Post Doctorat

44000 NANTES _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. **Environnement de travail, missions et activités**: **Environnement de travail, missions et activités** Vous exercerez votre activité au sein de l'UMR 1014 Secalim (SECurité des ALIments et Microbiologie), une unité mixte de recherche impliquant l’INRAE et Oniris. L’UMR 1014 Secalim conduit des recherches interdisciplinaires sur la microbiologie, la sécurité des aliments et les relations entre facteurs environnementaux et pathogènes microbiens, dans un but de caractériser et maîtriser le risque microbien dans les produits alimentaires. Votre mission consistera à étudier l'impact des variations climatiques sur les risques alimentaires liés à Salmonella. Le changement climatique constitue l'un des principaux défis pour la sécurité alimentaire mondiale. L’augmentation des températures, les périodes de sécheresse, les inondations et les événements climatiques extrêmes perturbent la production, le stockage et la distribution des aliments. Ces bouleversements amplifient également les risques liés à la présence de bactéries pathogènes comme Salmonella qui est la deuxième cause de zoonoses dans l'Union européenne après Campylobacter, avec plus de 91 000 cas signalés chaque année. Malgré des normes strictes en matière d'hygiène et de sécurité, ce pathogène reste une menace persistante, avec une forte corrélation entre les températures estivales élevées et l'augmentation des cas d’infections alimentaires (EFSA & ECDC, 2023). Les impacts du changement climatique ne sont pas uniformes. En Europe, les régions climatiques océanique (ex. : ouest de la France) et continentale (ex. : Pologne) présentent des caractéristiques environnementales distinctes qui influencent la répartition et la virulence des sérovars de Salmonella. Bien que certaines études aient exploré ce phénomène en Amérique du Nord (Morgado et al., 2021) et en Australie (Milazzo et al., 2016), peu de recherches ont été menées sur l’impact climatique dans le contexte européen, où les sérovars et les conditions environnementales diffèrent. Le/La post-doctorant(e) analysera l'impact des variations climatiques sur la répartition des sérovars de Salmonella, en utilisant des approches de sérotypage, de modélisation et de machine learning appliquées à des données épidémiologiques et climatiques collectées en France et en Pologne, avec pour objectif d'améliorer la prévention et la gestion des risques alimentaires dans le contexte des évolutions climatiques. Vous serez plus particulièrement en charge de: - Corréler les données de distribution des sérovars de Salmonella avec les données climatiques issues des plateformes européennes (Copernicus, AGRI4CAST, MétéoFrance, etc.) à l'aide d'outils de type " machine learning " - Modéliser et prévoir les risques à l'aide d'outils quantitatifs afin d'évaluer les effets du changement climatique sur la contamination des aliments et de proposer des mesures d'adaptation et de prévention des risques. - Intégrer cette évaluation des risques dans une approche coût-bénéfice plus globale pour optimiser la sécurité alimentaire tout en réduisant les impacts environnementaux et/ou économiques. De plus, vous pourriez être amené à collecter des données et à les analyser en France et en Pologne sous la supervision de microbiologistes **Conditions particulières d’activité**: - **Déplacements ponctuels en Pologne (90% du travail effectué à Nantes, France) pour des collectes de données, des réunions de projet et des expérimentations sur les sérovars de Salmonella.**: - **Participation à des congrès scientifiques pour diffuser les résultats de recherche** **Formations et compétences recherchées**: **Doctorat** Formation recommandée : Docteur en biostatistiques, data science, modélisation. Connaissances souhaitées : Maîtrise des outils de machine learning et des logiciels d’analyse statistique (R, Python). Expérience appréciée : traitement et analyse de données climatiques Aptitudes recherchées : capacité à travailler dans un environnement multidisciplinaire ; autonomie, rigueur et esprit d’initiative ; excellentes compétences en communication écrite et orale. **Votre qualité de