Bioinformaticien-ne en Plateforme Génomique

**Présentation d'INRAE**
L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la recherche.
C'est un acteur majeur de la recherche et de l’innovation créé le 1er janvier 2020. Institut de recherche finalisé issu de la fusion entre l’Inra et Irstea, INRAE rassemble une communauté de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France.
L’institut se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal, et se classe 11ème mondial en écologie-environnement. Face à l’augmentation de la population, au changement climatique, à la raréfaction des ressources et au déclin de la biodiversité, INRAE construit des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.
**Environnement de travail, missions et activités**
L'unité EPGV (Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux), unité de service (US) du Département BAP (Biologie et Amélioration des Plantes) de INRAE est localisée depuis 2001 à Evry, en accueil au Genoscope et au CNRGH, structures nationales de séquençage et génotypage d'envergure et de réputation internationale dans le domaine de la génomique (Institut de biologie François Jacob du Commissariat à l'Energie Atomique, IbFJ-CEA). L'US EPGV bénéficie ainsi de la large gamme d'équipements de pointe en séquençage et génotypage et de la puissance de calculs de ces structures nationales lui permettant de participer à de nombreux projets innovants d'analyse de génomes des végétaux travaillés à INRAE principalement. L'US EPGV interagit avec de nombreux partenaires scientifiques en leur donnant accès aux développements applicatifs et outils de génomique de dernière génération. L'unité, constituée de 7 permanents, est divisée en 2 équipes qui travaillent en étroite relation : l'équipe Développement technologique & Production (1 AI, 2 TR) et l'équipe Informatique & Bio-Informatique (1 IE, 1 AI). L'expertise Scientifique et Technologique est assurée par 1 CR, Directrice de l'unité et 1 IR, Responsable de Plateforme de Génomique. L'unité EPGV est une des 4 entités composant l'Infrastructure de recherche INRAE Genomics créée en 2019.
Les révolutions technologiques extraordinaires du domaine de la génomique dans lequel nous évoluons bouleversent sans cesse nos capacités de production, d'analyse et de stockage des données. Ainsi, l'exploitation et la gestion des données originales et massives nécessitent des méthodes informatiques et bioinformatiques demandant de constants ajustements. L'unité EPGV propose notamment aide et sensibilisation aux scientifiques pour la gestion et le partage des données produites (OpenData, FAIR).
Sous la responsabilité de la directrice de l'unité et du responsable de la plateforme, votre activité principale s'exercera dans le cadre des analyses de polymorphisme ponctuel ou de structure des génomes végétaux. Votre positionnement sera à l'interface avec les partenaires pour la transmission, l'analyse et la soumission en base publique de leurs données générées par l'unité et à l'interface avec les biologistes en interne dans la mise en oeuvre et l'assistance aux outils informatiques et bioinformatiques. Vous devrez assurer la veille scientifique et technologique et entretenir le réseau relationnel avec les acteurs du Genoscope/CNRGH et avec ceux des autres structures (ISC et Infrastructures INRAE, URGI, INRIA). Votre travail se positionnera au regard de la politique INRAE en faveur du partage, de l'accès, et de la réutilisation de l'information, de la donnée et de la connaissance scientifique. Vous contribuerez à l'actualisation du Plan de Gestion des Données (PGD) pour notre activité de plateforme de production de données génomiques et vous mettrez en oeuvre les principes FAIR. Vos activités seront également à considérer dans le cadre de solutions communes ou inter-opérables entre les 4 entités de l'Infrastructure en Génomique INRAE, dont fait partie l'EPGV.
**Formations et compétences recherchées**

**RÉFÉRENCE DE L'OFFRE**
- **N° profil : CAMOB22-IE-BAP-4**:

- Corps : IE
- Catégorie : A
- Emploi-type : A2A41
- Référentiel des emplois types_
- Numéro du concours : Sans objet

**LE CENTRE**
Île-de-France - Versailles-Grignon
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Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux

91000 EVRY
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**CONTACT**

**PATRICIA FAIVRE RAMPANT**

01 60 87 84 35

Type d'emploi : Temps plein