Post-doctorant (F/H) Modélisation de Biofilms

il y a 3 semaines

Talence, France Inria Temps plein

**Type de contrat **:CDD

**Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent

**Fonction **:Post-Doctorant

**Niveau d'expérience souhaité **:De 5 à 12 ans

**A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**:
Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et compte une vingtaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au cœur d'un riche écosystème de R&D et d’innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l’enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique

**Contexte et atouts du poste**:
**Dans le cadre d’un partenariat public** Inria et l'IFPEN nous étudions l'interaction entre le milieu lithique, les communautés microbiennes présentes et le dioxide de carbone dans les sites de stockage de carbone en grand profondeur. Ces interactions créé des **phénomènes biologiques**, bénéfiques ou délétères, qui peuvent jouer un rôle clé dans l'efficacité et la fiabilité du **capture en stockage de carbone** (CCS).

Nous proposons de **coupler deux codes existants** à l'IFPEN et chez Inria pour développer un cadre commun de simulation de ces phénomènes. L'IFPEN dispose de codes de modélisation phénoménologique de chimiolithotrophie sous forme de système dynamique autonome non linéaire couplé, permettant la prédiction de l'effet biologique et les transformations. Inria dispose de codes de modélisation mécanistique des échanges métaboliques de grandes communautés, permettant la prédiction du potentiel de formation de biofilms et l'activation de fonctions biologiques.

Le lieu de travail principal sera le centre Inria de l'Université de Bordeaux, and les locaux de l'équipe-projet Pleiade.

Des déplacements ponctuels entre Bordeaux, Toulouse et Reuil-Malmaison pourraient être nécessaires et les frais de ces déplacements seront pris en charge dans la limite du barème en vigueur.

**Mission confiée**:
Missions : Avec l'aide de David Sherman (Inria) et Arnaud Pujol (IFPEN), la personne recrutée sera amenée à coupler deux codes existants de simulation, numérique du système dynamique en chimiolithotrophie, et logique du potential d'interaction métabolique. Ce couplage permettrait, à partir de grandes collections de taxa identifiés par étude de la littérature ou par échantillonnage, et de spécifications nutritionnelles déduites de l'analyse géologique, d'identifier par déduction logique des **interactions métaboliques** entre espèces et les **fonctions biochimiques **potentiellement réalisables. Les phénomènes ainsi identifiés fourniront le point d'entrée de la **simulation numérique** et à **l'analyse de la sensibilité**. Ces résultats numérique fourniront à leur tour le moyen d'identifier des objectifs biologiques dont la formation de biofilms, que notre système de déduction logique pourrait utiliser pour générer des ensembles de **communautés mínimales** qui répondent aux objectifs.

Collaboration : La personne recrutée sera en lien avec des experts de l'IFPEN en modélisation phénoménologique en milieu géologiques, et avec des équipes-projet Inria en modélisation de système biologiques.

Responsabilités : La personne recrutée aura la charge d'un développement logiciel et adoptera les bonnes pratiques de l'équipe dont l'intégration continue et la réproductibilité.

**Principales activités**:
Principales activés:

- Développer des programmes informatiques de simulation numérique et logique
- Tester, aléliorer jusqu’à valider
- Réaliser des simulations
- Rédiger des rapports et des articles scientifiques

Activités complémentaires:

- Présenter l’avancée des travaux aux collègues partenaires
- Échanger avec des collaborateurs scientifiques
- Étudier la littérature scientifique

**Compétences**:
Compétences techniques : Une activité majeure dans ce travail est le développement de logiciels informatiques de modélisation et l'exécution de ces programmes sur des environnements de calcul Kubernetes et HPC. La personne recrutée doit être compétente en développement logiciel. Une connaissance des bonnes pratiques en génie logiciel _per se_ serait un plus mais l'équipe forme et promeut ces compétences chez tous ces membres.

Compétences relationnelles : La capacité de communiquer avec des collègues issus des sciences biologiques, chimiques et informatiques sera nécessaire, et la volonté d'écouter et d'apprendre de ces collègues sera une clé de succès.

