Responsable du pôle de bio-informatique F/H

Informations générales

Organisme de rattachement

Choisir Sorbonne Université, c'est rejoindre une université engagée sur les enjeux de développement durable, de diversité, d'égalité, d'innovation, de diffusion des savoirs, d'ouverture sur le monde et de qualité de vie au travail de ses personnels.

Université pluridisciplinaire de recherche intensive de rang mondial, elle s'attache à répondre aux enjeux scientifiques du 21e siècle et à transmettre les connaissances issues de ses laboratoires et de ses équipes de recherche.

Déployant ses formations auprès de étudiantes et étudiants dont 4000 doctorantes et doctorants et 12300 étudiantes et étudiants étrangers, elle regroupe plus de 3300 enseignantes et enseignants, enseignantes-chercheuses et enseignants-chercheurs, chercheuses et chercheurs, près de 4 000 enseignants-chercheurs et enseignants partenaires, environ 3 000 personnels de bibliothèque, administratifs, technique, sociaux et de santé (BIATSS) et 2000 IATSS partenaires. Son budget est de plus de 700 M€.

Située au cœur de Paris, elle présente une organisation avec des directions inter-facultaires et trois facultés de « Lettres », « Santé » et « Sciences et Ingénierie » et est présente dans plus de vingt-cinq 27 sites en Ile-de-France et en régions.  

Référence

Niveau facultaire / inter-facultaire

Directions inter-facultaires

Versant

Fonction Publique de l'Etat

Catégorie (DGAFP)

A (cadre)

Corps

IGR

Domaine / métier

02 - Catégorie A - Ingénieur de recherche (IGR) - A - Sciences du vivant de la terre et de l'environnement - Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Nature de l'emploi

Emploi ouvert uniquement aux contractuels

Statut du poste

Vacant

Intitulé du poste

Responsable du pôle de bio-informatique F/H

Présentation de la structure recruteuse

L'Unité Mixte de Service Biofonderie de l'Alliance Sorbonne Université a pour mission de mettre en place une offre de services technologiques, de partenariats et de formation de haut niveau en bio-ingénierie à destination des formations universitaires, des laboratoires académiques et des entreprises du secteur, avec l'ambition affichée de structurer la filière de l'ingénierie du vivant depuis son niveau fondamental jusqu'à ses applications technologiques. La BFASU est la première biofonderie académique en France, une plateforme robotisée de biologie de synthèse. Cette infrastructure d'excellence donne accès aux technologies de pointe nécessaires pour accélérer la recherche fondamentale, la recherche appliquée et translationnelle, le développement industriel et l'innovation. Ses activités sont centrées sur le clonage, le séquençage et le criblage phénotypique à haut débit mais également sur l'ingénierie métabolique et le développement de souches de bioproduction (circuits génétiques, enzymes, voie métaboliques artificielles,…) Cette unité multi-tutelles développe des activités partenariales académiques et industrielles sous la forme de prestations de service ou de projets collaboratifs.
Plus d'informations
Localisation : Campus Pierre et Marie Curie, Bâtiment B – 2ème étage, 4 place Jussieu 75005 Paris

Description du poste

Fonctions : Responsable du pôle de bio-informatique 

Catégorie : A

Corps : IGR

BAP : A

CDD de 1 an, renouvelable.
A pourvoir à compter de mars 2026.

Mission :

Le/La responsable du pôle de bio-informatique de l'unité assure le développement et l'automatisation des workflows d'analyse de données omiques, la structuration des bases de données et des systèmes d'information, ainsi que l'implémentation et le développement des programmes informatiques associés aux plateformes automatisées de l'unité.

Activités principales :

• Concevoir des workflows automatisés pour l'analyse de données ou le pilotage d'instruments
• Concevoir et élaborer la structure de bases de données et de systèmes d'information permettant de collecter, structurer, stocker et mettre en relation les données
• Guider le déploiement de l'infrastructure informatique des plateformes de la BFASU
• Définir le plan d'étude et de recueil des données le mieux adapté au problème posé
• Analyser des données de génomique (séquençage), protéomique et métabolomique (MS)
• Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales auprès des communautés professionnelles et scientifiques
• Gérer l'ensemble des moyens techniques alloués aux dispositifs de collecte et de traitement de données
• Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l'analyse des données biologiques
• Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats

Conduite de projets :   Oui

Encadrement :    Non

Descriptif du profil recherché (connaissances, compétences métier, compétences relationnelles)

Connaissances transversales requises :

• Connaissance théorique des différents types de protocoles expérimentaux biologiques
• Connaissance approfondie des méthodes de recueil, d'analyse et de traitement des données
• Connaissance solide en informatique : maîtrise des systèmes UNIX/LINUX, clusters de calculs, maîtrise d'un ou plusieurs langages de programmation, dont obligatoirement Python (Bash, C++, R, JavaScript, HTML, PHP, Java, PERL), maîtrise de la gestion des bases de données SQL et interfaces web (Apache, Django). Maîtrise de logiciels de gestion de version (Git, GitLab
• Maîtrise des problématiques liées aux Big Data
• Connaissance générale des approche d'IA/ML appliquées à l'ingénierie du vivant
• Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
   

Savoir-faire :

• Maîtrise des techniques principales d'analyse statistique de données scientifiques (paramétrique/non-paramétrique/bayésien)
• Savoir développer des outils de traitements automatisés de données biologiques pour les appliquer à des technologies de recherche en biologie
• Rédiger des documents scientifiques et assurer une gestion des projets scientifiques
• Développer une expertise scientifique et technologique
• Encadrer des étudiant-es
• Gérer la confidentialité des projets (NDA, propriété intellectuelle, secret des affaires)
  
  

Savoir-être :

• Aptitude à s'inscrire dans des projets collectifs et goût du travail en équipe
• Capacité d'innovation et de créativité, d'initiative et autonomie dans le travail
• Rigueur, organisation, méthode
   

Diplôme réglementaire souhaité :

• Doctorat
• Domaine de formation souhaité : bioinformatique

Durée du contrat (mois)

12 mois renouvelable

Quotité

Temps plein

Informations complémentaires
Encadrement

Non

Télétravail possible

Non

Conditions d'exercice
Expositions aux risques professionnels

Risque biologique (non pathogène) et chimique associé aux techniques classiques en microbiologie et biologie moléculaire

Unité protégée / ZRR

Non

Critères candidat
Niveau d'études

Niveau 7 - Bac + 5

Niveau d'expérience min. requis

Non renseigné

Langues

Anglais (4 - Niveau avancé (B2))

Localisation du poste

Europe, France, Ile-de-France, Paris (75)

Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

Biofonderie - Barre Cassan

Site

Campus Pierre et Marie Curie - 4 place Jussieu 75005 Paris

Date de vacance de l'emploi

01/03/2026

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