Développeur d'outils pour analyse et catalogue de données génétiques H/F

Informations générales

Organisme de rattachement

Université Paris-Saclay  

Référence

Date de début de diffusion

/01/2026

Date de parution

/01/2026

Date de fin de diffusion

/02/2026

Localisation

Saint-Aubin

Intitulé long de l'offre

Développeur d'outils pour analyse et catalogue de données génétiques H/F

Nature du contrat

CDD d'1 an

Versant

Fonction Publique de l'Etat

Catégorie

Catégorie A (cadre)

Nature de l'emploi

Emploi ouvert uniquement aux contractuels

Domaine / Métier

Numérique - Développeuse / Développeur

Statut du poste

Vacant

Intitulé du poste

Développeur d'outils pour analyse et catalogue de données génétiques H/F

Descriptif de l'employeur

Née de la volonté conjuguée d'universités, de grandes écoles et d'organismes de recherche, l'Université Paris-Saclay compte parmi les grandes universités européennes et mondiales, couvrant les secteurs des Sciences et Ingénierie, des Sciences de la Vie et Santé, et des Sciences Humaines et Sociales. Sa politique scientifique associe étroitement recherche et innovation, et s'exprime à la fois en sciences fondamentales et en sciences appliquées pour répondre aux grands enjeux sociétaux. Du premier cycle au doctorat, en passant par des programmes de grandes écoles, l'Université Paris-Saclay déploie une offre de formation sur un large spectre de disciplines, au service de la réussite étudiante et de l'insertion professionnelle. Elle prépare les étudiants à une société en pleine mutation, où l'esprit critique, l'agilité et la capacité à renouveler ses compétences sont clés. L'Université Paris-Saclay propose également un riche programme de formations tout au long de la vie. Située au sud de Paris sur un vaste territoire, l'Université Paris-Saclay bénéficie d'une position géographique favorisant à la fois sa visibilité internationale et des liens étroits avec ses partenaires socio-économiques - grands groupes industriels, PME, start-up, collectivités territoriales, associations...

Descriptif du service

Au sein de la faculté de médecine, le Centre de Recherche en Épidémiologie et Santé des Populations (CESP) est l'un des principaux établissements de recherche épidémiologique en France ). Il est soutenu par trois institutions académiques : l'Inserm, l'Université Paris-Saclay et l'Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), ainsi que par plusieurs hôpitaux partenaires d'Île-de-France.

Au sein du CESP, l'équipe Exposome, Hérédité, Cancer et Santé étudie l'interaction entre l'exposome, qui regroupe les comportements et modes de vie liés à la santé, les expositions professionnelles et environnementales, ainsi que certaines caractéristiques biologiques  et le patrimoine génétique. Ces études visent à mieux comprendre leur rôle dans la survenue et l'évolution de maladies fréquentes telles que le cancer, les maladies cardiométaboliques et les pathologies neurodégénératives.

Afin d'atteindre ses objectifs, le CESP ambitionne à bâtir une infrastructure de recherche de premier plan, mise à disposition de l'équipe et de l'ensemble de la communauté scientifique nationale. Dans ce contexte, l'équipe Exposome et Hérédité recherche un·e développeur·se/ Ingénieur·e informatique pour renforcer son pôle bioinformatique.

Description du poste

Activités principales de l'agent·e :

1- Développement d'outils et de pipelines

• Développer et automatiser des pipelines pour l'analyse de données génétiques (imputation, GWAS, post-GWAS, scores polygéniques)
• Concevoir des API pour l'accès programmatique aux données
• Implémenter des outils facilitant la recherche, la visualisation ou l'analyse de données

2- Développement et maintenance des ressources génétiques

• Mettre en place des modèles de données adaptés aux formats génétiques (FASTA, GWAS).
• Organiser, documenter et assurer l'accessibilité des données de génotypage et des résultats génétiques
• Élaborer un catalogue de résultats de GWAS

3- Qualité, documentation et support

• Rédiger la documentation technique (pipelines, API, schémas de données)
• Participer à la définition des bonnes pratiques de gestion FAIR (Findable,
• Accessible, Interoperable, Reusable)
• Assurer un support technique aux utilisateurs internes
• Veille technologique et amélioration continue
• Suivre l'évolution des outils bio/informatiques et des standards omiques
• Proposer des améliorations continues du catalogue et de l'écosystème logiciel

Descriptif du profil recherché

Connaissances :

• Langages Python, R, Bash et Java (niveau expert)
• Bases de données (SQL)
• Formats et standards omiques
• Méthodologies et techniques statistiques et informatiques liées au traitement de données génétiques (approfondie)
• Standards FAIR, des métadonnées, et des référentiels biologiques
• Anglais: niveau B1 à B2 (CECRL)

Compétences opérationnelles :

• Concevoir et mettre en œuvre des démarches de traitement et d'analyse de données génétiques
• Rédiger de la documentation technique et méthodologique (rapport, article)

Compétences comportementales :

• Autonomie, capacité d'analyse et de résolution de problèmes
• Bon relationnel et aptitude au travail en équipe pluridisciplinaire
• Rigueur scientifique et sens de l'éthique
• Sens du service public et de l'intérêt général
• Esprit d'initiative, d'analyse et de synthèse

Diplôme souhaité : 

M2 ou doctorat en bioinformatique, épidémiologie génétique ou autres domaines associés
 

Informations complémentaires
Informations complémentaires

Poste ouvert aux contractuels uniquement en CDD d'un an

Localisation du poste

Europe, France, Île-de-France, Val de Marne (94)

Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

Villejuif

Date de vacance de l'emploi

01/01/2026

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