Offre de Stage de M2 de 6 Mois en Statistiques

**Offre de stage de M2 de 6 mois en statistiques / écologie**
- **Réalisation d’un modèle statistique pour identifier les zones vulnérables à l’émergence de maladies piscicoles**_

**Contexte**

En France, la pêche de loisir est encadrée par un réseau associatif agréé, organisé de manière pyramidale, de l’échelon communal au national. Les Fédérations Départementales de Pêche et de Protection du Milieu Aquatique (FDPPMA) en particulier correspondent au niveau opérationnel de ce réseau. Structures agréées pour la protection de l’environnement, elles mettent notamment en œuvre diverses actions pour la préservation de la biodiversité aquatique (acquisition de connaissance, études, restauration des milieux et de la continuité écologique ).

En Occitanie, les FDPPMA et l’Association Régionale Pêche Occitanie (ARPO) travaillent depuis quelques années sur la maladie rénale proliférative (MRP ou PKD en anglais). Cette infection, provoquée par le parasite _T. bryosalmonae, _touche particulièrement les truites, provoquant dans certains cas des mortalités importantes des alevins. Par ailleurs, elle semble favorisée par une élévation de la température de l’eau. Dans un contexte de réchauffement climatique, provoquant notamment une hausse des températures estivales et une baisse des débits, le développement de cette maladie est un sujet d’actualité et de préoccupation pour nos structures.

Entre 2019 et 2021, l’ARPO et les FDPPMA ont réalisé un diagnostic de la maladie en région. Cette action collective a permis de mettre en évidence des secteurs infectés. En parallèle de cette étude, une thèse réalisée par Eloïse DUVAL, encadrée par Simon BLANCHET (CNRS), a permis d’identifier des paramètres influençant la présence de propagules libres du parasite _T. bryosalmonae_ dans l’eau et sur la prévalence de l’infection chez les truites.

L’enjeu de la mission consiste à identifier des profils de cours d’eau vulnérables à l’émergence de la PKD, grâce à l’analyse statistique des données disponibles (prévalence des sites diagnostiqués et variables environnementales). L’objectif est d’identifier les facteurs environnementaux qui influencent le plus l’émergence de la maladie. Ces informations permettront d’orienter les futures mesures de gestion.

**Pour mener à bien sa mission, le stagiaire devra effectuer plusieurs actions**:

- 1/ Travail bibliographique (truites, PKD, parasitologie, analyses statistiques descriptives, modèles prédictifs, paramètres influençant le développement du complexe parasitaire, métriques environnementales, analyse spatiale pour la récupération des variables environnementales sous Qgis, etc)
- 2/ Rassemblement des données existantes définies préalablement (prévalence de la PKD, densité et abondance de truites, métriques de thermie, métriques de débits, ou autres métriques environnementales (altitude, occupation du sol,)...)
- 3/ Réalisation d’analyses statistiques descriptives pour notamment décrire le jeu de données, le lien avec les variables environnementales (telles que des analyses multivariées)
- 4/ Réalisation d’un modèle pour identifier les variables expliquant la présence de la PKD
- 5/ Interpolation spatiale des résultats précédents afin de définir des zones vulnérables à l’émergence de la maladie

Différents interlocuteurs (ARPO et FDPPMA) viendront par ailleurs en appui régulier et complétera au besoin ponctuellement le travail réalisé par le stagiaire, au niveau tant des recherches bibliographiques que de l’exploitation des données. Il est également prévu que Simon BLANCHET (CNRS) apporte son expertise et appui au travail réalisé.

**Profil et compétences requises du stagiaire**:

- Intérêt bien marqué pour l’écologie et les écosystèmes aquatiques
- Capacité à travailler dans un cadre pluridisciplinaire
- Maîtrise d’outils statistiques (comme R)
- Maîtrise de Qgis
- Qualités d’expression orale et écrite
- Disponibilité, sens de l’initiative, curiosité, aptitude à l’innovation.

Niveau d’études : Master 2.

**Informations pratiques**
- Accueil et encadrement du stagiaire : Maison Régionale de la Chasse, de la Pêche et de la Nature à Montpellier
- Les éventuels déplacements effectués dans le cadre du stage seront pris en charge.
- Indemnisation conforme à l’échelon standardisé pour la rémunération des missions de stage.
- Durée de stage de 6 mois à plein temps à partir de février 2026.

Type d'emploi : Stage
Durée du contrat : 6 mois

Lieu du poste : En présentiel