Post-doc en écologie analyse Spatialement

**Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. Vous serez accueilli-e au sein de notre UMR implantée sur le site de L'institut Agro à Rennes (35). L'unité conduit des recherches en écologie des populations et des communautés sous contraintes anthropiques en identifiant les déterminants de l'état de santé des écosystèmes et de leurs ressources au sein d'un continuum de milieux aquatiques, avec de nombreux parteneriats dont l'OFB. **Environnement de travail, missions et activités**: **Contexte** La communauté scientifique internationale s’accorde sur le fait que parmi les principales causes de déclin de la biodiversité (e.g. changement climatique, pollution chimique, surexploitation), l’altération des habitats a un rôle très important. En Europe, et notamment en France métropolitaine, cette pression anthropogénique sur les habitats menace, de manière croissante, l’intégrité des cours d’eau. En France métropolitaine, les écosystèmes sont parcourus par un réseau dense de cours d’eau, dont la longueur totale cumulée représente ~430 000 km. Les cours d’eau sont le support d’une biodiversité importante et nécessaire au bon fonctionnement de l’écosystème aquatique (e.g. recyclage de la matière organique, dépollution) mais aussi au fonctionnement de l’écosystème terrestre adjacent (e.g. ressource d’énergie et de nutriments). En dépit d’une multitude d’études scientifiques portant sur le lien entre les habitats et la biologie, des lacunes dans nos connaissances subsistent et limitent la définition de mesures de préservation et de restauration appropriées. Ces lacunes peuvent se résumer en trois questions : (1) à quelle(s) échelle(s) spatiale(s) d’observation, l’altération des habitats est la plus prégnante ? (2) cette échelle dépend-t-elle du type de cours d’eau considéré (e.g. taille du cours d’eau, position amont/aval dans le bassin versant)? (3) quelles sont les conséquences de ces altérations, aux différentes échelles d’observation ; sur trois compartiments biologiques clefs des cours d’eau : les diatomées benthiques, les macroinvertébrés benthiques, et les poissons ? Si les communautés de macroinvertébrés et de diatomées benthiques et les communautés piscicoles sont réputées pour être sensibles aux pressions environnementales, notamment celles liées aux changements hydromorphologiques des cours d’eau, elles sont cependant rarement étudiées conjointement pour une meilleure compréhension et une vision intégrée du fonctionnement des cours d’eau. De plus, les tentatives pour étudier les effets des pressions hydromorphologiques sur les communautés biologiques à différentes échelles spatiales d’observation sont quasi inexistantes. **Objectif et missions** **Le projet HYMOBIO a pour objectif d’intégrer et de comparer les réponses taxonomiques et fonctionnelles des communautés de diatomées benthiques, de macroinvertébrés benthiques et de poissons, à l’altération des habitats. Cet objectif sera adressé via l’examen croisé des modifications des caractéristiques hydromorphologiques des cours d’eau mesurées à différentes échelles spatiales et des réponses de métriques taxonomiques et fonctionnelles (e.g. basées sur les traits biologiques des organismes) pertinentes au sein des assemblages floristiques et/ou faunistiques.** Ce projet s’appuiera notamment sur différents jeux de données déjà constitués: - les listes faunistiques et floristiques (richesse taxonomique et abondances) documentées sur > 1900 stations échantillonnées en France métropolitaine entre 2004 et 2020 (données publiques : OFB); - les bases de données sur la caractérisation et les altérations hydromorphologiques des cours d’eau (CARHYCE, SYRAH-CE, OSO, Corine Land Cover); - un jeu de données unique sur les traits fonctionnels (e.g. capacités de dissémination, mode d’alimentation) des taxons des trois compartiments biologiques analysés (données scientifiques : porteurs de l’action et leurs collaborateurs). Ce **projet HYMOBIO**, via le développement d’un outil de diagnostic évaluant les probabilités d’impact des altérations hydromorphologiques sur les communautés biologiques (macroinvertébrés benthiques, diatomées benthiques, poissons) s’inscrit ainsi dans l’étape préliminaire, mais essentielle, du processus d’aide à la décision en matière de préservation ou de restauration du fonctionnement des cours d’eau et des communautés biologiques qui y vivent. Trois étapes de travail sont distinguées: - Caractériser les effets potentiellement concomitants de pressions hyd