Ingénieur d'études en biologie moléculaire

Un poste d'ingénieur d'étude ouvrira en avril 2026 même temps que notre nouvelle équipe : Chromatin Architecture in Replication and Repair (CARR) au sein LBMC a l'ENS de Lyon. Nous étudierons le rôle de l'architecture 3D de la chromatine dans les processus de réplication et de réparation de l'ADN.

An Engineer (IE) position will open in our lab from April 2026 to study the role of chromatin organization in replication and repair at the LBMC at the ENS-Lyon. Our team will start in 2026 with an Atip-Avenir / Inserm funding.

Les cassures double-brin de l'ADN (DSBs) et le stress réplicatif constituent des menaces majeures pour l'intégrité du génome pouvant conduire à des mutations et favoriser le développement de cancers ou d'autres maladies génétiques. La compréhension des mécanismes moléculaires par lesquels les cellules détectent et répondent à ces défis est donc essentielle. Ces connaissances permettront non seulement d'élucider comment les cellules préservent la stabilité génomique en conditions de stress, mais également d'améliorer notre compréhension des mécanismes d'action des médicaments utilisés en clinique, ouvrant ainsi la voie à la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques.

Bien que les réponses cellulaires aux cassures double-brin de l'ADN (DSB) et au stress réplicatif soient globalement bien caractérisées, certains aspects clés demeurent méconnus, notamment l'organisation tridimensionnelle de la chromatine au niveau des lésions de l'ADN. Les réponses au stress sont des processus séquentiels avec des dynamiques spécifiques, générant une forte variabilité inter-cellulaire qui complique leur interprétation précise. Les approches génomiques traditionnelles telles que le ChIP-seq, le MNase-seq et le Hi-C/Micro-C fournissent des données moyennées sur l'ensemble d'une population, ce qui masque l'hétérogénéité cellulaire et entrave une notre interprétation. Notre laboratoire utilisera de nouvelles méthodes à résolution des molécules uniques telles que la PCP et le CAD-C pour décrypter le rôle de l'architecture chromatinienne dans la réplication et la réparation en utilisant la levure S. cerevisiae comme organisme modèle.

An Engineer (IE) position will open in our lab from April 2026 to study the role of chromatin organization in replication and repair at the LBMC at the ENS-Lyon. Our team will start in 2026 with an Atip-Avenir / Inserm funding.

DNA double-strand breaks (DSBs) and replication stress are major threats to genome integrity that can lead to mutations and ultimately drive cancer development or other genetic diseases. Understanding the molecular mechanisms by which cells detect and respond to these challenges is therefore essential. Such knowledge will not only provide insight into how cells preserve genome stability under stress but also improve our understanding of how clinically used drugs exert their effects, ultimately paving the way for the discovery of new therapeutic targets.

While cellular responses to DNA double-strand breaks (DSBs) and replication stress are generally well characterized, key aspects remain unclear, particularly the 3D chromatin organization around DNA lesions. Stress responses are multistep processes with unique dynamics, generating high cell-to-cell variability that complicates accurate interpretation. Traditional genomic assays like ChIP-seq, MNase-seq, and Hi-C/Micro-C provide population-averaged data that conceals cell-to-cell heterogeneity and hinders accurate interpretation. Our lab will use single-molecules resolutive methods such as PCP and CAD-C to decipher the role of chromatin architecture in Replication and Repair using the budding yeast S. cerevisiae as a model organism.

Relevant publications :

1. Delamarre A*, Reveil M, Pintor-Pinchon D, Mohibullah N, Boemo M, Whitehouse I*. CAD-CAD-C reveals the tight alignment of sister chromatids. Biroxiv. 2025.

1. Delamarre A, Bailey B, Yavid J, Koche R, Mohibullah N, Whitehouse I. Chromatin architecture mapping by multiplex proximity tagging. Molecular Cell. 2025 Jul 17;85(14):

1. Delamarre A, Barthe A, de la Roche Saint-André C, Luciano P, Forey R, Padioleau I, Skrzypczak M, Ginalski K, Géli V, Pasero P, Lengronne A. MRX increases chromatin accessibility at stalled replication forks to promote nascent DNA resection and cohesin loading. Molecular cell. 2020 Jan 16;77(2):

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Mission Principale:

La personne recrutée aura pour mission de participer à la conduite de projets de recherche innovants visant à la compréhension des rôles de l'organisation tri-dimensionnelle de la chromatine dans les processus essentiels de réplication et de réparation de l'ADN.

Activités principales:

• Participer à la mise en place et à l'organisation du laboratoire.
• Ingénierie de protéine et purification depuis E. coli.
• Ingénierie du génome de S. cerevisiae et culture.
• Conduite d'expériences de biologie moléculaire.

Connaissances:

• Connaissances générales en biologie moléculaire (Réplication, Réparation, Transcription)
• Une bonne compréhension écrite et orale de l'anglais.

Savoir-faire:

• Méthodes de bases en biologie moléculaire : Purification d'ADN, PCR etc…

Aptitudes:

• Travailler en équipe
• Gérer de manière autonome des expériences de biologie moléculaire
• Posséder une bonne organisation
• Transmettre des connaissances et des savoir-faire
• Rigueur et Motivation

Expérience(s) constituant un plus:

• Expérience en purification de protéines depuis E. coli
• Expérience en culture cellulaire de levure
• Expérience en méthodes génomiques : ChIPseq, Cut&tag, MNase-seq, HI-C/Micro-C etc…

Niveau requis:

• Bac +5

Pour en savoit plus:

• Sur l'Inserm : ; site RH :
• Sur la politique handicap de l'Inserm et sur la mise en place d'aménagements de poste de travail, contactez la Mission Handicap :
• Sur le LBMC :
• Sur l'équipe :

Pour Candidater:

• Envoyer CV et lettre de recommandation et lettre de motivation a axel.-
• + Obligatoirement sur le site suivant :

Type d'emploi : Temps plein, CDD

Durée du contrat : 12 mois

Rémunération : 2 245,00€ à 3 569,00€ par mois

Lieu du poste : En présentiel