Post-doc : Analyse Pangénomique Pour Les Espèces D'intérêt Agronomiques

31320 Castanet-Tolosan _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. INRAE est un institut leader en agronomie, alimentation, et environnement, avec pour mission de produire et de partager des connaissances dans le domaine. **Environnement de travail, missions et activités**: Vous intègrerez le laboratoire MIAT, qui compte 4 équipes, et près de 50 membres, développant des méthodes et des programmes en statistique, machine learning, et informatique. Dans le cadre de vos missions, vous pourrez vous appuyer sur le cluster de calcul Genotoul-Bioinfo, maintenu par les membres de l’unité. La génomique est un élément essentiel dans la compréhension des espèces d’intérêt agronomique. Avec les progrès du séquençage, il est maintenant possible d’obtenir le génome de plusieurs individus d’une espèce donnée, à un coût raisonnable. Ceci permet de mieux modéliser la diversité : les grandes variations sont mieux prises en compte, et le biais lié au génome de référence est corrigé. Toutefois, les méthodes classiques utilisant un génome de référence sont à revoir, et notamment les études liant un phénotype d’intérêt à une variation génomique. Vous devrez développer de nouvelles méthodes pour trouver des variants associés à un caractère d’intérêt, en utilisant des graphes de pangénome. Pour cela, vous devrez utiliser des méthodes permettant de trouver ces variations génomiques, et vous devrez mettre en place une méthodologie sélectionnant celles qui sont liées à une donnée (binaire ou quantitative). Vous appliquerez votre méthode aux graphes de plantes et d’animaux produits dans le cadre du PEPR Agro-écologie et Numérique. **Formations et compétences recherchées**: **Doctorat/Ingénieur grandes écoles** - Connaissances en programmation (C++ / Rust) - Connaissances basiques en parcours de graphe - Connaissances basiques en génomique - Aisance en Anglais **Votre qualité de vie à INRAE**: En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée): - jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein) - d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ; - de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ; - d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ; - de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ; - d'activités sportives et culturelles ; - d'une restauration collective. **Modalités pour postuler**: **J'ENVOIE MON CV ET MA LETTRE DE MOTIVATION** - Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. >_