**Avantages**:

- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et

  • Post-doctorant (F/H) Modèles équivalents Et

    Il y a 3 mois

    Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent **Fonction **:Post-Doctorant **Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplômé **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et compte une vingtaine d’équipes de...

  • Poste de Chercheur Postdoctoral

    il y a 1 semaine

    Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 3 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Poste de chercheur postdoctoral (H/F) en Biophysique Membranaire au LOMA - Université de Bordeaux** Référence : UMR5798-CHRGRA-003 Nombre de Postes :...

  • Poste de chercheur postdoctoral

    il y a 1 semaine

    Talence, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Poste de chercheur postdoctoral (H/F) en Biophysique Membranaire au LOMA - Université de Bordeaux Référence : UMR5798-CHRGRA-003 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TALENCE Date de publication : jeudi 12 septembre 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche...

  • Doctorant (F/H) Preuves de Stabilité Numériques

    Il y a 4 mois

    Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Autre diplôme apprécié **:Ingénieur ou master avec une composante forte en calcul scientifique **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et...

  • Poste de chercheur postdoctoral en Biophysique Membranaire

    il y a 5 jours

    Talence, Nouvelle-Aquitaine, France CNRS Temps plein

    Informations générales Titre de l'offre : Poste de chercheur postdoctoral en Biophysique Membranaire au LOMA - CNRS Nombre de postes : 1 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 12 mois Compétences requises : Le chercheur postdoctoral aura une thèse récente dans le domaine de la biophysique membranaire (compétences dans les...

  • Gestionnaire d'écoles doctorales F/H

    Il y a 2 mois

    Talence, France Université de Bordeaux Temps plein

    Employeur L’université de Bordeaux compte aujourd’hui parmi les plus influentes universités de recherche multidisciplinaires en France et dans le monde. Installée dans ses fondamentaux que sont la formation et la recherche et à travers son plan stratégique 2030 « Faire de notre modèle d’université un levier de nouveaux équilibres,...

  • Post-Doctorant F/H Postoctorant.e en Perception multisensorielle pour les Interactions Humain-Robot

    Il y a 3 mois

    Talence, France INRIA Temps plein

    Contexte et atouts du poste Le centre Inria de l’Université de Bordeaux est un établissement national de recherche publique en sciences et technologies du numérique situé à Talence (France). Il rassemble une vingtaine d’équipe de recherche en sciences numériques, informatiques, mathématiques, robotique, avec différents partenaires...

  • Ingénieur Modélisation

    Il y a 2 mois

    Talence, France TOTAL ENERGIES Temps plein

    Poste : La division Energy Storage System (ESS) de Saft renforce la capacité de l'entreprise à servir le marché mondial du stockage d'énergie et à accompagner la transition vers les énergies renouvelables.En tant que collaborateur de la division ESS, l'Ingénieur Modélisation & Simulation aura les responsabilités suivantes...

  • Ingénieur Modélisation

    il y a 7 jours

    Talence, France TOTAL ENERGIES Temps plein

    Poste : La division Energy Storage System (ESS) de Saft renforce la capacité de l'entreprise à servir le marché mondial du stockage d'énergie et à accompagner la transition vers les énergies renouvelables.En tant que collaborateur de la division ESS, l'Ingénieur Modélisation & Simulation aura les responsabilités suivantes...

  • Doctorant H/F

    Il y a 2 mois

    Talence, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant H/F : Etude théorique et expérimentale des interactions nucléaires pilotées par laser Référence : UMR5107-SOPHEU0-058 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TALENCE Date de publication : jeudi 11 juillet 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois...

  • Ingénieur analyses chimiques F/H

    il y a 1 mois

    Talence, France Université de Bordeaux Temps plein

    Employeur L’université de Bordeaux est une grande université dynamique, responsable, attentive au bien-être de ses personnels. La rejoindre, c’est travailler dans un cadre privilégié au sein d’une communauté professionnelle particulièrement diverse et ouverte, en bénéficiant de dispositifs d’accueil et d’inclusion, de formation et de...

