Stage de Master 2 en Bioinformatique
il y a 1 semaine
78350 Jouy en Josas _
**RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS**
**Présentation INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
**Environnement de travail, missions et activités**:
Vous serez accueilli(e) dans l'équipe Food Microbial Ecology (FME) de l'unité MICALIS, à Jouy-en-Josas (20 km au sud-ouest de Paris et 8 km de Versailles). La thématique que mène notre équipe vise à comprendre les règles qui gouvernent les écosystèmes alimentaires afin d’en améliorer la qualité, la sécurité et la conservation que ce soit à travers des procédés fermentaires ou de bio-préservation. Nous étudions en particulier sur les écosystèmes laitiers, carnés ainsi que les légumes fermentés. Dans le cadre de nos projets, nous développons des consortia synthétiques de micro-organismes afin de comprendre les synergies existantes entre différents micro-organismes de ces écosystèmes et d’élucider notamment leur impact sur la santé, sur la fermentation ou la bio-préservation.
Dans le cadre du « Grand Défi Ferments du Futur » (GDFF), le projet SynthPlex se concentre sur le développement d'aliments fermentés à base de plantes avec des propriétés bénéfiques pour la santé, par le biais d'interactions avec le microbiote intestinal. SynthPlex cherche à identifier l'influence de métabolites spécifiques présents dans les matrices alimentaires végétales sur la croissance et le métabolisme des micro-organismes. Les résultats de cette recherche seront utilisés pour concevoir des consortiums microbiens adaptés pour des aliments fermentés fonctionnels. SynthPlex combine des expérimentations in vitro dans des micro-fermenteurs et des analyses in silico pour identifier les interactions trophiques au sein des consortia synthétiques.
Des bases de données sont en cours de développement pour héberger ces données massives et hétérogènes : en particulier l’entrepôt de données SIDURI développé par l’unité MAIAGE dans le cadre de GDFF. De même, au sein de l’équipe FME, Food2Gut est une plateforme de recherche conçue pour intégrer des données « omiques » variées (génomiques, métagénomiques) et des métadonnées afin d’étudier les interactions microbiennes dans les aliments et l’intestin.
Le but du stage sera de développer, pour les besoins du projet SynthPlex, les modules dédiés aux données métabolomiques, aux données transcriptomiques et à la description des interactions entre micro-organismes au sein de l’entrepôt de données de l’équipe puis de mettre en place les procédures d’intégration de données nécessaires à leur alimentation. La mise en œuvre de l’interopérabilité entre ces données et des données génomiques et métagénomiques déjà intégrées serait également souhaitée.
Enfin, il est également crucial de mettre en place une interopérabilité forte avec l’entrepôt SIDURI de GDFF.
Pour cela voici les principales taches associées:
- Concevoir et développer les modules de la base de données multi-omique
- Intégrer les données métabolomiques caractérisant les consortia synthétiques à la base de données
- Automatiser le traitement régulier des flux de données pour capter les sorties issues des micro-fermenteurs
- Développer des procédures ETL (Extract Transform Load) pour l’intégration de ces données dans l’entrepôt.
- Intégrer les données de méta-omics générées dans le cadre de SynthPlex dans la base de données de l’équipe à l’aide des pipelines bioinformatiques existants. Identifier des données pivots pour garantir l’interopérabilité avec SIDURI.
- Participer au développement d’une base de données conforme aux principes FAIR pour stocker et interroger les résultats des analyses, facilitant ainsi la modélisation des consortia microbiens. En fonction des choix stratégiques et techniques, cette base de données pourrait être une extension de Food2Gut.
**Conditions particulières d’activité : L’unité Micalis est une Zone à Régime Restrictif. Le recrutement est donc soumis à validation du ministère.**
**Formations et compétences recherchées**:
**Licence (Bac+3)**
- Formation recommandée : Etudiant en Master 2 de Bioinformatique ayant un goût prononcé pour l’intégration de données, de bonnes compétences en développement de script.
- Connaissances souhaitées :
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Bioinformaticien-ne Au Sein Du Projet Ferments Du
Il y a 4 mois
Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein78350 _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18...
