Ingénieur(e) d'étude en bio-informatique

il y a 10 heures


Paris, Île-de-France SFBI Temps plein
Ingénieur(e) d'étude en bio-informatique

Nous recherchons un ingénieur d'étude en bio-informatique motivé pour rejoindre notre équipe et réaliser des analyses bioinformatiques de données de RNAseq.

Missions :

L'ingénieur d'étude aura pour mission d'assister des membres du laboratoire dans leurs projets de recherche pour la partie bio-informatique de l'étude de données transcriptomiques générées par l'équipe ou issues de publications.

Activités :

L'ingénieur d'étude devra acquérir la maitrise des pipelines d'analyses existants et les optimiser afin de réaliser le traitement des données de séquençage. Il/elle assurera une veille technologique afin d'améliorer les différents outils d'analyse. Il/elle aura aussi en charge une partie des analyses avec le développement de scripts en R ou en Python, en étroite collaboration avec l'équipe.

Compétences attendues :

Un diplôme de niveau Bac +5 en bio-informatique, biologie computationnelle, génomique ou domaine connexe est requis. Nous recherchons une personne motivée, organisée et rigoureuse et capable de travailler en équipe, avec de solides compétences en programmation (R, Python,...) et en analyses statistiques.

Contexte de travail :

L'Institut de biologie de l'ENS (IBENS) est un centre de recherche fondamentale qui mène des recherches originales visant à décrypter les mécanismes fondamentaux au cœur des processus biologiques.

Unité mixte ENS-CNRS-INSERM, l'IBENS accueille plus de 300 personnes regroupées en 30 équipes autonomes conduisant une recherche hautement collaborative et multidisciplinaire qui allie approches expérimentales et théoriques.

L'activité de recherche couvre des champs thématiques variés : Génomique fonctionnelle, Biologie du développement, Neurosciences, Écologie et biologie de l'évolution.

Plusieurs plateformes technologiques, notamment en imagerie, génomique, protéomique et bio-informatique, sont à la disposition des chercheurs. Les recherches menées à l'IBENS bénéficient des interactions avec d'autres disciplines présentes à l'ENS (physique, chimie, sciences cognitives, mathématiques). L'IBENS est activement impliqué dans la formation des étudiants et jeunes chercheurs à tous les niveaux.

L'équipe d'accueil, dirigée par Hervé Le Hir, comprend 10 membres et est membre de la section « génomique Fonctionnelle » de l'IBENS composée de 8 équipes.

Notre groupe s'intéresse aux Nonsense Mediated mRNA decay (NMD), un mécanisme de surveillance cytoplasmique, et de ses liens avec la dégradation générale des ARNm. Nous utilisons plusieurs techniques de séquençage de transcriptomes en utilisant les technologies Illumina et Nanopore pour comprendre les fonctions alternatives d'un facteur central du NMD.

Procédure : Candidater via le site du CNRS en suivant le lien ici.



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