement synchrotron, situé sur le plateau de Saclay près de Paris. Il s’agit d’un instrument pluridisciplinaire et d’un laboratoire de recherche, ayant pour mission de conduire des programmes de recherche en utilisant le rayonnement synchrotron, de développer une instrumentation de pointe sur les lignes de...

  • Alternant(e) - business data analyst H/F

    il y a 1 semaine

    Gif-sur-Yvette, France CEA Temps plein

    Description de l'offre La cellule SI Financier assure la maitrise d'ouvrage des applications financières du CEA et d'une manière générale assiste les unités financières pour leur besoins outils et requête. La proposition de stage d'apprentissage consiste à rejoindre cette équipe sur la thématique données, traitement de données et...

  • Assistant Commercial

    il y a 3 semaines

    Gif-sur-Yvette, France TOIT ET MOI Temps plein

    Nous recrutons un(e) **ASSISTANT(E) COMMERCIAL(E) **pour notre agence de **GIF SUR YVETTE (91190)** Les agences TOIT ET MOI existent depuis 25 ans, comptent 10 collaborateurs, et sont implantées à Chevreuse (78460) et à Gif-sur-Yvette (91190). Elles interviennent sur 3 métiers : la **transaction immobilière **(achat/vente), la **location**, et...

  • Ingénieur Senior Génie des Procédés

    il y a 2 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Gaztransport et Technigaz Temps plein

    GAZTRANSPORT & TECHNIGAZ, une entreprise pleine d’énergie ! Société française d’ingénierie, leader mondial en matière de conception de cuves cryogéniques à membranes pour le GNL, GTT développe son expertise dans les domaines du transport maritime et du stockage terrestre. Grâce aux compétences de ses équipes d’ingénieurs et de techniciens,...

  • Alternance Data manager

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Servier Temps plein

    Fondé pour servir la santé, Servier est un groupe pharmaceutique international gouverné par une Fondation, qui aspire à avoir un impact sociétal significatif pour les patients et pour un monde durable. Son modèle unique de gouvernance lui permet de servir pleinement sa vocation avec une vision à long terme : être engagé pour le progrès...

  • Assistant Administratif(H/F)

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Groupe Partnaire Temps plein

    Contrat : 6 mois Votre agence Partnaire IPC du 9ème arrondissement de Paris, grâce à son équipe d'experts en Ressources Humaines et particulièrement dans le domaine « Tertiaire / Industrie Pharmaceutique et Cosmétique », vous assure des propositions de postes ciblés et un suivi personnalisé. Notre client situé à Saclay recherche un assistant...

  • Gestionnaire Administratif Et Financier

    il y a 5 jours

    Gif-sur-Yvette, France ENS PARIS-SACLAY Temps plein

    **À propos de nous**: La mission de l’ENS Paris-Saclay est de former, sur la base d'un recrutement sélectif, les élèves et les étudiants (les normaliens) aux métiers de l’enseignement supérieur et de la recherche et plus largement à tous les métiers exigeant une expertise scientifique élevée ainsi qu'à la haute fonction publique. Cette...

  • Senior Data Scientist en CDI H/F

    il y a 4 semaines

    Gif-sur-Yvette, France Servier Temps plein

    Fondé pour servir la santé, Servier est un groupe pharmaceutique international gouverné par une Fondation, qui aspire à avoir un impact sociétal significatif pour les patients et pour un monde durable. Son modèle unique de gouvernance lui permet de servir pleinement sa vocation avec une vision à long terme : être engagé pour le progrès...

  • Optimisation Robuste Pour La Segmentation Avec Des

    il y a 7 jours

    Gif-sur-Yvette, France Université Paris-Saclay GS Sciences de l'ingénierie et des systèmes Temps plein

    **Optimisation robuste pour la segmentation avec des annotations incertaines // Robust Optimization for Segmentation with Uncertain Labelling**: - Réf - **ABG-118376** **ADUM-51671** - Sujet de Thèse- 23/11/2023- Université Paris-Saclay GS Sciences de l'ingénierie et des systèmes- Lieu de travail- Gif sur Yvette - France- Intitulé du sujet-...

  • Modélisation Des Interconnexions Des Puces

    il y a 7 jours

    Gif-sur-Yvette, France Université Paris-Saclay GS Sciences de l’ingénierie et des systèmes Temps plein

    **Modélisation des interconnexions des puces semiconductrices par mousses métalliques // Interconnections modeling of semiconductors chips using metal foam**: - Réf - **ABG-112176** **ADUM-46554** - Sujet de Thèse- 17/03/2023- Université Paris-Saclay GS Sciences de l’ingénierie et des systèmes- Lieu de travail- Gif-sur-Yvette - France- Intitulé...

  • Alternant(e) - business data analyst (H/F)

    il y a 7 jours

    Gif-sur-Yvette, France Cea Temps plein

    La cellule SI Financier assure la maitrise d'ouvrage des applications financières du CEA et d'une manière générale assiste les unités financières pour leur besoins outils et requête.La proposition de stage d'apprentissage consiste à rejoindre cette équipe sur la thématique données, traitement de données et reporting.En association avec le membre...

  • Alternant(e) - business data analyst (H/F)

    il y a 6 jours

    Gif-sur-Yvette, Île-de-France Cea Temps plein

    La cellule SI Financier assure la maitrise d'ouvrage des applications financières du CEA et d'une manière générale assiste les unités financières pour leur besoins outils et requête.La proposition de stage d'apprentissage consiste à rejoindre cette équipe sur la thématique données, traitement de données et reporting.En association avec le membre...

  • Chef de Service Integration et Exploitation H/F

    il y a 1 mois

    Villebon-sur-Yvette, France beBee S FR Temps plein

    POSTE : Chef de Service Integration et Exploitation H/F DESCRIPTION : Le Chef de service Intégration et Expertise organise et manage ses équipes afin d'apporter, aux différentes entités Sogetrel, le support nécessaire à leurs activités pour garantir le développement rentable et la satisfaction des clients Sogetrel. Il met en place les outils...