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Bioinformaticien / Bioinformatician
il y a 3 jours
Jouy-en-Josas, Île-de-France SFBI Temps pleinDescription du PosteL'unité INRAE MetaGenoPolis recherche un spécialiste en analyse de données omiques pour rejoindre son équipe InfoBioStat (IBS). Le candidat idéal aura une expérience en analyses de données omiques et une maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation.MissionsMener le projet d'analyse de données...
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Bioinformaticien / Bioinformatician
il y a 5 jours
Jouy-en-Josas, Île-de-France SFBI Temps pleinDescription du PosteL'unité INRAE MetaGenoPolis recherche un spécialiste en analyse de données omiques pour rejoindre son équipe InfoBioStat (IBS). Le candidat idéal possèdera une solide expérience en analyses de données omiques et une maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation.MissionsMener le projet d'analyse de données...
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Bioinformaticien / Bioinformatician
il y a 5 jours
Jouy-en-Josas, Île-de-France SFBI Temps pleinDescription du PosteL'unité INRAE MetaGenoPolis recherche un spécialiste en analyse de données omiques pour rejoindre son équipe InfoBioStat (IBS). Le candidat idéal possèdera une solide expérience en analyses de données omiques et une maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation.MissionsMener le projet d'analyse de données...
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Bioinformaticien / Bioinformatician
il y a 1 jour
Jouy-en-Josas, Île-de-France SFBI Temps pleinDescription du PosteL'unité INRAE MetaGenoPolis recherche un Bioinformaticien / Bioinformatician pour rejoindre son équipe InfoBioStat (IBS). Le candidat idéal aura une expérience en analyses de données omiques et une maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation.MissionsMener le projet d'analyse de données...
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Gestionnaire de Données Du Projet Ferments Du
Il y a 4 mois
Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein78350 _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18...
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Stage d'analyse Financière, Economique et Sociale F/H
Il y a 4 mois
Jouy-en-Josas, France AXIA Consultants Temps pleinAXIA Consultants est un cabinet d'expertise comptable, spécialisé dans le conseil aux comités sociaux et économiques (CSE), habilité Expert CSE QUalité du Travail et de l'EMploi, Organisme de Formation Certifié.Afin d'enrichir le dialogue social, le droit social français permet aux représentants du personnel de se faire assister par des experts dans...
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Stage d'analyse Financière, Economique et Sociale F/H
Il y a 4 mois
Jouy-en-Josas, France AXIA Consultants Temps pleinAXIA Consultants est un cabinet d'expertise comptable, spécialisé dans le conseil aux comités sociaux et économiques (CSE), habilité Expert CSE QUalité du Travail et de l'EMploi, Organisme de Formation Certifié. Afin d'enrichir le dialogue social, le droit social français permet aux représentants du personnel de se faire assister par des experts...
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Stage d'analyse Financière, Economique et Sociale F/H
Il y a 4 mois
Jouy-en-Josas, France AXIA Consultants Temps pleinAXIA Consultants est un cabinet d'expertise comptable, spécialisé dans le conseil aux comités sociaux et économiques (CSE), habilité Expert CSE QUalité du Travail et de l'EMploi, Organisme de Formation Certifié. Afin d'enrichir le dialogue social, le droit social français permet aux représentants du personnel de se faire assister par des experts...
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Administrateur-trice Système DevOps
Il y a 4 mois
Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein78350 JOUY EN JOSAS _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...
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Stage en Marketing Produit
il y a 1 mois
Jouy-en-Josas, Île-de-France Eurial Ultra Frais Temps pleinStage Assistant Chef de Produit MarketingIntégré au sein d'une équipe dynamique, le stagiaire en tant qu'assistant chef de produit aura pour mission de soutenir le développement de la marque LES LAITIERS BIO et SOIGNON dans le secteur des produits ultra frais (yaourts, fromage blanc, desserts). Sous la supervision d'un chef de produit, vous serez amené...
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Chef D'équipe Ssiap 2
Il y a 3 mois
Jouy-en-Josas, France En Toute Securité ( ETS) Temps plein**EN TOUTE SÉCURITÉ (ETS)** société de gardiennage et de sécurité propose ses services sur Paris, Ile de France, les régions Hauts-De-France et la région Grand-Est. Nous nous engageons à afficher et offrir des services de qualité afin d’obtenir une réelle satisfaction par le biais de nos prestations. **MISSION** Dans le cadre de notre...