  • Ingénieur en analyses chimiques spécialisé en RMN

    il y a 4 semaines

    Talence, Nouvelle-Aquitaine, France Université de Bordeaux Temps plein

    Employeur L'université de Bordeaux se distingue par son dynamisme et son engagement envers le bien-être de ses employés. Travailler ici, c'est intégrer une communauté professionnelle variée et accueillante, bénéficiant de programmes d'accueil, de formation et de mobilité interne. C'est également participer à une aventure académique et...

  • Ingénieur en analyses chimiques spécialisé en RMN

    il y a 4 semaines

    Talence, Nouvelle-Aquitaine, France Université de Bordeaux Temps plein

    Employeur L'université de Bordeaux est une institution académique dynamique, engagée envers le bien-être de ses employés. Travailler ici, c'est évoluer dans un environnement privilégié au sein d'une communauté professionnelle riche et diversifiée, bénéficiant de dispositifs d'accueil, d'inclusion, de formation et de mobilité interne. C'est...

  • Ingénieur en analyses chimiques spécialisé en RMN

    il y a 4 semaines

    Talence, Nouvelle-Aquitaine, France Université de Bordeaux Temps plein

    Employeur L'université de Bordeaux se distingue par son dynamisme et son engagement envers le bien-être de ses collaborateurs. Travailler ici, c'est intégrer une communauté professionnelle riche et variée, tout en bénéficiant de programmes d'accueil, d'inclusion, de formation et de mobilité interne. C'est s'impliquer dans une aventure...

  • Collective Levito

    il y a 2 semaines

    Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 2 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Dynamique de particules anisotropes en lévitation optique (H/F)** Référence : UMR5798-MATPER-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...

  • Dynamique de particules anisotropes en lévitation optique

    il y a 1 semaine

    Talence, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Dynamique de particules anisotropes en lévitation optique (H/F) Référence : UMR5798-MATPER-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TALENCE Date de publication : mercredi 11 septembre 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 30 novembre 2024...

  • Stage en modélisation biologique

    il y a 4 semaines

    Talence, Nouvelle-Aquitaine, France INRIA Temps plein

    Contexte et avantages du poste Dans le cadre d'une collaboration avec INRAE, le projet COMIC vise à développer des modèles du métabolisme de souches de cyanobactéries ainsi que de leurs communautés bactériennes associées. Les proliférations de cyanobactéries représentent un enjeu mondial en raison de leurs effets néfastes sur l'écologie,...

  • Ingénieur (F/H) : Développement Interaction

    Il y a 3 mois

    Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Ingénieur scientifique contractuel **Contexte et atouts du poste**: Bivwac [1] est une équipe de recherche commune entre Inria, le CNRS, et l’Université de Bordeaux. Nous sommes spécialisés dans les domaines de l’Interaction Humain-Machine, la...

  • Chercheur Postdoctoral en Codes Correcteurs

    Il y a 3 mois

    Talence, France Institut d'Optique Graduate School Temps plein

    L’Institut d'Optique (IOGS) est un établissement privé d’enseignement supérieur et de recherche, établissement composante de l’université Paris-Saclay. L’Institut d’Optique a pour ambition de réunir dans un même établissement l’ensemble des activités liées à la photonique : recherche, formation, innovation, création d’entreprises,...

  • Doctorant F/H Scalable tensor algebra on top of runtime system

    Il y a 3 mois

    Talence, France INRIA Temps plein

    Contexte et atouts du poste Dans le cadre du projet ciblé Exasoft du PEPR NumPEx ( Mission confiée Missions : Avec l'aide de l'équipe TOPAL, la personne recrutée sera amenée à travailler sur la bibliothèque d'algèbre linéaire dense Chameleon pour voir étudier l'extension des travaux existants en algèbre linaire dense aux...