Chargé de Recherche « Surveillance Des Poissons Pélagiques Côtiers Par échoso..

27-11-2025- **Chargé de recherche « Surveillance des poissons pélagiques côtiers par échosondage » (F/H)**:

- Date limite
- 27-11-2025
- Date de publication
- 30-10-2025
- Contrat
- Poste temporaire : Contractuel de droit public
- Catégorie
- A
- Direction / Service
- PATRIMOINE NATUREL (PATRINAT)
- Localisation
- 35 - Station de biologie marine de Dinard

**Contexte du recrutement et définition de poste**:
L’Unité Patrimoine Naturel (PatriNat) - co-habilitée par le Muséum national d’Histoire naturelle (MNHN), l’Office français de la biodiversité (OFB), le Centre national de la recherche scientifique (CNRS) et l’Institut de recherche pour le développement (IRD) - a pour mission de produire une expertise scientifique et technique en faveur de la conservation de la biodiversité.

** CONTEXTE**

Dans le cadre de la Directive Cadre Stratégie pour le Milieu Marin (DCSMM), les référents Poissons de l’équipe Expertise en Ecologie Marine de PatriNat, contribuent au développement méthodologique du programme de surveillances et à l’évaluation (du Bon Etat Ecologique et des Objectifs Environnementaux) des poissons côtiers pélagiques et récifaux à l’échelle nationale métropolitaine.

Pour répondre aux besoins de surveillance et d’évaluations des poissons côtiers pélagiques et récifaux, PatriNat et un ensemble de partenaires dont le MNHN, travaillent au développement de plusieurs dispositifs complémentaires. Les poissons pélagiques côtiers sont étudiés par acoustique active dans le cadre du programme ACaPELA (ACoustique PELAgique) initié dès 2019 au sein de plusieurs sites bretons. L’évaluation des abondances, biomasses et spectres de tailles des principales espèces récifales est réalisée par comptage visuels (en plongée et/ou vidéos) via le réseau « Pocoroch » initié dès 2016 en Manche/Atlantique. Enfin, pour mieux couvrir les espèces rares et cryptobenthiques, un inventaire par metabarcoding d’ADNe a été mis en place récemment (2023). En 2026, le projet ESPOC (Evaluation et Surveillance des POissons Côtiers) permettra la continuité des inventaires de chacun des dispositifs au sein des sites historiques. Il permettra aussi de déployer de manière cohérente les 3 dispositifs de suivis dans les secteurs suivants : Baie de Saint Malo, RNN Sept-îles/Roches Douvres, Baie de Morlaix, Iroise et RNN Glénans.

ACaPELA (ACoustique PELagique) est un projet démarré en Juillet 2019 qui a pour objectif de développer les bases méthodologiques d’une surveillance DCSMM des poissons côtiers des milieux pélagiques côtiers au niveau national par échosondage. Les protocoles d’échantillonnages proposés consistent en une adaptation aux contraintes côtières des protocoles d’échosondage et de pêche sur détection utilisés par les campagnes halieutiques PELGAS (PELagiques GAScogne) et PELMED (PELagiques MEDiterrannée). Ces adaptations consistent notamment à combiner l’utilisation de deux technologies acoustiques complémentaires, des sondeurs larges bandes orientés verticalement sous le navire et un sonar multifaisceaux. Les radiales acoustiques sont effectuées chaque année en Bretagne Nord (Baie de Saint Malo, Baie de Morlaix) et Bretagne Sud (Iroise dont rade de Brest et Baie de Douarnenez) au printemps et/ou en été quand les biomasses de poissons pélagiques sont les plus importantes. Les embarquements ont lieu sur les navires de station de la flotte océanographique de France R/V Albert Lucas pour l’Iroise (rade de Brest et Baie de Douarnenez), R/V Néomysis pour la Baie de Morlaix. A Saint Malo, les radiales sont réalisées avec le navire de la Station Marine de Dinard (R/V Korrigane). En fonction de leurs disponibilités et périmètres d’action, ces navires pourraient être également mobilisés en 2026 pour les secteurs de RNN Sept-îles/Roches Douvres et RNN Glénans.

** DESCRIPTION DES MISSIONS**

En collaboration étroite avec le référent Amphihalins, poissons côtiers et espèces patrimoniales, le titulaire du poste aura pour missions de
- Organiser et mettre en œuvre les campagnes acoustiques 2026 (appels à projets FOF, logistique, hébergement, gréage des navires, installation des sondeurs).
- Planifier et mettre en œuvre des prélèvements d’eau lors des radiales acoustiques en vue d’analyses ultérieures d’ADN environnemental
- Bancariser les données et assurer le dépôt des données acoustiques nouvellement collectées dans la base Indores (CNRS)
- Analyser les métriques acoustiques (proxy d’abondance) et déterminer les sources de variabilités spatiales et temporelles des signaux acoustiques (déclinés par espèce ou groupe d’espèces)
- Assurer la rédaction des livrables associés au programme : rapport de campagne et rapport d’analyses (évolution des proxys d’abondance au sein de chaque site)

**Profil recherché**:
**CONDITIONS ADMINISTRATIVES REQUISES**

Être titulaire d’un Doctorat ou Master (Universitaire ou école d’ingénieur) idéalement en acoustique ou écologie aquatique.

** QUALIFICATIONS REQUISES**
- Expérience en acoustique, bio(géo)statisti