Modélisation Physique de La Respiration

il y a 1 mois


Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

**Modélisation physique de la respiration bactérienne et du transfert de charge // Physical modelling of bacterial respiration and charge transfer**:

- Réf
- **ABG-115287**

**ADUM-50512**
- Sujet de Thèse- 16/06/2023- Autre financement public- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier Cedex 5 - France- Intitulé du sujet- Modélisation physique de la respiration bactérienne et du transfert de charge // Physical modelling of bacterial respiration and charge transfer- Mots clés- physique statistique, physique des processus stochastiques, biophysique, simulations numériques, Bio-énergétique et transfer de charge transmembranaire, biophysique procaryote
- Statistical Physics, Physics of stochastic processes, Biophysics, Numerical simulations, Bio-energetics and transmembrane charge transfer, Prokaryotic biophysics**Description du sujet**:

- La conversion d'énergie dans la plupart des systèmes bactériens implique l'utilisation d'un gradient électrochimique transmembranaire. Ce gradient est maintenu en conditions hors équilibre thermodynamique par l'activité de protéines membranaires de transport de protons reliées par des navettes électroniques lipidiques, les quinones, éléments clé du transport de chargé lié au processus de phosphorylation oxydative (OXPHOS). Ce processus alimente ainsi le gradient de charge qui pilote l'activité de moteurs rotatifs transmembranaires comme la F1-Fo-ATP-synthase ou le moteur flagellaire bactérien, machines fondamentales pour la vie de la bactérie.
- Ce projet de physique théorique inspirée par les systèmes biologiques a pour objectif de:

- 1) construire un modèle physique de respiration bactérienne issus de la physique statistique et de la théorie des processus stochastiques afin de comprendre les principes physiques de l'organisation spatiale (et notamment l'origine des phénomènes de séparation de phase en nanodomaines et leur réseau) et la dynamique de ces complexes, les OXPHOS, sur la membrane bactérienne;
- 2) comprendre comme l'organisation spatio-temporelle des complexes OXPHOS et la dynamique des quinones influencent la réactivité de ces complexes (étude de la réactivité des quinones en fonction de l'organisation des OXPHOS) et permettent la mise en place du gradient électrochimique transmembranaire (e.g. distribution organisée en domaines vs. éparpillées des réseaux de sources et puits de charges).
- 3) révéler l'importance fonctionnelle d'une telle organisation spatio-temporelle dans la biophysique du transfert de charge transmembranaire à l'échelle de la bactérie unique et d'une population de bactéries. Cela en particulier afin de comprendre le fonctionnement des OXPHOS dans la respiration des nitrates. Pour cet objectif, nous croiserons la modélisation physico-mathématique du transfert d'électrons à la membrane bactérienne, entre les complexes OXPHOS via les quinones, avec les données obtenues par des approches de microscopie de fluorescence à haute résolution spatiale et temporelle et des données du métabolisme bactérien (coll. A. Magalon et D. Marguet, Marseille).
- Les méthodes théoriques employés feront largement appel à la physique statistique, la théorie des processus stochastiques et aussi à la simulation/calculs numériques.
Energy conversion in most bacterial systems involves the use of a transmembrane electrochemical gradient. This gradient is maintained in non-equilibrium thermodynamic conditions by the activity of membrane proton transport proteins linked by lipid electron shuttles, the quinones, which are key elements of charge transport linked to the oxidative phosphorylation process (OXPHOS). This process feeds the charge gradient that drives the activity of transmembrane rotary motors such as F1-Fo-ATP-synthase or the bacterial flagellar motor, fundamental machines for the life of the bacteria.
- This project of theoretical physics inspired by biological systems aims to:

- 1) build a physical model of bacterial respiration from statistical physics and stochastic process theory in order to understand the physical principles of spatial organization (and in particular the origin of phase separation phenomena in nanodomains and their network) and the dynamics of these complexes, the OXPHOS, on the bacterial membrane;
- 2) understand how the spatial and temporal organization of OXPHOS complexes and the dynamics of quinones influence the reactivity of these complexes (study of the reactivity of quinones as a function of the organization of OXPHOS) and allow the establishment of the transmembrane electrochemical gradient (e.g. organized vs. scattered distribution of charge sources and sinks networks);
- 3) reveal the functional importance of such a spatio-temporal organization in the biophysics of transmembrane charge transfer at the scale of the single bacterium and of a population of bacteria. In particular, this will help us to understand the function of OXPHOS in nit



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    **Intégration de données et de modèles pour de la morphogénèse prédictive quantitative // Data and models integration predictive computational morphogenesis**: - Réf **ABG-122162** **ADUM-55903** - Sujet de Thèse- 03/04/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier cedex 5 - France- Intitulé du sujet- Intégration...


  • Montpellier, France PhyMedExp InsermU1046CNRS9214 Temps plein

    **VERS LA MISE EN PLACE D’UN MODÈLE CELLULAIRE HUMAIN MIMANT LA DYSFONCTION DIAPHRAGMATIQUE INDUITE PAR LA VENTILATION MÉCANIQUE**: - Réf **ABG-122979** - Sujet de Thèse- 30/04/2024- Autre financement privé- PhyMedExp InsermU1046/CNRS9214- Lieu de travail- Montpellier - Occitanie - France- Intitulé du sujet- VERS LA MISE EN PLACE D’UN MODÈLE...


  • Montpellier, France CEA Temps plein

    Description du poste **Domaine**: - Physique du noyau, atome, molécule **Contrat**: - Stage **Intitulé de l'offre**: - Modélisation des électrons découplés dans WEST H/F **Sujet de stage**: - Modélisation des électrons découplés dans WEST **Durée du contrat (en mois)**: - 6 mois **Description de l'offre**: - Les électrons découplés...


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    **Analyse de modèles d'écoulements multiphasiques // Analysis of multiphase flow models**: - Réf **ABG-122072** **ADUM-55913** - Sujet de Thèse- 30/03/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- MONTPELLIER CEDEX 5 - France- Intitulé du sujet- Analyse de modèles d'écoulements multiphasiques // Analysis of multiphase flow...


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    **Quantifications généralisées: preuves, modèles et expression en langage naturel // Generalized quantifications: proofs, models and expression in natural language**: - Réf **ABG-122063** **ADUM-55856** - Sujet de Thèse- 30/03/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier cedex 5 - France- Intitulé du sujet-...


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    **MODELISATION PROCEDURALE 3D DE LA CROISSANCE OSSEUSE DE LA TETE // 3D PROCEDURAL MODELING OF THE HEAD BONE GROWTH**: - Réf **ABG-122000** **ADUM-55814** - Sujet de Thèse- 29/03/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier cedex 5 - France- Intitulé du sujet- MODELISATION PROCEDURALE 3D DE LA CROISSANCE OSSEUSE DE LA...


  • Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

    **Modélisation couplant hydrodynamique et transport d'embâcles lors d'inondations // Coupled hydrodynamic and debris flow modeling during floods**: - Réf - **ABG-112711** **ADUM-46794** - Sujet de Thèse- 31/03/2023- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier cedex 5 - France- Intitulé du sujet- Modélisation couplant hydrodynamique et...


  • Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

    **MODÉLISATION COUPLANT HYDRODYNAMIQUE ET TRANSPORT D'EMBÂCLES LORS D'INONDATIONS // COUPLED HYDRODYNAMIC AND DEBRIS FLOW MODELING DURING FLOODS**: - Réf - **ABG-112653** **ADUM-47993** - Sujet de Thèse- 30/03/2023- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- MONTPELLIER CEDEX 5 - France- Intitulé du sujet- MODÉLISATION COUPLANT...


  • Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

    **Bio-impression in-situ robotisée avec compensation des mouvements physiologiques // Robotized in-situ bioprinting with physiological motion compensation**: - Réf - **ABG-112648** **ADUM-46576** - Sujet de Thèse- 30/03/2023- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier cedex 5 - France- Intitulé du sujet- Bio-impression...


