Post-doctorant (F/H) Modélisation de Biofilms

Il y a 4 mois


Talence, France Inria Temps plein

**Type de contrat **:CDD

**Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent

**Fonction **:Post-Doctorant

**Niveau d'expérience souhaité **:De 5 à 12 ans

**A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**:
Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et compte une vingtaine d’équipes de recherche. Le centre Inria est un acteur majeur et reconnu dans le domaine des sciences numériques. Il est au cœur d'un riche écosystème de R&D et d’innovation : PME fortement innovantes, grands groupes industriels, pôles de compétitivité, acteurs de la recherche et de l’enseignement supérieur, laboratoires d'excellence, institut de recherche technologique

**Contexte et atouts du poste**:
**Dans le cadre d’un partenariat public** Inria et l'IFPEN nous étudions l'interaction entre le milieu lithique, les communautés microbiennes présentes et le dioxide de carbone dans les sites de stockage de carbone en grand profondeur. Ces interactions créé des **phénomènes biologiques**, bénéfiques ou délétères, qui peuvent jouer un rôle clé dans l'efficacité et la fiabilité du **capture en stockage de carbone** (CCS).

Nous proposons de **coupler deux codes existants** à l'IFPEN et chez Inria pour développer un cadre commun de simulation de ces phénomènes. L'IFPEN dispose de codes de modélisation phénoménologique de chimiolithotrophie sous forme de système dynamique autonome non linéaire couplé, permettant la prédiction de l'effet biologique et les transformations. Inria dispose de codes de modélisation mécanistique des échanges métaboliques de grandes communautés, permettant la prédiction du potentiel de formation de biofilms et l'activation de fonctions biologiques.

Le lieu de travail principal sera le centre Inria de l'Université de Bordeaux, and les locaux de l'équipe-projet Pleiade.

Des déplacements ponctuels entre Bordeaux, Toulouse et Reuil-Malmaison pourraient être nécessaires et les frais de ces déplacements seront pris en charge dans la limite du barème en vigueur.

**Mission confiée**:
Missions : Avec l'aide de David Sherman (Inria) et Arnaud Pujol (IFPEN), la personne recrutée sera amenée à coupler deux codes existants de simulation, numérique du système dynamique en chimiolithotrophie, et logique du potential d'interaction métabolique. Ce couplage permettrait, à partir de grandes collections de taxa identifiés par étude de la littérature ou par échantillonnage, et de spécifications nutritionnelles déduites de l'analyse géologique, d'identifier par déduction logique des **interactions métaboliques** entre espèces et les **fonctions biochimiques **potentiellement réalisables. Les phénomènes ainsi identifiés fourniront le point d'entrée de la **simulation numérique** et à **l'analyse de la sensibilité**. Ces résultats numérique fourniront à leur tour le moyen d'identifier des objectifs biologiques dont la formation de biofilms, que notre système de déduction logique pourrait utiliser pour générer des ensembles de **communautés mínimales** qui répondent aux objectifs.

Collaboration : La personne recrutée sera en lien avec des experts de l'IFPEN en modélisation phénoménologique en milieu géologiques, et avec des équipes-projet Inria en modélisation de système biologiques.

Responsabilités : La personne recrutée aura la charge d'un développement logiciel et adoptera les bonnes pratiques de l'équipe dont l'intégration continue et la réproductibilité.

**Principales activités**:
Principales activés:

- Développer des programmes informatiques de simulation numérique et logique
- Tester, aléliorer jusqu’à valider
- Réaliser des simulations
- Rédiger des rapports et des articles scientifiques

Activités complémentaires:

- Présenter l’avancée des travaux aux collègues partenaires
- Échanger avec des collaborateurs scientifiques
- Étudier la littérature scientifique

**Compétences**:
Compétences techniques : Une activité majeure dans ce travail est le développement de logiciels informatiques de modélisation et l'exécution de ces programmes sur des environnements de calcul Kubernetes et HPC. La personne recrutée doit être compétente en développement logiciel. Une connaissance des bonnes pratiques en génie logiciel _per se_ serait un plus mais l'équipe forme et promeut ces compétences chez tous ces membres.

Compétences relationnelles : La capacité de communiquer avec des collègues issus des sciences biologiques, chimiques et informatiques sera nécessaire, et la volonté d'écouter et d'apprendre de ces collègues sera une clé de succès.

**Avantages**:

- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail et



  • Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent **Fonction **:Post-Doctorant **Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplômé **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et compte une vingtaine d’équipes de...

  • Post Doctorant

    il y a 2 semaines


    Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 13 janvier 2025 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre**:Post Doctorant (H/F) : Simulations Monte-Carlo de la propagation de rayons X et de neutrons générés par interaction laser-plasma à travers des...

  • Post Doctorant

    il y a 2 semaines


    Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 10 janvier 2025 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre**:Post Doctorant (H/F) : Étude numérique de l’interaction laser-plasma dans le concept StarDriver de fusion par confinement inertiel** Référence :...

  • Post Doctorant

    il y a 2 semaines


    Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 10 janvier 2025 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre**:Post Doctorant (H/F) : Simulations hydrodynamiques pour accompagner les expériences de FCI** Référence : UMR5107-SOPHEU0-064 Nombre de Postes :...


  • Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 3 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Poste de chercheur postdoctoral (H/F) en Biophysique Membranaire au LOMA - Université de Bordeaux** Référence : UMR5798-CHRGRA-003 Nombre de Postes :...


  • Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent **Fonction **:Post-Doctorant **Niveau d'expérience souhaité **:De 3 à 5 ans **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et compte une vingtaine d’équipes de recherche....


  • Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Contrat renouvelable **:Oui **Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent **Fonction **:Post-Doctorant **Niveau d'expérience souhaité **:Jeune diplômé **Contexte et atouts du poste**: Bivwac est une équipe-projet commune entre Inria et le CNRS, en lien avec le LaBRI (UMR CNRS - université de Bordeaux - Bordeaux...


  • Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Autre diplôme apprécié **:Ingénieur ou master avec une composante forte en calcul scientifique **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres d’Inria en France et...


  • Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: At the frontier between integrative and computational neuroscience, we propose to model the brain as a system of active memories in synergy and in interaction with the internal and external world...


  • Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat**: CDD **Niveau de diplôme exigé**: Thèse ou équivalent **Autre diplôme apprécié**: Doctorat en Informatique spécialisé en Informatique Graphique ou Vision par ordinateur **Fonction**: Post-Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: Le centre Inria de l’université de Bordeaux est un des neuf centres...


  • Talence, France KEDGE BS Temps plein

    Nous recrutons au sein du CESIT, **un Post-Doctorant en Supply Chain Aéronautique, **sur un contrat à durée déterminée, du 21 octobre 2024 au 21 octobre 2025. Cette mission de recherche s’inscrira dans le cadre d’un projet scientifique de la Supply Chain Intégrée (SUCHI) au sein d’un consortium multi-acteurs porté par Airbus Atlantic. Les...

  • Collective Levito

    Il y a 4 mois


    Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 2 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Dynamique de particules anisotropes en lévitation optique (H/F)** Référence : UMR5798-MATPER-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...

  • Modele Intermarche

    il y a 6 jours


    Talence, France Intermarché Temps plein

    Description de l'entreprise Rejoindre le Groupement Les Mousquetaires, c’est intégrer un acteur majeur de la grande distribution avec 7 enseignes. C’est aussi évoluer au sein d’un groupe singulier, présent sur 3 marchés (alimentaire, bricolage, mobilité), qui réunit 150 000 collaborateurs et compte plus de 3 000 chefs d’entreprise...

  • Modele Intermarche

    il y a 20 heures


    Talence, France Intermarché Temps plein

    Description de l'entreprise Rejoindre le Groupement Les Mousquetaires, c’est intégrer un acteur majeur de la grande distribution avec 7 enseignes. C’est aussi évoluer au sein d’un groupe singulier, présent sur 3 marchés (alimentaire, bricolage, mobilité), qui réunit 150 000 collaborateurs et compte plus de 3 000 chefs d’entreprise...


  • Talence, France Inria Temps plein

    **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Bac + 5 ou équivalent **Fonction **:Ingénieur scientifique contractuel **Contexte et atouts du poste**: Bivwac [1] est une équipe de recherche commune entre Inria, le CNRS, et l’Université de Bordeaux. Nous sommes spécialisés dans les domaines de l’Interaction Humain-Machine, la...


  • Talence, France Institut d'Optique Graduate School Temps plein

    L’Institut d'Optique (IOGS) est un établissement privé d’enseignement supérieur et de recherche, établissement composante de l’université Paris-Saclay. L’Institut d’Optique a pour ambition de réunir dans un même établissement l’ensemble des activités liées à la photonique : recherche, formation, innovation, création d’entreprises,...


  • Talence, France IRT Saint Exupéry Temps plein

    L’Institut de Recherche Technologique (IRT) Saint Exupéry est un accélérateur de science, de recherche technologique et de transfert vers les industries de l’aéronautique et du spatial pour le développement de solutions innovantes sûres, robustes, certifiables et durables. Nous proposons sur nos sites de Toulouse, Bordeaux, Sophia Antipolis et...


  • Talence, France CENTRE HOSPITALIER UNIVERSITAIRE DE BORDEAUX Temps plein

    **Description entreprise**: Situé dans une ville attractive, proche du bassin d’Arcachon et des Pyrénées, premier employeur de Nouvelle-Aquitaine, classé parmi les premiers au classement des CHU de France, le Centre hospitalier universitaire de Bordeaux assure ses missions de soin, de recherche, d’enseignement et de prévention au bénéfice de la...


  • Talence, France Inria Temps plein

    Le descriptif de l’offre ci-dessous est en Anglais_ **Type de contrat **:CDD **Niveau de diplôme exigé **:Thèse ou équivalent **Fonction **:Post-Doctorant **A propos du centre ou de la direction fonctionnelle**: The Inria center at the University of Bordeaux is one of the nine Inria centers in France and has about twenty research teams.. The Inria...

  • Post-doctorant.e (H/F)

    Il y a 3 mois


    Talence, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 11 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-Doctorant.e (H/F) en théorie de la matière condensée** Référence : UMR5798-JERCAY-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : TALENCE Date de...