Ingénieur en Bioinformatique Intégration

il y a 4 jours


Paris, Île-de-France SFBI Temps plein
Poste d'Ingénieur en Bioinformatique Intégration

L'AP-HP, un centre hospitalier universitaire à dimension européenne mondialement reconnu, recherche un.e ingénieur.e en bioinformatique pour renforcer son équipe Intégration de la plateforme MOABI.

Compétences requises
  • Connaissance approfondie des langages Python, Bash et R
  • Expérience avec des gestionnaires de workflow (snakemake, nextflow)
  • Maîtrise des environnements virtuels (Docker, VM)
  • Connaissance de l'environnement Linux/Unix, idéalement distribution Debian
  • Maîtrise des bonnes pratiques de développement informatique
Responsabilités
  1. Implémentation et mise en place d'outils et de chaînes de traitement d'analyses
  2. Participation à des projets de développement logiciel
  3. Création de paquets Debian et de conteneurs
  4. Valorisation et partage des applications développées
  5. Formation et support des utilisateurs
  6. Administration et maintenance d'un serveur Galaxy
  7. Mise en place et animation d'une communauté autour de Galaxy
Compétences interpersonnelles
  • Autonomie, rigueur, méthode
  • Excellentes qualités relationnelles, esprit d'équipe et organisationnelles
  • Excellentes qualités de communication
  • Capacité de travail importante, associée à un fort dynamisme
  • Curiosité, capacité d'adaptation et d'anticipation

L'AP-HP est un employeur public de santé qui valorise les compétences et les expériences de ses collaborateurs. Nous recherchons un.e candidat.e motivé.e et passionné.e par le domaine des sciences biologiques et/ou médicales.



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