Chargé de Mission Recherche « Elaboration D’un Observatoire Multi-sources de ..

23-01-2025

**Chargé de mission recherche « Elaboration d’un Observatoire multi-sources de la réponse des peuplements de poissons récifaux européens face au changement global » (F/H)**:

- Date limite
- 23-01-2025
- Date de publication
- 24-12-2024
- Contrat
- Poste temporaire : Contractuel de droit public
- Catégorie
- A
- Direction / Service
- UMR BOREA, EN COLLABORATION AVEC UAR PATRINAT ET UMR MARBEC
- Localisation
- 35 - Station de biologie marine de Dinard

**Contexte du recrutement et définition de poste**:
**PRÉAMBULE**

Dans le domaine des sciences naturelles et humaines, le Muséum contribue à la production, au développement et au partage des connaissances sur la diversité géologique et biologique de la Terre, sur la diversité des cultures et des sociétés et sur l'histoire de la planète. À cette fin, le MNHN a pour mission de développer en synergie la recherche fondamentale et appliquée, l'expertise, la valorisation, l'enrichissement, la conservation et la mise à disposition des collections et des données, la formation dont l'enseignement, l'action éducative, et la diffusion de la culture scientifique et technique à l'intention de tous les publics.

**CONTEXTE**

Le MNHN développe à Dinard - grâce à sa station marine et aux unités qu’elle accueille (UMR ISYEB, UMR BOREA et UAR PatriNat) - un programme de recherche et d’observation sur l’analyse des réponses de la biodiversité marine côtière aux pressions environnementales d’origine naturelle et anthropique. L’approche holistique développée inclue notamment le suivi écologique des peuplements de poissons côtiers rocheux et la structure et les fonctionnalités de leurs habitats.

S’insérant dans cette dynamique, le projet IndieRock est une coopération entre:

- L’UMR BOREA (MNHN, CNRS 8067, SU, IRD 207, UCN, UA), notamment l’équipe BIOPAC, dont les thématiques de recherche portent, entre autres, sur la macroécologie et la conservation, avec un intérêt fort pour la description des patrons de biodiversité ainsi que des forçages naturels et anthropiques qui les façonnent ;
- L’Unité d’Appui et de Recherche PatriNat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), notamment la cellule « poissons côtiers et espèces patrimoniales » de l’équipe Expertise en Ecologie Marine hébergée à Dinard, qui travaille au développement des méthodes de surveillance et d’évaluation de l’état écologique des poissons côtiers dans le cadre de la mise en œuvre des politiques publiques internationales (OSPAR, Barcelone), européennes (DCSMM, DHFF, DCE), nationales (e.g. Observatoire Eolien en Mer) et locales (e.g. AMPs, ZPF) ;
- L’Unité Mixte de Recherche MARBEC (IRD, Ifremer, Université de Montpellier, CNRS) dont les thématiques de recherche portent sur la compréhension de la dynamique et du fonctionnement des écosystèmes marins en lien avec les pressions qui s’y exercent.

Le projet IndieRock vise à contribuer au développement méthodologique de l’observation et la surveillance des peuplements de poissons côtiers rocheux d’atlantiques NE et méditerranéens, au travers la mise au point d’une stratégie de suivis long terme reposant sur la combinaison de 3 approches complémentaires : les comptages visuels en plongées, les comptages sur stations vidéo appâtées et le metabarcoding d’ADNe. Les 3 laboratoires partenaires disposent déjà de bases de données importantes. Ces données serviront de terreau au projet, qui consistera principalement en des analyses statistiques.

Les travaux du projet IndieRock s’articuleront autour de 4 grands objectifs:

- Proposer une harmonisation des méthodes de suivis des poissons rocheux à l’échelle européenne, grâce à un guide méthodologique structuré autour d’une clé de décision permettant de sélectionner les protocoles les plus adaptés aux contraintes environnementales locales.
- Caractériser les variabilités spatio-temporelles des peuplements de poissons et identifier les principales variables environnementales et anthropiques structurantes de ces communautés
- Développer des métriques composites (combinant les données UVC, vidéos et ADNe) potentiellement indicatrices de certaines pressions anthropiques en vue de répondre aux besoins d’évaluations dans le cadre des politiques publiques (notamment DCSMM).
- Transférer la connaissance et les outils développés vers la communauté scientifique (e.g. publications rang A) mais aussi les opérateurs et décideurs de l’observation et surveillance côtière (e.g., outils shiny, notes, présentations)

**DESCRIPTION DES MISSIONS**

Au sein de l’UMR BOREA, et en liens fonctionnels étroits avec PatriNat cellule « poissons côtiers et espèces patrimoniales » et l’UMR MARBEC, la ou le titulaire du poste sera en charge des analyses biostatistiques et de la valorisation de données pour le projet Indie-Rock.

Plus spécifiquement, la personne recrutée devra:

- Assurer la gestion des données : Compiler de manière inter-opérables les différents jeux de données mis à disposition (UVC, BRUV et ADNe) ainsi que les variables environnementales caractérisant l