Bioinformaticien-ne Au Sein Du Projet Ferments Du

Il y a 6 mois

JouyenJosas, France INRAE Temps plein

78350 _

**RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS**

**Présentation INRAE**:
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

**Environnement de travail, missions et activités**:
Sous le pilotage fonctionnel du responsable du projet Ferments du Futur, vous serez rattaché(e) administrativement à l’unité de recherche MaIAGE dans laquelle vous exercerez vos missions au sein de la plateforme bioinformatique Migale. Migale opère l’infrastructure informatique du projet Ferments du Futur et coordonne le développement informatique de l’entrepôt de données visant à rassembler toutes les informations sur les micro-organismes et les consortia microbiens pouvant intervenir dans la fermentation des aliments. Ces données sont de nature variée - omiques, phénotypiques, capacités métaboliques, etc. - et alimenteront les approches prédictives développées dans le projet pour la conception de nouveaux aliments fermentés. Cet entrepôt de données sera accompagné d’une interface conviviale permettant une intégration simple des données, une exploration fine des données par les biologistes et un requêtage efficace pour les algorithmes d’apprentissage.

Sous la responsabilité scientifique du responsable opérationnel de la plateforme Migale, vous serez principalement en charge de la mise en place des procédures d’analyses bioinformatiques standardisées proposées aux utilisateurs de l’entrepôt.

Vous travaillerez en étroite collaboration avec les deux développeurs de l’entrepôt et avec le _data steward_ en charge de la gestion et de la curation des données du projet. Vous aurez en charge de concevoir, tester et mettre à disposition les workflows d’analyse, de visualisation et de production de données secondaires de l’entrepôt.

Vos principales activités seront:

- Identifier les types d’analyses à mettre à disposition des utilisateurs de l’entrepôt.
- Choisir, adapter ou développer, puis appliquer les méthodes, outils et workflows d'analyses bioinformatiques sur des jeux de données publics, de test ou générés dans les projets de Ferments du Futur.
- Mettre à disposition ces workflows dans des interfaces accessibles à des utilisateurs non experts.
- Rédiger et mettre à niveau les documentations techniques et fonctionnelles concernant la mise à disposition de workflows au sein de l’entrepôt.
- Accompagner des développeurs extérieurs dans l’interfaçage de leurs workflows avec l’entrepôt.
- Participer à la conception et au développement des interfaces de mise à disposition des résultats.
- Participer à la conception et à la conduite des actions de formation à destination des utilisateurs des workflows proposés.

Vous serez amené-e à interagir régulièrement avec les groupes de travail autour des données qui centralisent les besoins en termes de gestion des données produites et traitées dans Ferments du Futur. Vous interagirez également avec les autres personnels Ferments du Futur au sein des unités de la plateforme distribuée et du centre d’innovation Ferments du Futur, sous la coordination du directeur des opérations et technologies Ferments du Futur.

Vous consacrerez environ 20% de votre temps sur des activités de la plateforme Migale_ _en lien avec vos compétences et affinités, afin de garantir une bonne articulation entre vos activités Ferments du Futur et votre équipe d’accueil. À ce titre, vous serez intégré dans le CATI BOOM et serez encouragé-e à participer aux réseaux métiers nationaux.

**Formations et compétences recherchées**:
**Master/Ingénieur (Bac+5)**

**Formation recommandée** : Master 2 en bioinformatique.

**Connaissances souhaitées**:

- Analyse bioinformatique de données omiques (principalement génomiques, transcriptomiques et métabolomiques) ; une expérience dans la reconstruction de voies métaboliques serait un plus.
- Maîtrise d’au moins un langage de programmation (Python, R).
- Connaissance d’un outil de gestion de pipelines (Snakemake, Nextflow).
- Maîtrise du français, de l’anglais (C1)

**Expérience appréciée**:

- Projets pluridisciplinaires si possible en biologie, microbiologie ou génomique
- Expérience de projet multi-omiques.
- Développement de composants ou workflows Galaxy

**Aptitudes recherchées**:

- Capacité à travailler en équipe, y compris à distance
- Sens de l’écou

  • Gestionnaire de Données Du Projet Ferments Du

    Il y a 6 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18...

  • Stage M1/m2

    il y a 1 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 JOUY-EN-JOSAS _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales,...

  • Stage de Master 2 en Bioinformatique

    Il y a 2 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 Jouy en Josas _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales,...

  • Gestionnaire Administratif-ve

    Il y a 5 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 JOUY EN JOSAS _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...

  • Assistant-e en Gestion Financière Et Administrative

    Il y a 6 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 JOUY-EN-JOSAS _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...

  • Administrateur-trice Système DevOps

    Il y a 6 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 JOUY EN JOSAS _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...

  • Chef de Projet R&D

    il y a 1 mois

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Eurial Ultra Frais Temps plein

    Responsable de Projets R&DAgrial recrute pour sa branche un Responsable de Projets R&D (H/F) qui sera rattaché au Responsable R&D au sein du service Innovation et Qualité.Les missions de ce poste peuvent être regroupées en 2 catégories principales :Formulation et process : le Responsable de Projets R&D pilote des projets de développement et...

  • Chef de Projet R&D

    il y a 4 semaines

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Eurial Ultra Frais Temps plein

    Responsable de Projets R&DAgrial recrute pour sa branche un Chef de Projet R&D (H/F) au sein du service Innovation et Qualité.Les missions du Responsable de Projets R&D peuvent être regroupées en 2 catégories principales :Formulation et process : Il pilote des projets de développement et d'amélioration de recettes (produit – process), depuis...

