Ingénieur d'Étude en Bioinformatique et Métagénomique H/F

il y a 4 semaines


GifsurYvette, Île-de-France CNRS Temps plein
Informations Générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur d'Étude en Bioinformatique et Métagénomique (H/F)
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Quotité de travail : Temps complet
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en traitement de données

Mission Principale
Le candidat retenu sera chargé de la conception et de la gestion d'une base de données dédiée aux séquences nucléotidiques et protéiques massives, issues des génomes et métagénomes analysés par l'équipe. Cette base de données devra être régulièrement mise à jour avec des génomes de référence. Une fois en place, le candidat effectuera des analyses de données, en soutien à la recherche, en collaboration avec les chercheurs de l'équipe.

Responsabilités
- Développer et/ou adapter une base de données relationnelle (mySQL, PostgreSQL, MariaDB, etc.) avec des interfaces variées vers des outils CLI et un client web.
- Intégrer les séquences massives dans la base de données et les relier aux métadonnées des échantillons.
- Assurer la maintenance de la base de données et des outils associés en coordination avec l'équipe de recherche.
- Réaliser des analyses de données pour soutenir les projets de recherche.
- Rédiger une documentation technique et un manuel utilisateur.
- Collaborer avec une équipe internationale de chercheurs, doctorants et postdoctorants.

Compétences Requises
- Maîtrise de l'environnement Linux et des outils d'administration web.
- Compétences en SQL pour la gestion de bases de données.
- Expérience dans un langage de programmation pour le développement d'interfaces (Python, JavaScript, PHP).
- Connaissances en développement web (HTML, CSS, JavaScript).
- Familiarité avec les systèmes de gestion de version (type git).
- Connaissances en biostatistiques et apprentissage statistique.
- Bonne maîtrise de l'anglais et du français pour la communication au sein d'une équipe internationale.
- Expérience souhaitée de 2 à 4 ans ou un diplôme de niveau master.

Conditions de Travail
Ce poste est financé par un projet de recherche. La rémunération sera déterminée en fonction de l'expérience du candidat. Une prolongation du contrat pourrait être envisagée, ainsi qu'une possibilité de recherche menant à un doctorat après cette période.

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    Informations générales Intitulé de l'offre : Chercheur postdoctoral en bioinformatique : méthodes avancées d'analyse d'ARN pour la recherche sur le cancer (H/F) Référence : UMR9198-DANGAU-005 Nombre de Postes : 2 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 24 mois Quotité de travail : Temps complet Rémunération : entre 3081 et...


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    Portail des Offres Ingénieur en bioinformatique spécialisé dans l'analyse de données unicellulaires Informations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur en bioinformatique spécialisé dans l'analyse de données unicellulaires Référence : UMR9198-CELHER-003 Nombre de Postes : 1 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat...


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    Informations générales Titre de l'offre : Ingénieur de recherche en Génomique évolutive des Insectes H/F Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 36 mois Quotité de travail : Temps complet Rémunération : entre 2932€ et 3620€ bruts mensuels selon expérience Niveau d'études souhaité : Niveau 7 - (Bac+5 et plus) ...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France SFBI Temps plein

    Offre de rechercheL'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) de l'Université Paris-Saclay recherche un(e) chercheur(e) en bioinformatique pour rejoindre son équipe de recherche.ContexteLe transcriptome du cancer représente une immense diversité de molécules qui commence à peine à être cartographiée. Notre équipe développe des...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps plein

    Poste de Postdoctorant en BioinformatiqueContexteL'I2BC, un institut de biologie moléculaire et cellulaire, recherche un postdoctorant en bioinformatique pour rejoindre son équipe de recherche. Cette équipe est spécialisée dans l'analyse de séquences d'ARN et leur rôle dans le cancer.MissionsMettre en place et exploiter des outils permettant...


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    Poste de Postdoctorant en BioinformatiqueContexteL'I2BC, un institut de biologie moléculaire et cellulaire, recherche un postdoctorant en bioinformatique pour rejoindre son équipe de recherche. Cette équipe est spécialisée dans l'analyse de séquences d'ARN et leur rôle dans le cancer.MissionsMettre en place et exploiter des outils permettant...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps plein

    Détails de l'offreType de contrat : CDD ScientifiqueDurée du contrat : 24 moisQuotité de travail : Temps completRémunération : entre 3081 et 3519€ bruts mensuels selon expérienceNiveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)Expérience souhaitée : IndifférentSection(s) CN : Modélisation mathématique, informatique et physique pour les sciences...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps plein

    Informations Générales Titre de l'Offre : Ingénieur d'étude en Biologie Structurale et Computationnelle (H/F) Type de Contrat : CDD Technique/Administratif Niveau d'études Souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4) Compétences Souhaitées Maitriser la biochimie des protéines recombinante Maitriser les simulations de dynamique moléculaire sur...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps plein

    Poste de Postdoctorant en BioinformatiqueContexteL'I2BC, un institut de biologie moléculaire et cellulaire, recherche un postdoctorant en bioinformatique pour rejoindre son équipe de recherche. Cette équipe est spécialisée dans l'analyse de séquences d'ARN et leur rôle dans le cancer.MissionsMettre en place et exploiter des outils pour identifier des...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps plein

    Contexte de l'offreL'I2BC, un institut de biologie moléculaire et cellulaire du CNRS, recherche un postdoctorant pour rejoindre son équipe de biologie computationnelle. Cette équipe est spécialisée dans l'analyse de données RNA-seq pour identifier des séquences d'ARN spécifiques dans les données tumorales.MissionsLe postdoctorant sera chargé de...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France CEA Temps plein

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    Présentation de l'offre Vous rejoindrez l'équipe du CEA pour participer aux études, à la conception et aux tests d'aimants supraconducteurs HTS dans le cadre de projets de recherche et développement. Vous serez impliqué(e) dans les calculs électromagnétiques et mécaniques, ainsi que dans les actions de R&D engagées autour des...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France KYOCERA Document Solutions France Temps plein

    Présentation de l'entrepriseKYOCERA Document Solutions France est une entreprise innovante qui propose des solutions complètes pour la gestion documentaire et l'impression.Missions principalesProspecter sur le secteur du Loiret ou du Loir-et-Cher afin d'élargir le portefeuille des nouveaux clientsAccomplir des études de besoin par une...


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    Notre équipe de développement de logiciels Nous sommes à la recherche d'un(e) Ingénieur Développement Logiciel – Middleware pour rejoindre notre équipe de développement de logiciels. Votre rôle et vos responsabilités Vous travaillerez dans le domaine de l'électronique de puissance, le traitement du signal, l'acoustique, la...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France Axians CB HPC Temps plein

    Présentation du posteVous rejoindrez l'équipe Axians CB HPC en tant qu'Ingénieur systèmes Linux F/H. Vous serez chargé de la gestion et de l'administration des systèmes Linux, ainsi que de la mise en œuvre de solutions de sécurité et de performance.Compétences requisesExpertise en administration de systèmes Linux (Red Hat, CentOS,...


  • Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps plein

    Présentation du posteL'Ingénieur de recherche administrateur système et réseaux DevOps et Sécurité rejoindra l'équipe Codalab au sein du LISN pour prendre en charge la responsabilité des équipements de l'infrastructure de production de la plateforme Codalab, qui connaît actuellement une forte croissance en raison de son...

  • Ingénieur Transfert

    il y a 2 jours


    Gif-sur-Yvette, Île-de-France CNRS Temps plein

    Contexte de l'offreL'Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) est une unité de recherche du CNRS qui se concentre sur la caractérisation du fonctionnement intégré de la cellule. L'unité est composée d'une soixantaine d'équipes de recherche regroupées dans 5 départements disciplinaires et d'une quinzaine de...