Emplois actuels liés à Post-doctorat : spécialité Intelligence Artificielle – génomique - ClermontFerrand, Auvergne-Rhône-Alpes - Choisir le Service Public

  • Développeur logiciel Python ROS F/H

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Abylsen Temps plein

    Dynamisez votre carrière en rejoignant Abylsen, une communauté internationale d'experts passionnés. En tant que Développeur Python et ROS (F/H) dans le secteur Industriel , vous jouerez un rôle clé dans la création de solutions techniques de pointe. Profitez de l'environnement stimulant offert par Abylsen pour explorer de nouveaux horizons et...

  • Architecte Azure Data

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Exakis Nelite Temps plein

    Exakis Nelite, entité du groupeMagellan Partners, est le1er partenaire pure-player Microsoftindépendant en France avec l'ambition de devenir le premier partenaire Européen et en Afrique Francophone avec sa forte présence au Maroc.Nés du rapprochement de 2 leaders spécialistes de l'intégration des solutions Microsoft, nous allions expertise technique...

  • Consultant Microsoft Office 365

    il y a 6 jours

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Magellan Partners Temps plein

    Description de l'entreprise Exakis Nelite, entité du groupe Magellan Partners, est le 1er partenaire pure-player Microsoft indépendant en France avec l'ambition de devenir le premier partenaire Européen et en Afrique Francophone avec sa forte présence au Maroc.Nés du rapprochement de 2 leaders spécialistes de l'intégration des solutions Microsoft,...

  • Développeur CTO

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France SynQuality Temps plein

    Tu veux construire quelque chose qui a du sens, qui résout un vrai problème terrain et qui peut devenir grand ?Nous lançonsSynQuality, une future plateforme SaaS qui utilise l'intelligence artificielle pour transformer la gestion de la conformité et de la qualité dans les industries réglementées : pharmaceutique, dispositifs médicaux, cosmétique,...

  • Ingénieur Support Production F/H

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Inside Group Temps plein

    Inside est apporteur de solutions, de services et de valeurs ajoutées auprès des entreprises et DSI pour une transformation digitale agile.Au cœur de nos expertises :Infra & CloudDigitalTransformation & ProjetsCybersécuritéIntelligence ArtificielleInside, c'est aussi une organisation collaborative qui mise sur le développement des compétences et la...

  • Développeur C# .Net expert

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Atos Temps plein

    Chez Atos, nous contribuons à façonner un avenir numérique enrichi par l'intelligence artificielle. Notre mission réunir les meilleurs talents, technologies et partenaires, pour faire progresser la transformation digitale au quotidien.Des environnements critiques aux services cloud et de cybersécurité, nous guidons nos clients pour les amener là où...

  • Testeur IT

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Atos Temps plein

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  • H/F Diététicien(ne) Coordinateur(rice)

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Sui'Vie Sante Temps plein

    Sui'Vie Santé, spécialisé dans la coordination des soins ville/hôpital, nous recherchons dans le cadre de notre développement sur la région Auvergne, un(e) Diététicien(ne) Coordinateur(trice) pour un poste en CDI.Notre métier s'organise autour de la prise en charge de patients nécessitant des soins techniques tels que : perfusion, nutrition...

  • Consultant(e) Commercial(e) Performance Mobilité BtoB F/H

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France UpYourBizz Temps plein

    Bienvenue chez UpYourBizz Bienvenue chez Upyourbizz Agilité, Innovation et Engagement dans la performance : c'est ce qui définit UpYourBizz Depuis 2013, UpYourBizz s'oriente autour plusieurs domaines d'activitésNotre métier :Proposer une approche 360° pour accompagner la performance de nos clients grâce à différents leviers développés en...

  • Sushiman H/F

    il y a 2 semaines

    Clermont-Ferrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Côté Sushi Temps plein

    Tu as envie de découvrir le concept de la cuisine NIKKEI une cuisine d'inspiration japonaise et péruvienne ? Alors ne va pas plus loin, notre restaurant Coté Sushi de Clermont Ferrand recherche son Cuisiner/Sushiman pour son ouverture :Placé sous la responsabilité de votre Chef de Cuisine, vous serez en charge de la préparation et de la confection de...

Post-doctorat : spécialité Intelligence Artificielle – génomique

il y a 7 heures

ClermontFerrand, Auvergne-Rhône-Alpes, France Choisir le Service Public Temps plein


Informations générales

Organisme de rattachement

INRAE Centre Clermont - Auvergne-Rhône-Alpes  

Référence

Date de début de diffusion

/02/2026

Date de parution

/02/2026

Intitulé long de l'offre

Post-doctorat : spécialité Intelligence Artificielle – génomique


Date limite de candidature

03/03/2026


Employeur

L'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de personnes.


Nature du contrat

CDD de 6 mois


Versant

Fonction Publique de l'Etat


Catégorie

Catégorie A+ (Encadrement supérieur - Autres emplois fonctionnels)


Nature de l'emploi

Emploi ouvert aux titulaires et aux contractuels


Domaine / Métier

Recherche - Chercheuse / Chercheur


Statut du poste

Susceptible d'être vacant


Intitulé du poste

Post-doctorat : spécialité Intelligence Artificielle – génomique


Descriptif de l'employeur

INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l'animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.


