Chargé de Recherche

08-11-2024

**Chargé de recherche - 'Influence des proliférations de cyanobactéries et des métabolites bioactifs' (F/H)**:

- Date limite
- 08-11-2024
- Date de publication
- 09-10-2024
- Contrat
- Contrat de projet
- Catégorie
- A
- Direction / Service
- UMR 7245 MOLÉCULES DE COMMUNICATION ET ADAPTATION DES MICRO-ORGANISMES (MCAM)
- Localisation
- 75 - Paris - Tous sites

**Contexte du recrutement et définition de poste**:
**Description de la problématique de recherche - Project description**
**Contexte **:Cette étude explore les dynamiques complexes entre les efflorescences de cyanobactéries, le microbiote des poissons et la santé globale des écosystèmes aquatiques, présentant un défi dans le cadre du concept One-Health.
Au sein des environnements lacustres, les recrudescences des efflorescences de cyanobactéries toxinogènes sont parmi les stress naturels exacerbés par les changements globaux et l'eutrophisation de l'eau due aux activités humaines. Elles représentent des menaces notables pour la santé des organismes aquatiques et le fonctionnement des écosystèmes, ainsi qu’un risque sanitaire avéré, de par notamment la production par différentes cyanobactéries de métabolites secondaires bioactifs, dont certains sont des toxines règlementées. Une préoccupation particulière existe quant à la bioaccumulation des cyanotoxines chez les poissons, qui constituent à la fois des sentinelles de la contamination environnementale et de vecteurs potentiels de ces toxines.
Alors que les effets de certains métabolites cyanobactériens, tels que la microcystine-LR, sur les vertébrés sont bien documentés, l'impact des efflorescences de cyanobactéries sur les populations naturelles de poissons, en particulier sur la structure et les fonctions de leur microbiote intestinal, reste mal compris. Étant donné qu’on dénombre plus de 2300 métabolites cyanobactériens répartis dans 260 familles chimiques distinctes, des effets significatifs sur le microbiote des poissons sont attendus. Le microbiote des poissons, agissant comme première ligne de défense et jouant un rôle crucial dans la santé animale, est directement exposé à ces métabolites, soulignant son importance dans la compréhension des mécanismes toxicologiques chez les vertébrés et la transmission des toxines le long de la chaîne alimentaire.

**Objectifs **:Le projet décrit ici vise à combler ce manque de connaissances en examinant les effets d'un large spectre de métabolites isolés de différentes espèces de cyanobactéries impliquées dans les épisodes d'efflorescences en région Île-de-France, notamment sur le microbiote des poissons. À travers une combinaison d'expériences menées in vivo sur différentes espèces de poissons et d'études in vitro sur des cultures de bactéries isolées du microbiote intestinal des poissons, et en utilisant des techniques de microbiologie, de chimie analytique et de génomique avancées, le projet cherche à démêler les interactions complexes entre les métabolites cyanobactériens, le microbiote et la santé des poissons. Le projet testera trois hypothèses : (1) Les différentes espèces de cyanobactéries induisent des effets différents sur le microbiote intestinal des poissons ; (2) Les effets positifs ou négatifs sur ces bactéries du microbiote sont dus à l’action de certains métabolites bio-actifs ; (3) Ces métabolites sont susceptibles d’avoir ainsi des effets notables à court et à long terme sur la santé de l’ichtyofaune et sur sa contamination par les cyanotoxines.

**Résultats attendus **:L’effet des différentes souches et métabolites sur la composition du microbiote intestinal et le niveau de contamination des poissons en cyanotoxines sera évalué. Les tests d'activité antibactérienne mettront en évidence les effets spécifiques des métabolites sur le microbiote des poissons. Les résultats attendus incluent l'identification de nouveaux composés antibactériens ou probiotiques, l'élucidation de leurs mécanismes d'action et l'évaluation de leurs impacts sur la composition du microbiote des poissons et la contamination par les cyanotoxines. Ces résultats conduiront à des publications dans des revues à fort facteur d’impact. Le chargé de recherche recevra une formation complète et des opportunités de participation à des conférences, favorisant à la fois l'expertise technique et les compétences en gestion de projet et contribuant à notre compréhension des interactions entre efflorescences de cyanobactéries, microbiote des poissons et santé des écosystèmes aquatiques.

Le(la) chargé(e) de recherche pilotera les expérimentations des poissons ainsi que des souches de bactéries intestinales sous la supervision des personnels qualifiés de l’animalerie et du service de bactériologie de l’UMR7245 MCAM. Il(elle) sera formé(e) et réalisera les étapes d’extraction de métabolites et d’ADN, de production et