Ingénieur(e) en bioinformatique

il y a 1 jour


Paris, France Inovarion Temps plein

Inovarion, créé en 2013, est un centre de Recherche et d’Innovation en Sciences du Vivant, collaborant avec les principaux centres de recherche publics et privés. En 12 ans, Inovarion est devenu un acteur clé de cet écosystème, à travers les prestations réalisées et sa contribution à faire progresser les connaissances scientifiques dans de nombreux domaines de la biologie.Votre mission principale sera de mener à bien des projets de recherche en participant à leur conception, conduite et réalisation. Vous aurez à définir, mettre en place et exécuter l'ensemble des techniques nécessaires à la réalisation expérimentale des projets de recherche qui vous seront confiés. Vous aurez aussi à traiter, analyser, interpréter les données et valider les résultats. En rejoignant Inovarion, vous participerez à la diffusion et la valorisation des résultats des programmes de recherche réalisés.Dans ce contexte, nous recherchons un profil de bioinformaticien, titulaire d'un diplôme d'ingénieur, ou d'un Master en sciences des données appliquées à la biologie, bioinformatique, biologie computationnelle ou d'une formation équivalente, et détenant tout ou partie des compétences et expertises suivantes :Connaissances / expérience en biologie moléculaire/cellulaire et dans des domaines tels que l'immunologie et l'oncologie ;Polyvalence dans les approches techniques maîtrisées ;Maîtrise des outils et langages de programmation tels que Python, R, Bash/Shell, et idéalement d'autres comme Java ou C++, avec une bonne pratique en gestion de version (Git) ;Polyvalence multimodale (multi-omics) : Capacité à intégrer plusieurs niveaux de données (génomique, transcriptomique, épigénétique, protéomique, métabolomique) ;Traitement de données génomiques et transcriptomiques : RNA-seq, single-cell RNA-seq (scRNA-seq), ChIP-seq, ATAC-seq, méthodes de séquençage (long read, short read) ;Transcriptomique spatiale : Visium (10X Genomics), Slide-seq, MERFISH, seqFISH, STARMAP. Traitement des données spatiales, analyse différentielle spatialisée, intégration avec d’autres omiques ;Analyse de données protéomiques et métabolomiques : Spectrométrie de masse, analyse quantitative (label-free, marquage isotopique) ;Compétences en statistiques et modélisation pour l'intégration des données, méthodes d’apprentissage automatique appliquées aux données biologiques (classification, clustering, modèles prédictifs) ;Visualisation interactive (Shiny, Dash, Streamlit) ;Bioinformatique structurale (optionnelle mais pertinente) en modélisation moléculaire, docking, simulations moléculaires (MD) ;Compétences avancées en gestion de bases de données et gestion de flux de données : création, interrogation et gestion de bases de données relationnelles ou NoSQL.Connaissance de pipeline/workflow managers (Snakemake, Nextflow, CWL).Les compétences suivantes sont également attendues :Autonomie et force de proposition scientifique ;Capacité à communiquer efficacement avec des interlocuteurs de différents domaines (biologistes expérimentaux, cliniciens, statisticiens) ;Intérêt pour la veille scientifique et technologique continue ;Si vous vous reconnaissez dans cette offre et que vous souhaitez échanger avec nous, n’hésitez pas à postuler #J-18808-Ljbffr



  • Paris, Île-de-France Inovarion Temps plein

    Inovarion, créé en 2013, est un centre de Recherche et d'Innovation en Sciences du Vivant, collaborant avec les principaux centres de recherche publics et privés. En 12 ans, Inovarion est devenu un acteur clé de cet écosystème, à travers les prestations réalisées et sa contribution à faire progresser les connaissances scientifiques dans de...


  • Paris, France Institut du Cerveau et de la Moelle Épinière Temps plein

    Ingénieur d’études en bioinformatique génomique et multi-omics (F/H)L’équipe de recherche s’intéresse aux mécanismes moléculaires et cellulaires des épilepsies avec malformations corticales causées par des mutations somatiques (PMID: 38710875, PMID: 36635388, PMID: 31444548). Il s’agit d’une équipe multidisciplinaire alliant la...


  • Paris, France Pasteur Temps plein

    Un institut de recherche biomédicale à Paris recherche un Ingénieur Bioinformatique pour développer des outils d'intelligence artificielle pour l'analyse de données unicellulaires. Le candidat idéal aura des compétences solides en Python et une expérience en apprentissage automatique. Ce poste offre un environnement de travail inclusif et...


  • Paris, France JobiJoba FR S2 Temps plein

    Les missions qui incomberont à la personne recrutée seront d’analyser les résultats obtenus précédemment par une étudiante. Ces résultats portent notamment sur l’analyse de la locomotion des souris et sur la différence d’expression génique entre des animaux avec et sans traitement. Activités analyses bioinformatiques de données de RNA...


  • Paris 06 Luxembourg, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement CNRS   Référence UMR8003-NICGUE-005   Date de début de diffusion /12/2025 Date de parution /12/2025 Date de fin de diffusion /12/2025 VersantFonction Publique de l'Etat CatégorieCatégorie A (cadre) Nature de l'emploiEmploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / MétierRecherche -...


  • Paris 06 Luxembourg, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement CNRS   Référence UMR8003-NICGUE-005   Date de début de diffusion /12/2025 Date de parution /12/2025 Date de fin de diffusion /12/2025 VersantFonction Publique de l'Etat CatégorieCatégorie A (cadre) Nature de l'emploiEmploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / MétierRecherche -...


  • Paris, Île-de-France Dgafp Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement Siège de l'AP-HP   Référence APHP_ Date de début de diffusion /04/2025 Date de parution /12/2025 Nature de l'emploiEmploi ouvert aux titulaires et aux contractuels Domaine / MétierNumérique - Cheffe / Chef de projet maitrise d'œuvre SI Intitulé du posteIngénieur Bioinformatique et...


  • Paris 15 Vaugirard, Île-de-France Institut Pasteur Temps plein

    MétierBio info / biostat - Ingénieur de recherche confirmé (Bio info / biostat)Intitulé du posteIngénieur Bioinformatique - H/F/XMissions/ActivitésL'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement...


  • Paris ème - métro Pasteur - France, Paris Institut Pasteur Temps plein

    Référence Date de début de diffusion /12/2025 Date de parution /12/2025 MétierBio info / biostat - Ingénieur de recherche confirmé (Bio info / biostat) Intitulé du posteIngénieur Bioinformatique - H/F/X Missions/ActivitésL'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans. Sur notre...


  • Paris 13 Gobelins, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement CNRS   Référence UMR7592-ZOUZAD-009   Date de début de diffusion /12/2025 Date de parution /12/2025 Date de fin de diffusion /01/2026 VersantFonction Publique de l'Etat CatégorieCatégorie A (cadre) Nature de l'emploiEmploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / MétierRecherche -...