  • Montpellier, France CEA Temps plein

    Description du poste **Domaine**: - Chimie **Contrat**: - Post-doctorat **Intitulé de l'offre**: - Post-doctorat en chimie théorique et modélisation H/F **Sujet de stage**: - Le projet ECCLOR (dEContamination et destruCtion de Liquides Organiques Radioactifs) vise à traiter les effluents organiques radioactifs sans solution de décontamination...


  • Montpellier, France Régie des Eaux de Montpellier Méditerranée Métropole Temps plein

    Régie des Eaux de Montpellier Méditerranée Métropole - Missions: - Suivre la construction des modèles de réseaux d'eau potable ou d'eaux usées - assurer leur actualisation permanente - réaliser des simulations à partir des modèles ; - Participer aux études, aux schémas de desserte et aux schémas directeurs d'alimentation en eau potable et de...

  • Chercheur Post-doctoral

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    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: Date Limite Candidature : mardi 1 août 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur Post-doctoral (H/F): Physique de la formation des biofilms bactériens** Référence : UMR5048-FLOLEP-061 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : mardi 11...


  • Montpellier, France Groupement Hospitalier Portes de Provence Temps plein

    Publié le 04/05/2023 26200 Montélimar CDD **A propos de Nous**: Le Groupement Hospitalier Portes de Provence est un établissement public de santé, du GHT Drôme-Ardèche Vivarais. Il est situé à Montélimar (26) et composé de services MCO et de 3 EHPAD. De nombreuses spécialités sont en cours de développement ou de renforcement. L’établissement...


  • Montpellier, France Centre Hospitalier de Bagnols-sur-Cèze Temps plein

    **Détails de l’offre**: **POSTE PROPOSÉ** Professeur d'Activité Physique Adaptée H/F **CONTRAT** CDD **DESCRIPTIF** Dans le cadre d'un remplacement longue durée, le CH de Bagnols sur Cèze recrute un Enseignant Activité Physique Adaptée H/ F pour un CDD renouvelable d'une durée de 6 mois. **PERSONNE À CONTACTER** **ETABLISSEMENT** Centre...


  • Montpellier, France Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire Temps plein

    Descriptif du poste En tant que spécialiste en science des données, vous aurez quatre missions principales: - exploiter les informations contenues dans les bases expérimentales disponibles - développer des modèles par assimilation de données issues de campagnes - développer des métamodèles rapides en investiguant les solutions les plus adaptées...


  • Montpellier, France Université de Montpellier Temps plein

    **Nouvelles particules légères: théorie et phénoménologie // Light new particles: theory and phenomenology**: - Réf **ABG-122050** **ADUM-54852** - Sujet de Thèse- 30/03/2024- Contrat doctoral- Université de Montpellier- Lieu de travail- Montpellier Cedex 5 - France- Intitulé du sujet- Nouvelles particules légères: théorie et phénoménologie //...


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    L’Agence régionale de Santé (ARS) Centre-Val de Loire définit et pilote la politique régionale de santé en mobilisant les partenaires de la région. Son action vise à promouvoir la qualité et la sécurité des soins et à garantir l’adaptation territoriale de la réponse aux besoins de la population.Objectifs du poste : Le chef de projet contribue...


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    Tu es à la recherche d'un job dynamique et stimulant dans une entreprise en pleine expansion ? Ne cherche plus, nous avons exactement ce qu'il te faut ! La Casa de las Carcasas est à la recherche de plusieurs Vendeurs (H/F) pour notre boutique dans le centre commercial POLYGONE à BEZIERS (34) Ce que tu vas faire: - Accueillir le client et être à...


  • Montpellier, France LA CASA DE LAS CARCASAS Temps plein

    La Casa de las Carcasas est une multinationale leader dans le secteur de la vente d'accessoires pour appareils mobiles. D'un site de vente en ligne à plus de 700 boutiques physiques dans 8 pays (Espagne, Portugal, Italie, France, Mexique, Pologne, Roumanie et Chili), nous avons su nous développer et relever tous les défis. Notre présence à...

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