Cdd Chercheur en Génétique

**Présentation de la structure d'accueil**

L'Institut français de recherche pour l'exploitation de la mer (Ifremer) contribue à la connaissance des océans et de leurs ressources, à la surveillance du milieu marin et au développement durable des activités maritimes. Il est un acteur majeur en matière de recherche, d’innovation et d’expertise au service des politiques publiques et des activités socio-économiques liées à la mer.

L'unité **ASIM (Amélioration et Santé des Invertébrés Marins)**, basée à La Tremblade, est spécialisée dans la santé des espèces d’intérêt en aquaculture marine, notamment les mollusques bivalves. Elle s’intéresse aux interactions avec les organismes pathogènes et aux bases génétiques des réponses adaptatives en milieu marin.

**Introduction du poste à pourvoir et de sa position dans l'organigramme**

Dans le cadre du projet **Newtechaqua**, l’unité ASIM mène des recherches sur la résistance des huîtres Crassostrea gigas aux infections par OsHV-1 et Vibrio aestuarianus. Des infections expérimentales ont été réalisées sur des familles d’huîtres et des QTL associés à la résistance ont été identifiés. Le/la chercheur(e) recruté(e) aura pour mission de compléter ces analyses et de développer une nouvelle puce de génotypage pour affiner et détecter de nouveaux QTL.

Le poste sera intégré à l’équipe recherche de l’unité ASIM sous l’autorité du responsable de l'unité et en collaboration avec les chercheurs et partenaires du projet **Shellfishboost**.

**Missions principales**

Sélectionner de nouveaux échantillons à génotyper.

Analyser les génotypes pour la détection de nouveaux QTL.

Quantifier **OsHV-1** et **V. aestuarianus** dans les échantillons coinfectés.

Valoriser les travaux par des publications, comptes-rendus et présentations scientifiques.

**Diplôme**:
Doctorat en biologie, spécialisé en génétique (GWAS, sélection génomique).

**Compétences requises**:
Expertise en **génétique quantitative** et **sélection génomique**.

Expérience en **GWAS**.

Compétences en **biologie moléculaire** (extraction ADN, qPCR).

Capacités rédactionnelles (rapports, publications scientifiques).

Maîtrise de l'**anglais scientifique** (lecture et écriture).

**Qualités personnelles**:
Autonomie et rigueur scientifique.

Capacité à travailler en équipe et en consortium.

Aisance relationnelle et aptitude à communiquer.

**Type de contrat**: CDD de 9 mois.

**Localisation**: La Tremblade (ASIM)

**Taux d’activité**: 100%.

**Mobilité**: Possibilité de déplacements (estran pour récupération d'animaux, réunions en Europe, colloque international).

Qui sommes nous ?

**L’Ifremer**

Reconnu dans le monde entier comme l’un des tout premiers instituts en sciences et technologies marines, l’Ifremer s’inscrit dans une double perspective de développement durable et de science ouverte. Il mène des recherches, innove, produit des expertises pour protéger et restaurer l’océan, exploiter ses ressources de manière responsable, et partager les connaissances et les données marines afin de créer de nouvelles opportunités pour une croissance économique respectueuse du milieu marin.

Présents sur toutes les façades maritimes de l’hexagone et des outremers, ses laboratoires sont implantés sur une vingtaine de sites dans les trois grands océans : l’océan Indien, l’Atlantique et le Pacifique. Pour le compte de l’Etat, il opère la Flotte océanographique française au bénéfice de la communauté scientifique nationale. Il conçoit ses propres engins et équipements de pointe pour explorer et observer l’océan, du littoral au grand large et des abysses à l’interface avec l’atmosphère.

Ouverts sur la communauté scientifique internationale, ses 1500 chercheurs, ingénieurs et techniciens font progresser les connaissances sur l’une des dernières frontières inexplorées de notre planète ; ils contribuent à éclairer les politiques publiques et à l’innovation pour une économie bleue durable. Leur mission consiste aussi à sensibiliser le grand public aux enjeux maritimes.