Doctorant(E) en Microbiologie

il y a 1 semaine


Lyon, France Cybèle Agrocare Temps plein

**Type de contrat**: Autre

**Lieu**: Lyon

**Formation souhaitée**: Ingénieur/Master

**Date d'embauche souhaitée**: 2024

**Description des missions**: Projet de thèse

Les microorganismes rhizosphériques phytobénéfiques colonisent les racines des plantes, améliorant leur nutrition, leur architecture racinaire, et leur résistance aux stress climatiques. Cependant, leur efficacité en conditions réelles varie en fonction de facteurs environnementaux et pratiques agricoles. Pour maximiser leurs effets, les travaux de thèse se proposent d’apporter des solutions pour maximiser la viabilité, la multiplication, et l’activité métabolique de fonctions phytobénéfiques d’un microorganisme d’intérêt. L'objectif est d'optimiser les bénéfices de cette souche pour une agriculture durable dans un contexte de réduction des intrants minéraux en grandes cultures, et ce avec une reproductibilité maximale.

L’enjeu est une réduction maximale de l'utilisation d'engrais minéraux au champ. L'objectif principal du projet de thèse est d’optimiser les conditions de cultures et formules influençant le microorganisme phytobénéfique pour maximiser ses effets au champ. Trois échelles de travail ont été définies afin d’atteindre cet objectif:

- In vitro, définir l’impact des différents activateurs pré- ou post-fermentation ciblés sur la multiplication d’une part, et activités phytobénéfiques d’autre part (fixation d’azote, production d’hormones, solubilisation d’éléments du sol) du microorganisme d’intérêt
- En conditions semi-contrôlées (serre) et sous apports azotés réduits, étudier l’effet des formules sélectionnées en partie 1) sur les marqueurs agronomiques de plantes d’intérêt (implantation, photosynthèse, indice de chlorophylle, morphologie racinaire, entre autres) et sur des étapes clés du cycle de l’azote dans le sol

En champ, et sous différents itinéraires techniques (rotations culturales, types de sol, fertilisation) et localisations, évaluer l’efficacité agronomique des deux meilleures biosolutions découlant de l’axe 2, leur impact sur les communautés bactériennes et fonctions phytobénéfiques et caractériser leur efficacité dans les services environnementaux, notamment production de NO2.

Profil recherché
- Le profil recherché est un(e) étudiant(e) sortant d’un Master 2 ou Ecole d’Ingénieur en agronomie, biotechnologies, microbiologie ayant des compétences solides en physiologie végétale, microbiologie, conduite d’essais en serre et analyses statistiques de données.

Compétences requises:

- Capacité à travailler de façon autonome et rigoureuse
- Maîtrise des techniques microbiologiques de culture in vitro, identification et méthodes de quantification de la croissance microbienne Connaissance des étapes clés du cycle de l'azote dans le sol et des outils notamment moléculaires (qPCR, RT-qPCR) qui permettront d’étudier l’impact des biosolutions sur les dynamiques de l'azote
- Compréhension des préconisations agronomiques (itinéraires techniques) et des méthodes de mesures en conditions semi-contrôlées et en champ
- Expérience dans l'utilisation de méthodes analytiques telles que la chromatographie, la spectrophotométrie
- Appétence dans l’évaluation des services environnementaux, notamment production de gaz à effet de serre (NO2), et capacité à interpréter les impacts environnementaux des pratiques agricoles
- Compétences en analyse statistique pour interpréter les résultats expérimentaux et en tirer des conclusions sur l'impact des activateurs sur les activités phytobénéfiques
- Bonne capacité à communiquer tant à l’oral qu’à l’écrit, de manière scientifique et adaptée à l’interlocuteur
- Maitrise de l'anglais scientifique.
- La compréhension de la conduite d'expériences en serre et en champ et la collecte de données agronomiques est un plus.

**Compétences demandées**:

- Techniques
- Scientifiques
- Production

**Adhérent VEGEPOLYS VALLEY**: Oui



  • Greater Lyon Area, France Cybele Agrocare Temps plein

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  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France NAMSA Temps plein

    Description du poste Qui sommes-nous ? NAMSA est un acteur majeur en Europe dans le domaine du conseil et de l'évaluation des dispositifs médicaux ainsi que des biotechnologies associées. Qui recherchons-nous ? Nous sommes à la recherche d'un(e) Technicien(ne) en Microbiologie. Quelles seront vos responsabilités ? En intégrant...


  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France NAMSA Temps plein

    Description du poste : Qui sommes-nous ? NAMSA est un acteur majeur en Europe dans le domaine du conseil et de l'évaluation des dispositifs médicaux ainsi que des biotechnologies. Qui recherchons-nous ? Nous sommes à la recherche d'un(e) Technicien(ne) en Microbiologie. Quelles seront vos responsabilités ? En intégrant notre équipe de...


  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France NAMSA Temps plein

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  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

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  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Description du posteLe CNRS recherche un(e) doctorant(e) pour rejoindre l'équipe de recherche en biologie moléculaire et biologie structurale au sein de l'unité « Microbiologie Moléculaire et Biochimie Structurale » (MMSB).Contexte de travailLe/la candidat(e) travaillera dans un environnement de recherche dynamique et interdisciplinaire, en...


  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Société Française de Microbiologie Temps plein

    Détails de l'offreProjet de rechercheL'offre est liée à un projet de recherche financé par l'ANR (agence nationale de la recherche – France) s'inscrivant dans les domaines de la « santé unique » (One Health), et de la microbiologie urbaine, notamment l'étude de la dissémination d'agents pathogènes bactériens en...


  • Lyon, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Doctorant (H/F) – Expression génétique reprogrammée dans la nouvelle cellule hôte lors de la conjugaison bactérienne Référence : UMR5086-CHRLES-006 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : LYON 07 Date de publication : vendredi 30 août 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée...


  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Offre de posteInformations généralesTitre de l'offre : Doctorat en biologie structurale/cellulaire H/FType de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoralDurée du contrat : 36 moisQuotité de travail : Temps completRémunération : 2135,00 € bruts mensuelsSection(s) CN : Biologie moléculaire et structurale, biochimieDescription du posteContexte de...


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  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France Caduceum Temps plein

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  • Biologiste Médical

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    Lyon, France UNIBIO Temps plein

    Biologiste médical — H/F Chasse sur Rhône En complément de son développement, UNIBIO souhaite poursuivre son modèle indépendant en recrutant un pharmacien ou médecin biologiste médical (H/F) pour exercer sur le nouveau plateau technique de microbiologie de Chasse sur Rhône (Sud de Lyon). **VOS MISSIONS**: Temps plein en microbiologie -...


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  • Lyon, Rhône, France Caduceum Temps plein

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  • Lyon, France Caduceum Temps plein

    La SociétéCaduceum, la solution Life Sciences du groupe ALTEN, est une société de conseils 100% dédiée aux industries de Santé. De la conception du produit à sa mise sur le marché, nos équipes accompagnent les industriels des secteurs pharmaceutiques, dispositifs médicaux, biotechnologiques et cosmétiques, dans tous leurs projets d’innovation...


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  • Lyon, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

    Contexte de l'offre Le Laboratoire de Microbiologie Moléculaire et Biochimie Structurale (MMSB) de Lyon est une unité de recherche multidisciplinaire pilotée par le CNRS et l'Université de Lyon qui a pour vocation de comprendre, à l'échelle moléculaire et cellulaire, comment les micro-organismes pathogènes se multiplient et engendrent...

  • Assistant-e Ingénieur

    il y a 1 mois


    Lyon, France CNRS Temps plein

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