Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

il y a 2 semaines

BagnolssurCèze, Occitanie, France CEA Temps plein
Description de l'offre

L'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à améliorer le pipeline existant de typage par le séquençage de peptides, permettant des applications en protéomique microbienne et métaprotéomique.

Sous l'encadrement d'un ingénieur de recherche senior en informatique-bioinformatique, le candidat aura à développer de nouvelles fonctionnalités, évaluer les performances comparées des processus existants et des nouvelles options possibles (DIA, denovo, IA...), et tester les performances finales.

Les missions principales du poste incluront de:

  1. tester et intégrer divers outils récents de mises en correspondance spectres MS/MS – séquence de peptides (DDA, DIA, de novo...) dans le process global de protéotypage,
  2. sélectionner et appliquer des méthodes de classification ou de régression par IA (PyTorch, sélection de features, modèles...),
  3. optimiser les bases de données d'organismes utilisées pour un compromis couverture / rapidité / empreinte mémoire, en intégrant les nouveaux séquençages d'organismes (isolats, MAGs, SAGs...),
  4. définir, mettre en œuvre et valider un estimateur de confiance global (Python, R).
Profil du candidat

Formation : niveau Master 2 débutant

Compétences : compétences en développement/rationalisation de code Python, compétences ou intérêt pour les méthodes de classification/régression IA, connaissances SQL.

Pour postuler, veuillez contacter Olivier Pible avec CV détaillé, notes obtenues lors de votre formation, lettre de motivation, référents et si possible lettre de recommandation.

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 3 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à améliorer le pipeline existant de typage par le séquençage de peptides, permettant des applications en...

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 2 semaines

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  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 3 semaines

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    il y a 2 semaines

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  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 4 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

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  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 3 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

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  • Ingénieur de développement informatique LI2D H/F

    il y a 1 semaine

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    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à améliorer le pipeline existant de typage par le séquençage de peptides, permettant des applications en...

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique microbienne

    il y a 1 semaine

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    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet s'inscrit dans le besoin d'évolution du pipeline existant, écrit en Python, permettant la caractérisation taxonomique...

  • Ingénieur de développement informatique LI2D H/F

    il y a 1 jour

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à évoluer le pipeline existant, écrit en Python, permettant la caractérisation taxonomique et fonctionnelle...

  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps plein

    Accélérez la Transition Énergétique avec AssystemNous sommes à la recherche d'un Ingénieur Informatique Industriel pour rejoindre notre équipe de 7500 experts dans le domaine de l'ingénierie et de la gestion de projets. Vous serez chargé de mettre en œuvre des solutions innovantes pour accélérer la transition énergétique et contribuer...

  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps plein

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  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem GmbH Temps plein

    Accélérez la Transition Énergétique avec NousNous sommes à la recherche d'un Ingénieur Informatique Industriel pour rejoindre notre équipe de 7500 experts dans le domaine de l'ingénierie et de la gestion de projets. Chez Assystem, nous nous engageons à accélérer la transition énergétique partout dans le monde en développant des...

  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps plein

    Accélérez la Transition Énergétique avec AssystemNous sommes à la recherche d'un Ingénieur Informatique Industriel pour rejoindre notre équipe de 7500 experts dans le domaine de l'ingénierie et de la gestion de projet. Chez Assystem, nous nous engageons à accélérer la transition énergétique partout dans le monde en développant des...

  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps plein

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  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps plein

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  • Ingénieur Informatique Industriel

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    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem GmbH Temps plein

    Accélérez la Transition Énergétique avec AssystemNous sommes à la recherche d'un Ingénieur Informatique Industriel pour rejoindre notre équipe de 7500 experts dans le domaine de l'ingénierie et de la gestion de projets. Chez Assystem, nous nous engageons à accélérer la transition énergétique partout dans le monde en combinant notre...

  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem GmbH Temps plein

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  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps plein

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  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

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  • Ingénieur Informatique Industriel

    il y a 2 semaines

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