Postdoctorant en génomique des populations

Il y a 2 mois


Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein
Mission et objectifs

L'IRD recherche un postdoctorant pour rejoindre l'axe « Écologie et évolution des zoonoses » au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier. Le candidat sélectionné travaillera sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage, en particulier des petits mammifères.

Compétences requises
  • Connaissances approfondies en bio-informatique et en génomique des populations
  • Expérience avec les outils informatiques de traitement des données de séquençage, notamment haut débit
  • Maîtrise des outils de génomique des populations, notamment ceux adaptés à l'analyse des données de génomes complets à faible couverture
  • Maîtrise des outils de détection des signatures de sélection et d'associations génome / environnement
Activités
  1. Réaliser l'analyse bioinformatique des nouvelles données de séquences (240 génomes complets)
  2. Récupérer les données de génomes complets à faibles couverture déjà publiées sur la souris domestique, et les associer aux nouvelles données
  3. Mettre en œuvre des analyses de génomique des populations pour retracer l'histoire de l'invasion de la souris en Afrique, et sa dynamique démographique post-introduction
  4. Mettre en œuvre des analyses de détection de sélection et d'association gène-environnement pour déterminer quelles régions du génome ont pu évoluer en réponses à différents gradients environnementaux
  5. Formaliser et valoriser les résultats au travers de publications
  6. Participer aux réunions mensuelles de l'axe « Ecologie et évolution des zoonoses », et contribuer à animer le groupe « Bioinformatique » du CBGP
Équipe

Le candidat sélectionné rejoindra un collectif à taille humaine IRD / INRAE composé de 8 chercheurs, 2 ingénieurs d'étude spécialisés respectivement en biologie moléculaire et bioinformatique, et de 2 agents spécialisés en biologie moléculaire.



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