Développeur de pipelines bioinformatiques en génomique évolutive

il y a 2 semaines


Villeurbanne, Auvergne-Rhône-Alpes, France CNRS Temps plein

Présentation de l'offre

L'Université Claude Bernard – Lyon 1, en partenariat avec le CNRS, recherche un(e) post-doctorant(e) pour rejoindre l'équipe Génétique et Évolution des Interactions (GEI) au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE). Le post-doctorat est financé dans le cadre du projet ANR Longevity, qui vise à comprendre les mécanismes moléculaires sous-jacents aux différences de longévité entre mâles et femelles dans différentes espèces.

Missions

Le(la) postdoctorant(e) travaillera dans le domaine de la génomique et de la biologie évolutive en analysant des données de transcriptomique à haut débit obtenues au cours de ce projet. Les tâches principales incluent le développement de pipelines bioinformatiques pour l'analyse de données RNAseq et small RNA, l'analyse différentielle de l'expression, la mise en place de mesures phénotypiques de longévité, ainsi que la participation à des réunions scientifiques et à des activités internes de l'équipe et du laboratoire.

Compétences requises

Le projet nécessite une expertise solide en bioinformatique, notamment dans la mise au point de pipelines robustes et reproductibles, ainsi que dans l'utilisation d'outils statistiques tels que DeSeq2 ou EdgeR. La connaissance de Gene Ontology est également essentielle. De plus, l'expérience dans la réalisation d'expériences de biologie moléculaire (PCRq, RT-qPCR, extraction d'ADN, extraction d'ARN) est nécessaire. La capacité à rédiger et à synthétiser des résultats scientifiques est également importante.

Contexte de travail

Le post-doctorat se déroulera au Laboratoire de Biométrie et Biologie Évolutive (LBBE), au sein de l'équipe Génétique et Évolution des Interactions (GEI). Le LBBE regroupe une centaine de membres permanents, intéressés par des thématiques variées dans le domaine de l'évolution, de l'écologie et de la santé. La personne recrutée sera encadrée par Cristina Vieira du LBBE.

Conditions d'embauche

Le poste est à temps complet, avec une durée de 4 mois. La rémunération est à partir de 3021 € brut mensuel selon l'expérience. Le LBBE offre un environnement de travail stimulant, un accompagnement professionnel et des formations internes. La possibilité de télétravailler est également disponible. Les candidats intéressés doivent s'inscrire sur la plateforme de recrutement du CNRS.



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