Ingénieur d'études en Bioinformatique

il y a 7 jours

Nantes, France Inserm France Temps plein

Description CDD de 24 mois renouvelable - Temps plein Centre de Nantes accessible en transports en commun Niveau Ingénieur d'études, catégorie A Télétravail 2 jours par semaine Congés/RTT : 45 jours par an Structure d'accueil L'unité U1235-TENS (The Enteric Nervous System in gut and brain disorders) a été fondée en 2008 par le Dr Michel Neunlist. Son objectif est d'étudier le rôle du système nerveux entérique dans les troubles intestinaux et cérébraux, du niveau moléculaire au niveau cellulaire jusqu'au niveau du patient. TENS fait partie de la Faculté de médecine de l'Université de Nantes et est physiquement situé sur le campus principal de l'université. A cet endroit, il est aussi physiquement proche de l'hôpital, qui abrite plusieurs services cliniques avec lesquels il collabore (Maladies digestives, Neurologie, Biochimie, Réadaptation Physique et Médicale) Adresse : Faculté de Médecine - 1 rue Gaston Veil 44000 Nantes Description du poste Mission principale La personne recrutée aura pour mission d’analyser les données multi-omiques issues des projets du laboratoire visant à mieux appréhender le rôle des interactions entre le microbiote intestinal et le tube digestif dans le cadre de l’étude de pathologies inflammatoires de l’axe intestin cerveau et dans l’étude de la réponse du tube digestif à des approches thérapeutiques innovantes. L’objectif sera d’analyser à la fois des données de métagénomique et aussi de métranscriptomiques en utilisant et adaptant des programmes d’analyse d’ores et déjà développés au sein de TENS ou en collaboration avec des partenaires académiques. Activités principales Analyse de données omiques (analyses multi-variées, analyses différentielles, intégration de données multi-omiques) Assurer la gestion des données (sauvegardes, stockage) Assurer la gestion de code (Gitlab) Veille scientifique Participation à la rédaction des articles scientifiques Participation aux activités du Hub de Bioinformatique de la plateforme BiRD Spécificités du poste Participation aux différents programmes de recherches portés par l’Unité Participation à hauteur de 0.2 ETP aux activités du Hub De Bioinformatique porté par la plateforme BiRD Profil recherché Connaissances Bonne connaissance des approches de bioinformatique et biostatistique pour l’analyse de données omiques à grande échelle Maîtrise des environnements Linux Connaissance de différents langages de programmation: R et Python Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source (git, GitLab) Expérience avec un système de gestion de workflows (Snakemake en priorité) Expérience avec Slurm dans l’utilisation d’un cluster de calcul haute performance (HPC) serait un plus. Biologie (connaissances générales) Anglais scientifique Savoir-faire Traitement et gestion des données Interagir avec les biologistes de l’équipe et être en capacité de comprendre leurs attentes Transmettre ses connaissances Aptitudes Organisation, rigueur scientifique Communication, bon relationnel Curiosité scientifique Expérience souhaitée : 2 ans Niveau de diplôme et formation : Master 2 en Bioinformatique ou équivalent #J-18808-Ljbffr

  • Ingénieur d'études en Bioinformatique

    il y a 2 jours

    Nantes, France INSERM Temps plein

    Ingénieur d'études en Bioinformatique - H/F Join to apply for the Ingénieur d'études en Bioinformatique - H/F role at INSERM L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12...

  • Ingénieur d'Études Bioinformatique – Multi-Omics

    il y a 2 jours

    Nantes, France INSERM Temps plein

    Un institut de recherche biologique basé à Nantes recherche un Ingénieur d'études en Bioinformatique pour un CDD de 24 mois renouvelable. Le candidat idéal doit avoir un Master 2 en Bioinformatique et au moins 2 ans d'expérience. Les missions incluent l'analyse de données omiques et la gestion de projets de recherche. Ce poste offre un équilibre...

  • Ingénieur d'études en Bioinformatique

    il y a 1 semaine

    Nantes, Pays de la Loire, France INSERM Temps plein

    L'Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l'ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif...

  • ingénieur d'études en bioinformatique

    il y a 1 semaine

    Nantes, Pays de la Loire, France Inserm Temps plein

    Le poste CDD de 24 mois renouvelable - Temps pleinCentre de Nantes accessible en transports en communNiveau Ingénieur d'études, catégorie ATélétravail 2 jours par semaineCongés/RTT : 45 jours par anStructure d'accueilL'unité U1235-TENS (The Enteric Nervous System in gut and brain disorders) a été fondée en 2008 par le Dr Michel Neunlist. Son...

  • Ingénieur Etudes Systèmes CFO/CFA

    il y a 1 semaine

    Nantes, Pays de la Loire, France Egis en France Temps plein

    Description De L'entrepriseLa Business Line Transports & Territoires regroupe les équipes du rail, de la route, des mobilités, de l'aménagement urbain, des systèmes et des grands ouvrages, avec notamment les ports.L'objectif qui nous anime est à la fois de promouvoir, de concevoir et de réaliser des solutions de transports multimodaux pour favoriser la...

  • Ingénieur d'études/Ingénieure d'études

    il y a 2 semaines

    Nantes, Pays de la Loire, France Vulcain Engineering Group Temps plein

    Vulcain Engineeringest un acteur majeur du secteur de l'énergie, engagé dans l'innovation, la durabilité et la création d'un avenir plus propre. Notre équipe dynamique et talentueuse recherche des professionnels hautement qualifiés pour contribuer au succès de nos projets et de ceux de nos clients.Nous accompagnons nos clients dans leurs projets et...

  • Ingénieur d'études CVC

    il y a 2 semaines

    Nantes, France GIF Emploi Temps plein

    Description du poste Vous êtes expert dans la transition énergétique et souhaitez intégrer un Groupe leader dans ce domaine ? GIF Pays de la Loire recrute, pour le compte de son client, des ingénieur(e)s d'études en CVC (H/F) à Nantes (44). VOTRE MISSION : - Prendre part à la réalisation et au suivi des études d’exécution - Participer à la...

  • Ingénieur Études CVC H/F

    il y a 2 semaines

    Nantes, France Systea Infrastructures Temps plein

    Nous recherchons un profil d'Ingénieur Études CVC (H/F) pour intégrer une équipe dynamique et motivée. Ce poste vous offrira l'opportunité de relever des défis de haute responsabilité tout en évoluant dans un environnement convivial, idéal pour le développement et l'enrichissement de vos compétences. Vos missions : En charge des études...

  • Ingénieur d’études en électrotechnique H/F

    il y a 2 semaines

    Nantes, France A2TI Temps plein

    Partenaire privilégié des grands industriels et des PME-PMI de la région Pays de Loire, A2TI assiste la réalisation des études et des projets de ses clients, du secteur des transports (naval, aéronautique, automobile, ferroviaire et véhicules industriels) mais aussi de l'énergie, de l'environnement et de l'infrastructure industrielle. A2Ti s'engage...

  • Ingénieur d'Études CVC H/F

    il y a 2 semaines

    Nantes, France Métiga Temps plein

    En tant qu'Ingénieur d'Etudes CVC (H/F), vous interviendrez sur la conception des lots CVC pour d'importants projets industriels ou tertiaires. A ce titre et dans le cadre des réglementations RT2012/RE2020, vous serez en charge de: - L'analyse du cahier des charges et la réalisation de bilans thermiques. - La réalisation des études techniques, de...