  • Chef de Projet R&D Laitier

    il y a 1 jour

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Eurial Ultra Frais Temps plein

    L'objectif principal est de piloter des projets de développement et d'amélioration de recettes (produit – process) à l'aide de compétences en gestion de projet.Ce poste consiste également à participer à des projets innovants pour le marché de l'ultra-frais laitier ou alternatif, étant donné que vous avez une expérience dans ce domaine.De plus,...

  • Chef de projet sécurité H/F

    il y a 2 semaines

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Consult EQ Temps plein

    Fonction Nous recrutons un Chef de projet sécurité H/F au sein de notre équipe de projet. Ce poste est chargé de la gestion et de la coordination des activités de sécurité du projet, en étroite collaboration avec les équipes de projet et les partenaires externes. Missions Identifier et analyser les risques de sécurité liés au projet et proposer...

  • Chargé-e D'ingénierie de Projets en Partenariat

    Il y a 6 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 JOUY EN JOSAS _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...

  • Chargé-e D’ingénierie de Projets en Partenariat

    Il y a 2 mois

    Jouy-en-Josas, France INRAE Temps plein

    78350 JOUY-EN-JOSAS _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales,...

  • Responsable de Projets R&D

    il y a 3 semaines

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Eurial Ultra Frais Temps plein

    Qui sommes-nous ?Eurial Ultra Frais, leader sur le marché de la MDD, recrute pour son équipe R&D un Responsable de Projet R&D. Notre marque « Soignon » est leader incontesté des yaourts au lait de chèvre, et « A bicyclette » propose des desserts végétaux gourmands.MissionsPiloter des projets de développement et d'amélioration de recettes (produit...

  • Chef de Rang Confirmé

    Il y a 3 mois

    Jouy-en-Josas, France RESTAURANT DU GOLF DE SAINT MARC Temps plein

    Dans un magnifique cadre verdoyant proche de Paris, le Restaurant du Golf de Saint Marc recrute son futur chef de rang, 39h. 2 jours de repos consécutifs en semaine, sans coupure et pas de service le soir. 2 ans à 3 ans minimum d'expérience demandé. Salaire entre 1700 et 1850 € net par mois. Motivé ayant de l'ambition et le sens du contact. Être...

  • Chef de rang H/F

    il y a 1 mois

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Restaurant du Golf de Saint Marc Temps plein

    MissionNous recherchons un chef de rang dynamique pour rejoindre notre équipe au Golf de Saint Marc. Vous serez chargé de la gestion de la salle et du bar, ainsi que de l'accueil et du service client.Compétences requisesVous devez avoir au moins 2 ans d'expérience dans un poste similaire et être capable de travailler de manière autonome. Vous devez...

  • Chef de rang H/F

    il y a 1 mois

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Restaurant du Golf de Saint Marc Temps plein

    Dans un cadre verdoyant, le Restaurant du Golf de Saint Marc recrute un responsable de service pour assurer la qualité de l'accueil et du service aux clients. 39h de travail, 2 jours de repos par semaine, sans coupure ni service le soir. Possibilité de véhicule.Vos missionsAccueillir les clients et les assister pendant leur séjourVos compétencesMinimum...

  • Chef de rang H/F

    il y a 2 semaines

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Restaurant du Golf de Saint Marc Temps plein

    Dans un cadre verdoyant, le Golf de Saint Marc recrute son futur chef de rang, 39h. 2 jours de repos, sans coupure et pas de service le soir. Être véhiculé.Vos missionsService en salle et barVos compétences2 ans à 3 ans minimum d'expérience demandéVous êtes souriant, dynamique et aimez le contact avec les clients

  • Chef de rang

    il y a 3 semaines

    Jouy-en-Josas, Île-de-France Restaurant du Golf de Saint Marc Temps plein

    Rejoignez l'équipe du Restaurant du Golf de Saint Marc en tant que chef de rang !MissionsFournir un service de qualité aux clients dans la salle et le bar.CompétencesMinimum 2 ans d'expérience dans un cadre similaire.Aimer le contact avec les clients et être souriant.Le restaurant est implanté dans un cadre naturel magnifique, avec une belle...

  • Chef de rang H/F

    Il y a 6 mois

    Jouy-en-Josas, France Restaurant du Golf de Saint Marc Temps plein

    Dans un cadre verdoyant, le Golf de Saint Marc recrute son futur chef de rang, 39h. 2 jours de repos, sans coupure et pas de service le soir. Être Véhiculé.Vos missionsService en salle et barVos compétences2 ans à 3 ans minimum d'expérience demandéVous êtes souriant, dynamique et aimez le contacte avec les clientsRestaurant sur un site naturel...

  • Chef de rang H/F

    Il y a 6 mois

    Jouy-en-Josas, France Restaurant du Golf de Saint Marc Temps plein

    Dans un cadre verdoyant, le Golf de Saint Marc recrute son futur chef de rang, 39h. 2 jours de repos, sans coupure et pas de service le soir. Être Véhiculé. Vos missions Service en salle et bar Vos compétences 2 ans à 3 ans minimum d'expérience demandé Vous êtes souriant, dynamique et aimez le contacte avec les clients