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Responsable administratif entreprise junior F/H
il y a 6 jours
Jouy-en-Josas, Île-de-France VINCI Energies en France Temps pleinMissionVINCI Facilities recherche un(e) futur(e) apprenti(e) Responsable Administratif Entreprise Junior F/H à Jouy en Josas (78).ObjectifsVous accompagnera le Responsable Administratif et Financier de la Société sur ses missions et vous serez en liaison directe avec les Responsables Administratifs Entreprises des 4 entreprises.Compétences...
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Responsable administratif entreprise junior F/H
il y a 1 semaine
Jouy-en-Josas, Île-de-France VINCI Energies en France Temps pleinMissionRejoignez VINCI Energies en France et découvrez l'opportunité de devenir Responsable administratif entreprise junior F/H à Jouy en Josas (78).ContexteVous rejoindrez l'équipe de VINCI Facilities, spécialisée dans le Facility Management, et travaillerez en étroite collaboration avec les Responsables administratifs et financiers de nos...
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Gestionnaire de Comptabilité Analytique
il y a 2 semaines
Jouy-en-Josas, Île-de-France VINCI Energies en France Temps plein**Mission VINCI Energies** VINCI Energies, un leader mondial dans le domaine de la gestion de la performance des bâtiments, recherche un(e) Responsable Administratif Entreprise Junior F/H pour rejoindre son équipe en France.**Rôle et responsabilités** Vous serez chargé(e) de la gestion de la comptabilité analytique et générale de l'entreprise, en...
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Alternance – Assistant Administratif Junior F/H
il y a 1 mois
Jouy-en-Josas, Île-de-France VINCI Energies en France Temps pleinPrésentation de VINCI FacilitiesVINCI Facilities, une entité de VINCI Energies, se spécialise dans le Facility Management (FM). Nous nous engageons à optimiser la performance des bâtiments sur le long terme, en proposant des solutions de FM personnalisées. Dans un secteur en pleine évolution, nos services allient maintenance technique, exploitation et...
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Alternance – Assistant Administratif Junior F/H
il y a 1 mois
Jouy-en-Josas, Île-de-France VINCI Energies en France Temps pleinPrésentation de VINCI FacilitiesVINCI Facilities, marque de VINCI Energies, se spécialise dans le Facility Management (FM). Nous nous engageons à optimiser la performance des bâtiments sur le long terme, en proposant des solutions de Facility Management personnalisées. Dans un secteur en pleine évolution, nos services intègrent maintenance technique,...
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Alternance – Assistant Administratif Junior F/H
il y a 1 mois
Jouy-en-Josas, Île-de-France VINCI Energies en France Temps pleinPrésentation de VINCI FacilitiesVINCI Facilities, une marque de VINCI Energies, se spécialise dans le Facility Management (FM). Nous nous engageons à optimiser la performance des bâtiments sur le long terme grâce à des solutions de gestion adaptées. Dans un secteur en pleine évolution, nos services intègrent maintenance technique, exploitation et...
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Jouy-en-Josas, France VINCI Energies en France Temps pleinVINCI Facilities est la marque de VINCI Energies dédiée au Facility Management (FM). VINCI Facilities accompagne la performance du bâtiment dans la durée, avec une offre de Facility Management sur mesure. Sur un marché en pleine transformation, nos solutions conjuguent maintenance technique, exploitation et services, et s’appuient sur une maîtrise...
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Professeur Apa
Il y a 4 mois
Jouy-en-Josas, France ASSOCIATION ARISSE - HOPITAL DE JOUR CTJ HENRI DUCHENE Temps pleinCDI à temps partiel. Poste à pouvoir à compter du 26 août 2024. **- LES MISSIONS QUI VOUS ATTENDENT**: Nous recherchons un professeur d’APA (Activité physique adaptée) pour compléter notre équipe pluridisciplinaire. Le CTJ Henri Duchêne (Hôpital de jour) cherche un Professeur d’APA à 0.5 ETP pour rejoindre son équipe pluridisciplinaire. En...
