Développeur de méthodes d'analyses bioinformatiques

il y a 2 semaines


Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein
Stage de M2 : Développement des méthodes d'analyses bioinformatiques de données ribo-seq

Le laboratoire IGS recherche un stagiaire pour développer des méthodes d'analyses bioinformatiques de données ribo-seq dans le cadre d'un projet de recherche sur les virus géants.

Contexte et objectifs du stage

Le projet consiste à comprendre comment les Pandoraviridae créent de nouveaux gènes et l'impact sur leur évolution et leur physiologie. Pour cela, le laboratoire s'appuie sur l'analyse bioinformatique à grande échelle du « traductome » du virus et de son hôte grâce à deux méthodes : le profilage ribosomique (ribo-seq) et la protéomique par spectrométrie de masse à haut débit.

Profil recherché

Le candidat idéal aura de préférence un parcours intégrant de la bioinformatique et/ou de la bio-analyse ou un fort attrait pour l'une de ces disciplines. Il/Elle devra être autonome et montrer un réel intérêt pour les aspects de développement informatique à visée bio-analyses.

Procédure

Envoyer un email à santini@igs.cnrs-mrs.fr



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    Contexte et objectifs du stageLe laboratoire IGS tente de comprendre comment les Pandoraviridae créent de nouveaux gènes et l'impact sur leur évolution et leur physiologie. Pour cela, le laboratoire s'appuie sur l'analyse bioinformatique à grande échelle du « traductome » du virus et de son hôte grâce à deux méthodes : le profilage ribosomique...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Spécialiste en Bioinformatique pour l'Analyse de DonnéesL'objectif de ce poste est de développer et d'appliquer une approche de biologie des systèmes à partir de données OMICs (RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq) générées en bulk ou à l'échelle de la cellule unique, à partir de cellules souches hématopoïétiques (CSH) murines et...

  • Ingénieur en bioinformatique

    il y a 2 semaines


    Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Offre de poste : Ingénieur en bioinformatiqueL'équipe MABioS et l'équipe d'Estelle Duprez recrutent un(e) Ingénieur(e) en bioinformatique pour l'analyse de données transcriptomiques et épigénétiques générées par le laboratoire de biologie moléculaire et issus des données publiques.Compétences requisesMaîtrise des outils...

  • Ingénieur en bioinformatique

    il y a 3 semaines


    Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Ingénieur en bioinformatiqueContexte du projetL'équipe MABioS et l'équipe d'Estelle Duprez recrutent un(e) Ingénieur(e) en bioinformatique pour l'analyse de données transcriptomiques et épigénétiques générées par le laboratoire de biologie moléculaire et issus des données publiques.Objectifs du posteAppliquer et développer une...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Ingénieur(e) en bioinformatique Nous recherchons un(e) Ingénieur(e) en bioinformatique pour rejoindre notre équipe de recherche en biologie des systèmes. Le candidat idéal aura une solide formation en bioinformatique et une expérience dans l'analyse de données NGS.Responsabilités Appliquer et développer des approches de biologie des systèmes pour...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Projet de rechercheL'objectif de ce stage est de construire le réseau d'interactions ligand-récepteur entre les tumeurs pancréatiques et les sous-types de neurones sensoriels en utilisant des données de single-cell RNA-sequencing, afin d'identifier les voies de signalisation impliquées dans la régulation de l'innervation...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Spécialiste en bioinformatique Nous recherchons un(e) Spécialiste en bioinformatique pour rejoindre notre équipe de recherche en biologie des systèmes. Le candidat idéal aura une solide formation en bioinformatique et une expérience dans le développement de modèles de régulation.Responsabilités Développer des modèles de régulation pour analyser...


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    Projet de rechercheL'objectif de ce stage est de développer des compétences en bioinformatique pour analyser les données de single-cell RNA-sequencing et identifier les voies de signalisation impliquées dans la régulation de l'innervation tumorale.Compétences requisesConnaissances en bioinformatique et en analyse de donnéesExpérience en...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Projet de recherche : Analyse des interactions ligand-récepteur entre cellules neuronales et tumorales via du scRNA-seqLe Centre Turing pour les systèmes vivants (CENTURI) recherche un stagiaire en data science pour travailler sur un projet de recherche académique. L'étudiant travaillera à l'analyse des interactions ligand-récepteur entre les cellules...


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    Projet de rechercheL'objectif de ce stage est de concevoir des pipelines d'analyse pour les données de séquençage à haut débit et identifier les voies de signalisation impliquées dans la régulation de l'innervation tumorale.Compétences requisesConnaissances en bioinformatique et en analyse de donnéesExpérience en programmation...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Ingénieur en Analyse de Données de FiabilitéL'équipe MABioS et l'équipe d'Estelle Duprez recrutent un(e) Ingénieur(e) en Analyse de Données de Fiabilité pour l'analyse de données transcriptomiques et épigénétiques générées par le laboratoire de biologie moléculaire et issus des données publiques.Vous serez chargé(e) de...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Mise en place des techniques de traitement et d'analyses bioinformatiquesLe/la candidat(e) recruté(e) aura pour objectif de mettre en place les techniques de traitement et d'analyses bioinformatiques de données de « ribo-seq » au travers d'une étude ciblée d'un virus géant et de son hôte. Il/Elle identifiera les programmes les plus performants et les...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

    Ingénieur en Biologie des Systèmes pour l'Analyse de DonnéesL'équipe MABioS et l'équipe d'Estelle Duprez recrutent un(e) Ingénieur(e) en Biologie des Systèmes pour l'analyse de données transcriptomiques et épigénétiques générées par le laboratoire de biologie moléculaire et issus des données publiques.Vous serez chargé(e)...


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    il y a 2 semaines


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  • Bio-informaticien F/H

    il y a 4 semaines


    Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France Aix-Marseille Université Temps plein

    MissionL'unité C2VN est une équipe de recherche pluridisciplinaire composée de plus de 50 personnes, située sur le campus universitaire de la Timone à Marseille. L'unité étudie les mécanismes moléculaires et cellulaires impliqués dans le développement de la pathologie cardiovasculaire, la dysfonction endothéliale et la...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France JOBCITY AUBAGNE Temps plein

    À propos de l'offreJOBCITY AUBAGNE recherche un(e) développeur d'installations électriques pour rejoindre son équipe.ObjectifsRéaliser des saignées ou des supports pour le passage de câblesRéaliser et poser des chemins de câbles et des conduits électriques en apparent ou en encastréPositionner et câbler une armoire ou un tableau de...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France Ponticelli Temps plein

    Développeur Ingénieur CalculsNous sommes à la recherche d'un Développeur Ingénieur Calculs pour rejoindre notre équipe de passionnés!Nous intervenons dans les secteurs des énergies, des sciences de la vie et des industries. Vous serez immergé(e) dans les grands projets de la société, notamment dans le secteur du nucléaire.Vous serez formé(e)...


  • Marseille, Provence-Alpes-Côte d'Azur, France SFBI Temps plein

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