Ingénieur en Bioinformatique pour le Déploiement de Ressources Haute Performance et Intelligence Artificielle
il y a 1 semaine
Job Title: Ingénieur en Déploiement d'Applications sur Ressources Haute Performance et Intelligence Artificielle
Company: CNRS
Job Type: Full-time
Contract Type: Fixed-term contract
Duration: 24 months
Location: Paris
Job Summary:
We are seeking an experienced Ingénieur en Déploiement d'Applications sur Ressources Haute Performance et Intelligence Artificielle to join our team at CNRS. The successful candidate will be responsible for deploying applications on high-performance resources and artificial intelligence.
Key Responsibilities:
- Assure a role of counsel and expertise to the applications bioinformatics of the project for their description logicielle and the evaluation of their needs.
- Analyse the needs and pilot the deployment of the software and pipelines bioinformatics of the project on the resources of calculation HPC/AI.
- Organize and supervise the integration of the data of the project with a plan of management (PGD).
- Evaluate the performances of the solutions logicielles of the applications scientific.
- Supervise the maintenance of the solutions logicielles in condition opérationnelle.
- Define and update the technical and functional documentation.
- Perform a technological watch.
- Assure the assistance to the partners of the project.
- Form the users to the use of the solutions logicielles deployed.
- Organize the meetings of the project.
Requirements:
- Master in bioinformatics or computer science.
- General mastery of the standard software tools in bioinformatics.
- Mastery of the formats of data in bioinformatics.
- Mastery of the Linux environments and the languages (shell, python, R).
- Mastery of the tools of management of versions of the source codes deployment continuous (git, GitLab, GitLab CI/CD)
- Knowledge of the common workflow managers in bioinformatics (nextflow, snakemake).
- Knowledge of the calculation environments related to the high-performance calculation (HPC) and artificial intelligence (AI).
- Knowledge of the techniques of containerization (apptainer/singularity, docker, podman)
- Understanding of the English oral and written: B1 to B2 (European framework of reference for languages).
- Ability to work in project mode and in team.
- Reactivity, autonomy, initiative, rigor.
- Sense of organization.
- Team spirit and sense of collaboration.
- Ability to work in network, with the modern digital tools (instant messaging, videoconferencing).
Working Context:
The post will be located on the platform of the Curie Institute in Paris.
The French Institute of Bioinformatics (IFB) is a national infrastructure that brings together 35 platforms and research teams in bioinformatics, and a coordinating unit, IFB-Core (UAR 3601). The IFB deploys on the entire national territory bioinformatics services: computing infrastructure, software and databases, biological data analysis, data management, training.
The Mutualized Digital Spaces for FAIR Life and Health Sciences (MUDIS4LS, PIA3 ESR/Equipex+) project finances the equipment of the entire national network of computational resources (NNCR) of the IFB, and innovative developments to facilitate data management, and support to the communities of life sciences (microbiology, health, agronomy, environment).
In this context, the IFB recruits an Ingénieur en Déploiement d'Applications sur Ressources Haute Performance et Intelligence Artificielle to deploy bioinformatics resources useful for applying high-performance calculation (HPC) and artificial intelligence (AI) to biological data (an experience in HPC and/or AI will be appreciated).
The bioinformatics platform of the Curie Institute is composed of 20 bioinformaticians, biostatisticians and software engineers, who offer a multidisciplinary expertise and provide support to the biotechnological platforms of CurieCoreTech, as well as to the research units and hospital in their daily activities. The skills are on data management and analysis, software development and scientific computing.
The recruited person will be trained on arrival to the tools and techniques implemented in a scientific computing infrastructure. They will integrate into their welcoming team, and participate, on site and remotely, to the relevant IFB working groups for their mission. The work will require occasional travel in France and abroad to participate in meetings, training or events.
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il y a 6 jours
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