Descriptif du service

Au sein de l'équipe PaléoEVO de l'Unité Mixte de Recherche UCA-INRAE Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales (GDEC), nous menons des recherches en paléogénomique pour étudier la diversité génétique passée chez le blé via l'analyse d'ADN ancien (aDNA) de restes archéologiques. Adossé à cette équipe de recherche, PALEOLAB est un laboratoire confiné, dédié à l'analyse de restes archéo-botaniques , Pont et al. 2019 doi : /s Vous participerez au programme DATA (UCA/I-Site) dans le domaine de l'exploitation de l'Intelligence Artificielle pour la génomique pour retracer l'adaptation passée des blés et ouvrir des pistes sur la conception des blés de demain adaptés aux changements globaux. Ce projet associe deux laboratoires : 

  1. Unité Mixte de Recherche Génétique Diversité Ecophysiologie des Céréales (GDEC) – UCA-INRAE – Clermont-Ferrand (Caroline Pont, Pierre-Louis Stenger et Jérôme Salse) ;
  2. Laboratoire d'Informatique, Modélisation et d'Optimisation des Systèmes (LIMOS) UCA – Clermont-Ferrand (Engelbert Mephu Nguifo, professeur à l'ISIMA). 


L'équipe d'accueil (UMR GDEC) assure l'accès aux outils bio-informatiques nécessaires à la pleine réalisation du projet ). Vous serez sous la responsabilité de Caroline Pont, et entouré.e d'ingénieur.e.s, doctorant.e.s et postdoctorant.e.s spécialisé.e.s en paléogénomique. 


Description du poste

Vous serez plus particulièrement en charge de :

Réaliser le benchmarking et le développement d'outils d'intelligence artificielle pour la génomique permettant l'analyse de la diversité génétique ancienne des blés, de sa comparaison avec la diversité génétique mondiale des blés modernes et l'identification de diversités génétiques anciennes et modernes plus particulièrement associées à des origines géographiques particulières et leurs contraintes environnementales associées. Les données d'ADN ancien restant très parcellaires et hétérogènes (données incomplètes, fragmentées, de faible couverture génomique) l'utilisation de deep learning ou l'élaboration de réseaux de neurones artificiels notamment (Graph Neural Network, GNN) peut permettre de prédire les types de blé, en fonction de leur nature génétique, adaptées à des environnements donnés. Des outils sont maintenant disponibles (Sun et al. 2024 ; Zhang et al démontrant le potentiel de l'application du machine learning pour la reconstruction d'arbres phylogénétiques à l'aide du jeu d'apprentissage moderne.

Les données d'entraînement disponibles correspondent à :

  1. 1 420 accessions modernes de blés (couvrant 6 espèces dont T. aestivum, T. durum et T. timopheevii) apportant des données génétiques polymorphismes de séquences) et des données « passeport » (pays d'origine, date d'enregistrement du cultivar) définissant une structuration géographique de la diversité génétique des espèces (cf publication Sow et al. 2025, ) ;
  2. des données phénotypiques associées (Heading Date, Plant Height, Grain Weight) ;
  3. des données climatiques disponibles sur ClimateDT ) correspondant à 19 variables bioclimatiques et la grille altitudinale disponibles dans la base de données Worldclim (Hijmans et al. 2005, Fick et al ;
  4. des données archéologiques d'échantillons anciens de blés (T. aestivum, T. dicoccum, T. durum, T. timopheevii, T. monococcum…) couvrant 5 000 ans de domestication-sélection, et provenant principalement de sites palafittiques UNESCO de France (cf projet ArkaoAG, ).

Conditions particulières d'exercice

Vous pourrez travailler sur deux sites distants de 5 kilomètres.


Descriptif du profil recherché

Formation recommandée : doctorat dans le domaine de la bio-informatique / intelligence artificielle / modélisation-intégration des données / génomique-génétique. 

Connaissances souhaitées : 

- maîtrise de langages de programmation (Bash, Python, R, Gitlab, Conda, Snakemake, cluster de calcul type HPC en environnement Unix, …) ainsi que des outils d'interfaçage appliqués aux systèmes d'exploitation en génomique (Galaxy) ;

- exploration des séquences et gestion des NGS (variant calling/comparaison/mapping de séquences/ identification de barcode via Kmer/Blast/BWA/bowtie) et utilisation de banque de données génomiques (NCBI, nt core, …), alignement de séquences et phylogénie/phylogénomique, analyse de structure (Megan, Structure), génétique des populations ;

- biostatistique (machine learning, glm, modèles multivariés, ...) ;

- génomique comparative et génomique évolutive des populations. 

Expérience appréciée : bio-informatique / intelligence artificielle / modélisation-intégration des données / génomique-génétique.

Aptitudes recherchées : rigueur scientifique, autonomie, motivation, communication.


Rémunération contractuels (en € brut/an)

37 629,72

Informations complémentaires
Informations complémentaires

Références :

Pont et al. 2019 doi: /s

Sow MD et al. 2025 doi: /s Epub 2025 Nov 17. 

Secomandi et al. 2025 

Hijmans et al. 2025

Stephen et al. 2017

Sun et al. 2024 doi:

Zhang et al. 2023 arXiv : v1


Télétravail possible

Oui


Localisation du poste

Europe, France, Auvergne-Rhône-Alpes, Puy de Dôme (63)


Lieu d'affectation (sans géolocalisation)

63000 Clermont-Ferrand

Critères candidat
Niveau d'études / Diplôme

Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents


Niveau d'expérience min. requis

Débutant


Documents à transmettre

L'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire


Date de vacance de l'emploi

01/05/2026


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PONT Caroline