Développeur de pipeline bioinformatique pour l'analyse de données de panels

il y a 3 semaines


Paris, Île-de-France SFBI Temps plein
Développement d'un pipeline bioinformatique pour l'analyse de données de panels

L'objectif de ce projet est de développer un pipeline bioinformatique pour l'analyse de données de panels. Le pipeline devra être capable de traiter les données de séquençage et de produire des résultats précis et fiables.

Compétences requises :

  • Bonne maîtrise des langages Python et Bash.
  • Connaissance de Snakemake.
  • Expérience de l'environnement Linux/Unix.
  • Familiarité avec les données de short read sequencing.
  • Connaissances en bioinformatique : contrôle qualité, mapping, variant calling.

Compétences personnelles recherchées :

  • Excellentes qualités relationnelles et sens du travail en équipe.
  • Bonnes capacités organisationnelles et de communication.
  • Rigueur, autonomie, et dynamisme.
  • Curiosité, adaptabilité, et capacité à anticiper.
  • Intérêt marqué pour les sciences biologiques et/ou médicales.
  • Adhésion aux valeurs du service public et au domaine de la santé.
  • Esprit de partage des connaissances et des compétences.

Informations complémentaires :

Durée du projet : 6 à 8 mois.

Dossier de candidature : Envoyer une lettre de motivation et un CV à :

  • ismael.padioleau@aphp.fr
  • guillaume.meurice@aphp.fr
  • mathilde.bertrand@aphp.fr

Procédure : Envoyer un email aux contacts.


  • Ingénieur en bioinformatique

    il y a 4 semaines


    Paris, Île-de-France AP-HP Temps plein

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  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

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  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

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  • Ingénieur en données

    il y a 3 semaines


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  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

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  • Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

    Présentation du posteL'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un Développeur full stack pour contribuer au développement d'un outil de courtage de données, Madbot, qui vise à collecter, gérer, analyser et diffuser des données et des métadonnées vers les entrepôts internationaux.MissionsLe candidat sélectionné contribuera aux...


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    Présentation du posteL'Institut Français de Bioinformatique (IFB) recrute un Développeur full stack pour contribuer au développement d'un outil de courtage de données, Madbot, qui vise à faciliter le flux des données et la gestion des métadonnées de recherche.MissionsLe candidat sélectionné contribuera aux développements de...


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    Informations généralesTitre de l'offre : Développeur full stack pour un outil de courtage des donnéesRéférence : CNRSMissionsConcevoir et développer l'application de courtage de données, qui vise à collecter, gérer, analyser et diffuser des données et des métadonnées vers les entrepôts internationaux.ActivitésConcevoir et développer...


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    Développeur Full Stack pour un Outil de Courtage de DonnéesL'objectif de ce poste est de concevoir et développer un outil de courtage de données pour collecter, gérer, analyser et diffuser des données et des métadonnées vers les entrepôts internationaux.ResponsabilitésAnalyser les besoins et concevoir de nouvelles fonctionnalités dans...


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    Développeur Full Stack pour un Outil de Courtage de DonnéesL'objectif de ce poste est de concevoir et développer un outil de courtage de données pour collecter, gérer, analyser et diffuser des données et des métadonnées vers les entrepôts internationaux. Vous travaillerez en étroite collaboration avec les projets nationaux pour intégrer les...


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