Postdoctorant en génomique des populations

il y a 1 mois


Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein
Mission

Vous rejoindrez l'axe « Écologie et évolution des zoonoses » du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage.

Objectifs

Vous développerez des analyses de génomique des populations pour comprendre l'histoire de l'invasion de la souris domestique en Afrique. Vous chercherez à retracer l'histoire de son introduction, sa dynamique d'expansion en Afrique et à identifier les régions du génome qui lui ont permis de s'adapter à de nouveaux environnements.

Activités
  • Réaliser l'analyse bioinformatique des nouvelles données de séquences (240 génomes complets).
  • Récupérer les données de génomes complets à faibles couverture déjà publiées sur la souris domestique, et les associer aux nouvelles données.
  • Mettre en œuvre des analyses de génomique des populations pour retracer l'histoire de l'invasion de la souris en Afrique, et sa dynamique démographique post-introduction.
  • Mettre en œuvre des analyses de détection de sélection et d'association gène-environnement pour déterminer quelles régions du génome ont pu évoluer en réponses à différents gradients environnementaux.
  • Formaliser et valoriser les résultats au travers de publications.
  • Participer aux réunions mensuelles de l'axe « Ecologie et évolution des zoonoses », et contribuer à animer le groupe « Bioinformatique » du CBGP.
Équipe

Vous intégrerez un collectif à taille humaine IRD / INRAE composé de 8 chercheurs, 2 ingénieurs d'étude spécialisés respectivement en biologie moléculaire et bioinformatique, et de 2 agents spécialisés en biologie moléculaire.

Compétences requises
  • Excellentes connaissances en bio-informatique et des concepts de génomique des populations.
  • Expérience des outils informatiques de traitement des données de séquençage, notamment haut débit.
  • Maîtrise des outils de génomique des populations, notamment ceux adaptés à l'analyse des données de génomes complets à faible couverture pour retracer l'histoire démographique des populations.
  • Maîtrise des outils de détection des signatures de sélection et d'associations génome / environnement.
Qualités requises
  • Savoir faire preuve d'autonomie et de dynamisme.
  • Savoir se adapter à des interlocuteurs ou interlocutrices de différents niveaux.
  • Faire preuve d'un excellent sens relationnel.
Conditions d'emploi

Vous êtes titulaire d'un Doctorat en génétique des populations ou génomique évolutive et avez moins de 2 ans d'expérience dans ce domaine après la thèse.



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    MissionVous rejoindrez l'axe « Écologie et évolution des zoonoses » du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage.ObjectifsVos objectifs seront de :Réaliser l'analyse bioinformatique des nouvelles données de...


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