Ingénieur développement de pipeline en protéotypage/métaprotéomique

il y a 4 semaines


BagnolssurCèze, Occitanie, France SFBI Temps plein
Développeur de pipeline en protéotypage/métaprotéomique

L'offre concerne le besoin d'évolution d'un pipeline existant, écrit en Python, permettant la caractérisation taxonomique et fonctionnelle d'échantillons inconnus.

Missions principales
  • Tester et intégrer divers outils récents de mises en correspondance spectres MS/MS – séquence de peptides (DDA, DIA, de novo...) dans le process global de protéotypage
  • Sélectionner et appliquer des méthodes de classification ou de régression par IA adaptées aux jeux de données disponibles
  • Optimiser les bases de données d'organismes utilisées pour un compromis couverture / rapidité / empreinte mémoire, en intégrant les nouveaux séquençages d'organismes (isolats, MAGs, SAGs...)
  • Définir, mettre en œuvre et valider un estimateur de confiance global (Python, R)
  • Améliorer l'IHM du pipeline, la documentation des développements, et simplifier et optimiser le code existant
Compétences souhaitées
  • Fortes compétences en développement de code Python
  • Compétences en méthodes de classification IA
Aptitudes personnelles
  • Force de proposition
  • Rigueur


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    Ingénieur développement de pipeline en protéotypage/métaprotéomique Nous recherchons un ingénieur expérimenté pour rejoindre notre équipe de développement de pipeline en protéotypage et métaprotéomique. Compétences requises Fortes compétences en développement de code Python Compétences en méthodes de classification IA Aptitudes...


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  • Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à améliorer le pipeline existant de typage par le séquençage de peptides, permettant des applications en...


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    À propos de l'entrepriseSOM Aix-en-Provence est une entreprise leader dans le domaine de l'ingénierie et des travaux. Nous sommes présents dans de nombreux secteurs d'activités, notamment les énergies, les mines, la pharmacie, la chimie, la défense, le ferroviaire, l'agroalimentaire, l'automobile, l'aéronautique, le spatial et...


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