Ingénieur(e) en bioinformatique

il y a 1 jour


Paris, France Inovarion Temps plein

Inovarion, créé en 2013, est un centre de Recherche et d’Innovation en Sciences du Vivant, collaborant avec les principaux centres de recherche publics et privés. En 12 ans, Inovarion est devenu un acteur clé de cet écosystème, à travers les prestations réalisées et sa contribution à faire progresser les connaissances scientifiques dans de nombreux domaines de la biologie.Votre mission principale sera de mener à bien des projets de recherche en participant à leur conception, conduite et réalisation. Vous aurez à définir, mettre en place et exécuter l'ensemble des techniques nécessaires à la réalisation expérimentale des projets de recherche qui vous seront confiés. Vous aurez aussi à traiter, analyser, interpréter les données et valider les résultats. En rejoignant Inovarion, vous participerez à la diffusion et la valorisation des résultats des programmes de recherche réalisés.Dans ce contexte, nous recherchons un profil de bioinformaticien, titulaire d'un diplôme d'ingénieur, ou d'un Master en sciences des données appliquées à la biologie, bioinformatique, biologie computationnelle ou d'une formation équivalente, et détenant tout ou partie des compétences et expertises suivantes :Connaissances / expérience en biologie moléculaire/cellulaire et dans des domaines tels que l'immunologie et l'oncologie ;Polyvalence dans les approches techniques maîtrisées ;Maîtrise des outils et langages de programmation tels que Python, R, Bash/Shell, et idéalement d'autres comme Java ou C++, avec une bonne pratique en gestion de version (Git) ;Polyvalence multimodale (multi-omics) : Capacité à intégrer plusieurs niveaux de données (génomique, transcriptomique, épigénétique, protéomique, métabolomique) ;Traitement de données génomiques et transcriptomiques : RNA-seq, single-cell RNA-seq (scRNA-seq), ChIP-seq, ATAC-seq, méthodes de séquençage (long read, short read) ;Transcriptomique spatiale : Visium (10X Genomics), Slide-seq, MERFISH, seqFISH, STARMAP. Traitement des données spatiales, analyse différentielle spatialisée, intégration avec d’autres omiques ;Analyse de données protéomiques et métabolomiques : Spectrométrie de masse, analyse quantitative (label-free, marquage isotopique) ;Compétences en statistiques et modélisation pour l'intégration des données, méthodes d’apprentissage automatique appliquées aux données biologiques (classification, clustering, modèles prédictifs) ;Visualisation interactive (Shiny, Dash, Streamlit) ;Bioinformatique structurale (optionnelle mais pertinente) en modélisation moléculaire, docking, simulations moléculaires (MD) ;Compétences avancées en gestion de bases de données et gestion de flux de données : création, interrogation et gestion de bases de données relationnelles ou NoSQL.Connaissance de pipeline/workflow managers (Snakemake, Nextflow, CWL).Les compétences suivantes sont également attendues :Autonomie et force de proposition scientifique ;Capacité à communiquer efficacement avec des interlocuteurs de différents domaines (biologistes expérimentaux, cliniciens, statisticiens) ;Intérêt pour la veille scientifique et technologique continue ;Si vous vous reconnaissez dans cette offre et que vous souhaitez échanger avec nous, n’hésitez pas à postuler #J-18808-Ljbffr



  • Paris, France Institut Jacques Monod Temps plein

    Un institut de recherche en biologie à Paris recrute un Ingénieur d’étude en bioinformatique (H/F) pour un projet sur les maladies génétiques. Le candidat sera responsable de l’acquisition et du traitement des données génomiques. Les qualifications requises incluent un Bac+5 en bioinformatique et des compétences techniques en programmation et...


  • Paris, Île-de-France Institut Jacques Monod Temps plein

    Offres d'emploiIngénieur d'étude en bioinformatique (H/F)Published:6 heures agoInformations généralesIntitulé de l'offre : Ingénieur d'étude en bioinformatique (H/F)Référence : UMR7592-ZOUZAD-009Nombre de Postes : 1Lieu de travail : PARIS 13Date de publication : vendredi 19 décembre 2025Type de contrat : IT en contrat CDDDurée du contrat : 18...


  • Paris, France Institut Jacques Monod Temps plein

    Ingénieur d’étude en bioinformatique (H/F) Intitulé de l’offre : Ingénieur d’étude en bioinformatique (H/F) Référence : UMR7592-ZOUZAD-009 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : PARIS 13 Date de publication : vendredi 19 décembre 2025 Type de contrat : IT en contrat CDD Durée du contrat : 18 mois Date d’embauche prévue : 1 mai 2026 Quotité...


  • Paris, France AP-HP Temps plein

    La Direction des Services Numériques (DSN) fournit des services numériques sécurisés aux professionnels et aux patients. Elle gère des centaines de solutions (dossier patient, biologie, imagerie, espace patient, gestion hospitalière) sur 70 000 postes, administre les infrastructures (réseau, data centers, téléphonie, wifi) et valorise les données...


  • Paris, Île-de-France Choisir le Service Public Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement INSERM-Délégation Régionale IDF Centre-Est    Référence Date de début de diffusion /01/2026 Date de parution /01/2026 Localisation Paris Nature du contratCDD d'1 an VersantFonction Publique de l'Etat CatégorieCatégorie A (cadre) Nature de l'emploiEmploi ouvert uniquement aux...


  • Paris, Île-de-France Inserm Temps plein

    entreprise : L'Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l'ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec...


  • Paris, Île-de-France Dgafp Temps plein

    Informations générales Organisme de rattachement Siège de l'AP-HP   Référence APHP_ Date de début de diffusion /04/2025 Date de parution /01/2026 Nature de l'emploiEmploi ouvert aux titulaires et aux contractuels Domaine / MétierNumérique - Cheffe / Chef de projet maitrise d'œuvre SI Intitulé du posteIngénieur Bioinformatique et...


  • Paris, France Inserm France Temps plein

    Description Mission principale Dans le cadre des activités de recherche de l’équipe «Inflammation, Complément et Cancer» (INSERM UMRS1138, Centre de Recherche des Cordeliers), le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données biologiques à haut débit (cytométrie en flux multiparamétrique, protéomique...


  • Paris 06 Luxembourg, Île-de-France Inserm Temps plein

    Le poste Mission principale:Dans le cadre des activités de recherche de l'équipe « Inflammation, Complément et Cancer » (INSERM UMRS1138, Centre de Recherche des Cordeliers), le/la bioinformaticien(ne) participera à un projet visant à analyser et intégrer des données biologiques à haut débit (cytométrie en flux multiparamétrique, protéomique...


  • Paris, France Institut Pasteur Temps plein

    L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans. Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur. Le laboratoire de découverte de pathogènes a pour...