Ingénieur bio-informaticien en gestion de ressources sur la plateforme de Bio-informatique de l'Institut de Biologie de l'ENS

il y a 1 jour


Paris, Île-de-France CNRS Temps plein
Offre de poste

Titre de l'offre : Ingénieur bio-informaticien en gestion de ressources sur la plateforme de Bio-informatique de l'Institut de Biologie de l'ENS

Référence : UMR8197-VALHER-121

Nombre de postes : 1

Lieu de travail : Paris 05

Type de contrat : CDD Technique/Administratif

Durée du contrat : 12 mois

Date d'embauche prévue : 1 octobre 2024

Quotité de travail : Temps complet

Rémunération : Entre 2 400€ et 3 000€ selon l'expérience

Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus)

Expérience souhaitée : Indifférent

BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement

Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données

Missions

La personne recrutée contribuera d'une part aux activités liées à l'exploitation du cluster BioClust avec une implication prépondérante dans le support aux utilisateurs du LABEX Memolife, et d'autre part dans son administration et optimisation logicielle. Elle apportera de plus un soutien à l'animation scientifique en bio-informatique au sein du LABEX Memolife.

Activités

1) Support/administration du cluster BioClust :

• Former les utilisateurs à la structure du cluster, des règles d'utilisation, et du système de soumission (HT-Condor)

• Assurer un support aux utilisateurs : assistance, accompagnement, conseil et expertise auprès des utilisateurs dans le développement, le portage, l'optimisation ou le profilage de leurs codes

• Recueillir les besoins, évaluer et sélectionner les outils, logiciels et bibliothèques de calcul, de génération ou d'optimisation de code, etc. pertinents pour les utilisateurs

• Superviser la bonne utilisation du cluster et prendre en charge les incidents de premier niveau

• Gérer administrativement le cluster (préparation de la facturation des coûts utilisateurs, appel à contribution pour le développement du cluster)

• Contribuer aux installations des logiciels nécessaires et participer à la mise en œuvre des services d'infrastructures

2) Animation scientifique en bio-informatique :

• Prendre en charge la continuité de l'organisation des séminaires Bio-informatiques du LABEX (contact des présentateurs, organisation du planning, réservation de salle, diffusion des annonces)

• Participer aux activités de formation à l'utilisation des outils de bio-informatique

• Apporter une aide aux chercheurs pour l'organisation de leurs données scientifiques et contribuer à la rédaction des Plans de Gestion de données pour les réponses à appel à projet des équipes du LABEX (une formation pourra être envisagée)

Compétences

• Pratique de l'utilisation des systèmes de type Unix et des langages de script Shell

• Maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation (Python, Perl, C)

• Connaissance du logiciel R

• Connaissance des architectures de clusters de calcul et intérêt pour le domaine

• Aisance dans l'expression orale et écrite

• Maîtrise de l'anglais technique du domaine, capacité à conduire des réunions et rédiger des documents dans cette langue

• Bonnes capacités relationnelles, autonomie et capacité d'initiative

• Aptitude au travail en équipe

• Connaissances et intérêt pour la recherche en biologie

Contexte de travail

Ce poste s'inscrit dans le cadre du Laboratoire d'Excellence (LABEX) MemoLife regroupant trois unités de recherche en sciences de la vie sur Paris (/). Le LABEX MemoLife regroupe l'ensemble des équipes de l'Institut de Biologie de l'ENS (IBENS), du Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie du Collège de France (CIRB) et de l'unité́ « Plasticité́ du Cerveau » de l'École Supérieure de Physique Chimie Industrielle (ESPCI). Ce consortium représente 53 équipes de recherche et 3 plateformes IBiSA (493 personnes). Dans ce cadre, l'IBENS héberge, administre et met à la disposition du LABEX un ensemble d'équipements de calcul intensif, parmi lesquels le cluster « BioClust », configurés et installés pour le traitement des données biologiques (séquences génomiques, imagerie, modélisation moléculaire, et organise de l'animation scientifique sous la forme de séminaires bio-informatiques réguliers. Le poste sera rattaché à la plateforme informatique de l'IBENS (5 personnes) et travaillera en étroite collaboration avec la cellule cluster qui définit les orientations pour l'évolution des moyens de calcul du LABEX et participe au support utilisateurs.

Contraintes et risques

Travail sur ordinateur



  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

    Offre de posteTitre de l'offre : Ingénieur•e bio-informaticien•ne en gestion de ressources sur la plateforme de Bio-informatique de l'Institut de Biologie de l'ENSContexte de travailLe poste est rattaché à la plateforme informatique de l'Institut de Biologie de l'ENS (IBENS), un centre de recherche de renommée internationale qui regroupe des équipes...


  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

    Présentation du posteL'Institut de Biologie de l'ENS recherche un Ingénieur•e bio-informaticien•ne pour occuper le poste de gestionnaire de ressources sur la plateforme de Bio-informatique. Le candidat idéal sera chargé de la gestion et de l'administration du cluster BioClust, ainsi que de l'animation scientifique en bio-informatique...


  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

    Informations générales Titre de l'offre : Ingénieur•e bio-informaticien•ne en gestion de ressources sur la plateforme de Bio-informatique de l'Institut de Biologie de l'ENS Contexte Ce poste est rattaché au Laboratoire d'Excellence (LABEX) MemoLife, un consortium regroupant trois unités de recherche en sciences de la vie sur Paris. Le LABEX...


  • Paris, Île-de-France SFBI Temps plein

    Ingénieur(e) d'étude en bio-informatique Nous recherchons un ingénieur d'étude en bio-informatique motivé pour rejoindre notre équipe et réaliser des analyses bioinformatiques de données de RNAseq. Missions : L'ingénieur d'étude aura pour mission d'assister des membres du laboratoire dans leurs projets de recherche pour la...


  • Paris, Île-de-France SFBI Temps plein

    Offre de poste : Ingénieur(e) d'étude en bio-informatiqueContexte de l'offreL'Institut de biologie de l'ENS (IBENS) est un centre de recherche fondamentale qui mène des recherches originales visant à décrypter les mécanismes fondamentaux au cœur des processus biologiques.Unité mixte ENS-CNRS-INSERM, l'IBENS accueille plus de 300...


  • Paris, Île-de-France SFBI Temps plein

    Poste : Ingénieur(e) d'étude en bio-informatique Type de contrat : CDD·IE·12 mois (renouvelable) Niveau requis : Bac+5 / Master Institut : Institut de Biologie de l'École Normale Supérieure (IBENS), CNRS UMR8197 – INSERM U1024 Rémunération : Entre 2 400€ et 3 000€ selon l'expérience (grille indiçiaire du CNRS) Mission : L'ingénieur(e)...


  • Paris, Île-de-France Paris Institute for Transplantation and Organ... Temps plein

    MissionNous recherchons un bio-informaticien expérimenté pour rejoindre notre équipe de recherche pluridisciplinaire spécialisée dans la transplantation d'organe. Votre mission sera de développer et mettre en œuvre des méthodologies bio-informatiques pour analyser les données génomiques, transcriptomiques et protéomiques générées par notre...


  • Paris, Île-de-France Biomechanics Summer Course Temps plein

    Offre de CDD Ingénieur·e en bio-informatiqueContexte de travailL'ingénieur·e sera affecté·e dans l'équipe « Assemblage moléculaire et intégrité du génome » de l'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (UMR 9198 I2BC, CNRS/CEA/Université Paris-Saclay).L'équipe s'appuie sur un couplage fort entre approches bio-informatiques et...


  • Paris, Île-de-France Biomechanics Summer Course Temps plein

    Contexte de travailL'ingénieur·e sera affecté·e dans l'équipe « Assemblage moléculaire et intégrité du génome » d'un institut de recherche de l'Université Paris-Saclay, constitué d'une soixantaine d'équipes. La recherche à l'institut couvre une variété de thématiques de biologie intégrative (biophysique, biochimie, biologie structurale,...


  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

    Contexte de l'offreL'équipe TE R BIO du Laboratoire de Biologie du Développement (UMR7622) de l'Institut de Biologie Paris Seine recherche un Assistant Ingénieur en Biologie des Données pour rejoindre son équipe dirigée par C. Carré et L. Teysset.MissionsL'Assistant Ingénieur en Biologie des Données sera chargé de l'analyse de...


