Ingénieur en biologie moléculaire et analyses de données F/H

il y a 2 jours

Montpellier, Occitanie, France IRD Temps plein


Vos missions en quelques mots

Une mission attractive

Sous la responsabilité de Christèle Humblot chercheure à l'IRD spécialiste en microbiologie, votre mission à consistera à choisir, adapter et mettre en œuvre les méthodes nécessaires à la réalisation des activités de recherche de l'UMR dans le domaine de l'écologie microbienne moléculaire

 vos activités seront les suivantes :

  • Assurer la veille méthodologique et la mise au point de méthodes en métagénomique (écologie synthétique, cultures microbiennes, approches « méta-omiques », préparation, suivi et contrôle des opérations de fermentation).
  • Réaliser des analyses de routine en biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel, séquençage à haut débit).
  • Conduire les analyses de données issues du séquençage à haut débit (métagénomes alimentaires et intestinaux) en utilisant des outils de bio-informatique (Qiime 2, R, Python, Bash) y compris sur des clusters de calcul, du traitement des données à la visualisation.
  • Favoriser l'articulation avec les structures opérationnelles et décisionnelles (plateformes de séquençage à haut débit, interactions avec les centres de ressources microbiennes).
  • Rédiger des protocoles détaillés d'analyse et former les stagiaires et partenaires.
  • Respecter et faire respecter les règles d'éthique, d'hygiène et sécurité.
  • Participer à la gestion du laboratoire (commandes, suivi des stocks, maintenance)


Votre future équipe

Vous intègrerez une équipe multidisciplinaire composée de 6 chercheurs, 1 ingénieur de recherche, 2 ingénieurs d'études 1 assistant ingénieur et 1 technicien. La multidisciplinarité des approches développées (épidémiologie, science des aliments) vous permettra d'interagir avec des collègues de différents domaines, tout en renforçant les aspects microbiologiques portés principalement par un chercheur de l'équipe.

Vous travaillerez en interactions fortes avec les membres de cette équipe ayant un effectif de taille restreinte ainsi qu'avec des membres d'autres équipes de l'UMR (par exemple en bioinformatique).

Vous partagerez un espace commun pour mener à bien les activités qui vous seront confiées, dans un collectif engagé et volontaire.

Vous interagirez avec des partenaires et étudiants du Sud dans un environnement multiculturel.



Profil recherché

Vous avez développé les compétences suivantes :

  • Être autonome dans la mise en œuvre des principales techniques de base de biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel ou digitale, séquençage à haut débit).
  • Avoir une expérience d'utilisation des outils de bio-informatique ainsi qu'en langages de programmation utilisés en analyses de données (R, Python)
  • Mener les techniques de microbiologie classique.
  • Rédiger des comptes rendus et des protocoles.
  • