Emplois actuels liés à Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique - BagnolssurCèze, Occitanie - CEA

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 1 semaine

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre consiste à développer de nouvelles fonctionnalités pour un pipeline de typage par le séquençage de peptides, utilisé dans des applications en protéomique microbienne et métaprotéomique. Le projet vise à tester de nouveaux concepts, les intégrer et valider les performances.Sous l'encadrement d'un...

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre est axée sur l'amélioration du pipeline de typage par le séquençage de peptides pour des applications en protéomique microbienne et métaprotéomique. La plateforme ProGénoMix est reconnue mondialement pour ses capacités en ce domaine. Le projet vise à tester de nouveaux concepts, les intégrer et valider les...

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre consiste à développer de nouvelles fonctionnalités pour un pipeline de typage par le séquençage de peptides, utilisé dans la protéomique microbienne et métaprotéomique. Le projet vise à tester de nouveaux concepts, les intégrer et valider les performances.Sous l'encadrement d'un ingénieur de recherche...

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

    il y a 3 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet consiste à développer de nouvelles fonctionnalités pour un pipeline de typage par le séquençage de peptides,...

  • Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique microbienne et métaprotéomique

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre consiste à développer de nouvelles fonctionnalités pour la plateforme ProGénoMix, une plateforme mondialement reconnue en protéomique microbienne et métaprotéomique. Le candidat aura à intégrer de nouveaux outils de mises en correspondance spectres MS/MS – séquence de peptides et à sélectionner et appliquer...

  • Ingénieur de développement informatique LI2D H/F

    il y a 1 mois

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à améliorer le pipeline existant de typage par le séquençage de peptides, permettant des applications en...

  • Ingénieur de développement en informatique pour Li2D

    il y a 4 jours

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre est axée sur le développement d'applications innovantes dans le domaine de la détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse au Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet consiste à améliorer le pipeline existant de typage par séquençage de peptides,...

  • Ingénieur de développement informatique LI2D H/F

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Un pipeline de typage par le séquençage de peptides permet des applications en protéomique microbienne et...

  • Ingénieur informatique industrielle

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem GmbH Temps plein

    Accélérons la transition énergétiqueNous sommes à la recherche d'un ingénieur informatique industriel pour rejoindre notre équipe de développement d'applications. Vous serez chargé de concevoir et de mettre en œuvre des solutions innovantes pour accélérer la transition énergétique.ResponsabilitésConcevoir et développer des applications pour...

  • Ingénieur en développement informatique

    il y a 6 jours

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Présentation du posteFonction : Ingénieur en développement informatiqueCe poste est rattaché au Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D), une unité du CEA, et est placé sous l'encadrement d'un ingénieur de recherche senior en informatique-bioinformatique.Objectifs du projetLe projet consiste à développer de...

  • Ingénieur-chercheur en informatique scientifique

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Ingénieur-chercheur en informatique scientifiqueNous recherchons un ingénieur-chercheur en informatique scientifique pour rejoindre notre équipe de recherche et développement.Compétences requisesMaîtrise des langages de programmation Python et C++Connaissance des réseaux de neurones et de l'apprentissage automatiqueExpérience en simulation numérique...

  • Ingénieur de développement informatique LI2D H/F

    il y a 4 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à évoluer le pipeline existant, écrit en Python, permettant la caractérisation taxonomique et fonctionnelle...

  • Ingénieur de développement informatique LI2D H/F

    il y a 1 mois

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'offreL'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Le projet vise à évoluer le pipeline existant, écrit en Python, permettant la caractérisation taxonomique et fonctionnelle...

  • Ingénieur en Automatisme

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France ASSYSTEM Temps plein

    Présentation du posteNous recherchons un Ingénieur en Automatisme / Informatique Industrielle pour rejoindre notre équipe de développement de systèmes de contrôle-commande. Vous serez chargé de prendre en charge les prestations d'études, de s'occuper des consultations et d'assurer le suivi des études d'exécution et de réalisation.MissionsPrendre...

  • Ingénieur Contrôle-Commande Informatique

    il y a 1 mois

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Description de l'OffreEn tant qu'Ingénieur Contrôle-Commande, vous rejoignez l'équipe du CEA pour contribuer à la maintenance et au développement de l'infrastructure de l'installation Atalante.Missions PrincipalesPilotage et suivi de projets associés aux besoins d'évolution de procédés de R&DÉtudes préalables à la réalisation de...

  • Ingénieur Informatique Industrielle H/F

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem GmbH Temps plein

    Description du PosteVous rejoignez l'équipe d'Assystem, leader dans le domaine de l'ingénierie nucléaire, en tant qu'Ingénieur Informatique Industrielle. Sous la responsabilité d'Estelle, en charge de la coordination technique des projets en informatique industrielle, vous intégrez une équipe hautement impliquée dans les...

  • Ingénieur-chercheur en informatique scientifique

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Ingénieur-chercheur en informatique scientifiqueVous rejoindrez l'équipe du CEA pour travailler sur la mise en place d'un réseau de neurones pour prédire des perturbations d'écoulement d'air à partir d'une base de données de simulations CFD.Vous serez chargé de l'entraînement des réseaux de neurones sur une base de données...

  • Ingénieur commercial numérique et ingénieurie spécialisé

    il y a 2 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France AGAP2 France Temps plein

    Présentation du posteVous rejoindrez l'équipe d'AGAP2 France en tant qu'Ingénieur commercial numérique et ingénierie spécialisé. Vous serez chargé de développer et de mettre en œuvre des stratégies commerciales pour les clients de l'entreprise.Compétences requisesMaîtrise de la langue françaiseConnaissance de l'ingénierie...

  • Ingénieur-chercheur en informatique scientifique

    il y a 3 semaines

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France CEA Temps plein

    Stage en Ingénieur-chercheur en informatique scientifiqueLe CEA recherche un stagiaire pour rejoindre son équipe de recherche en informatique scientifique. Le stage consiste à développer des modèles d'intelligence artificielle pour prédire les perturbations d'écoulement d'air engendrées par des obstacles.Compétences requisesRéseaux de...

  • Ingénieur Informatique Industrielle H/F

    il y a 1 mois

    Bagnols-sur-Cèze, Occitanie, France Assystem GmbH Temps plein

    Description du Poste Nous recherchons un Ingénieur Informatique Industrielle H/F pour rejoindre notre équipe de développement de solutions. Vous serez chargé de mettre en œuvre des solutions de supervision et de contrôle pour les projets industriels. Vous travaillerez en binôme avec un ingénieur confirmé pour mettre en œuvre des programmes...

Ingénieur de développement informatique spécialisé en protéomique

Il y a 2 mois

BagnolssurCèze, Occitanie, France CEA Temps plein
Description de l'offre

L'offre s'inscrit dans les activités innovantes de détection d'organismes et de marqueurs par spectrométrie de masse du Laboratoire Innovations technologiques pour la Détection et le Diagnostic (Li2D). Un pipeline de typage par le séquençage de peptides permet des applications en protéomique microbienne et métaprotéomique, domaines dans lequel la plateforme ProGénoMix est mondialement reconnue.

Le projet s'inscrit dans le besoin d'évolution du pipeline existant, écrit en Python, permettant la caractérisation taxonomique et fonctionnelle d'échantillons inconnus. Le projet permettra de tester de nouveaux concepts, les intégrer, et valider les performances.

Missions principales
  1. Tester et intégrer divers outils récents de mises en correspondance spectres MS/MS – séquence de peptides (DDA, DIA, de novo…) dans le process global de protéotypage, dans une démarche de simplification et optimisation.
  2. Sélectionner et appliquer des méthodes de classification ou de régression par IA (PyTorch, sélection de features, modèles…).
  3. Optimiser les bases de données d'organismes utilisées pour un compromis couverture / rapidité / empreinte mémoire, en intégrant les nouveaux séquençages d'organismes (isolats, MAGs, SAGs …).
  4. Définir, mettre en œuvre et valider un estimateur de confiance global (Python, R).
Compétences requises

Formation : niveau Master 2 débutant

Compétences en développement/rationalisation de code Python, compétences ou intérêt pour les méthodes de classification/régression IA, connaissances SQL.