  • Paris, Île-de-France Saint Felix De Lunel Temps plein

    Offre de stage M2L'équipe AdipoLive de l'Institut des Maladies Métaboliques et Cardiovasculaires (I2MC) recherche un(e) étudiant(e) de M2 pour participer à un projet de recherche sur l'imagerie de la cellule adipeuse et l'analyse bio-informatique.Objectifs du projetMettre au point et développer un outil d'intelligence artificielle pour...

  • Vendeur en Magasin Bio

    il y a 4 semaines


    Paris, Île-de-France Bio c' Bon Temps plein

    Description du PosteBienvenue chez Bio C'Bon. Depuis 2008, notre enseigne se distingue par son approche chaleureuse et joyeuse de la consommation biologique en France. Nous nous engageons à offrir des produits bénéfiques pour la santé tout en respectant l'environnement. Avec une centaine de points de vente bio implantés au cœur des villes, nous restons...


  • Paris, Île-de-France Bodin Bio Temps plein

    Bodin Bio : Leader sur le marché de la volaille Biologique Bodin Bio est une entreprise familiale pionnière sur le marché Bio, reconnue par ses partenaires depuis 1979 pour son engagement et son respect animal et environnemental. Dans le cadre de son développement, Bodin Bio recrute un Chef de Secteur Réseau Bio H/F Nord-Est. Responsabilités ...

  • Chef de Projet

    il y a 1 semaine


    Paris, Île-de-France Institut Curie Temps plein

    Offre de Poste : Chef de Projet - Institut des Cancers des FemmesL'Institut des Cancers des Femmes est une structure inédite d'envergure internationale qui place les femmes au cœur de la recherche et de l'innovation. Avec plus de 78 000 nouveaux cas et 20 000 décès chaque année en France, les cancers féminins sont un véritable enjeu de...


  • Paris, Île-de-France Bio Consom'acteurs Temps plein

    Participez à une initiative unique qui allie consommation biologique et autonomie. En tant que participant, vous aurez l'opportunité de découvrir des pratiques durables et de vous engager dans une démarche responsable.Qu'est-ce que l'initiative Biotonomes ?Depuis plusieurs années, Biocoop a lancé une campagne visant à sensibiliser les consommateurs à...


  • Paris, Île-de-France Bio Consom'acteurs Temps plein

    Qui sommes-nous?Bio Consom'acteurs est une entreprise leader dans le domaine de la consommation bio et de l'autonomie. Nous sommes convaincus que la consommation bio est un choix responsable et sain pour l'environnement et la santé humaine.Notre missionNos objectifs sont de promouvoir la consommation bio et de soutenir les consommateurs dans leur choix de...

  • Ingénieur R&D Firmware BIOS

    il y a 1 semaine


    Paris, Île-de-France Atos SE Temps plein

    À propos de l'entrepriseAtos SE est une entreprise leader dans la transformation numérique durable, fiable et basée sur les données. Nous sommes un leader mondial dans les domaines du numérique, du cloud, des données, de l'informatique avancée et de la sécurité.Le rôleNous recherchons un Ingénieur R&D Firmware BIOS pour rejoindre notre...


  • Paris, Île-de-France Bio Consom'acteurs Temps plein

    Une entreprise innovante pour la sensibilisation à la bioÀ Bio Consom'acteurs, nous sommes convaincus que la sensibilisation à la bio est essentielle pour un avenir durable. C'est pourquoi nous avons créé Ludobio, une mallette de jeux conçus pour les 6 à 12 ans pour sensibiliser les enfants à une alimentation saine et durable de manière...


  • Paris, Île-de-France Bio Consom'acteurs Temps plein

    Qui sommes-nous?Bio Consom'acteurs est une entreprise leader dans le domaine de la bio-économie, qui vise à encourager les consommateurs à adopter des pratiques responsables et durables.Qu'est-ce que les Biotonomes?Les Biotonomes sont des professionnels qui travaillent pour promouvoir les valeurs de la bio-économie, en encourageant les consommateurs à...


  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

    Présentation de l'offre Le CNRS recherche un Assistant Ingénieur en Biologie des Données pour rejoindre son équipe de recherche. Missions L'Assistant Ingénieur en Biologie des Données sera chargé de l'analyse de données bio-informatiques de type séquençage (RNAseq, small RNAseq, chIPseq, tRNA-seq) dans le cadre de projet sur les petits ARN...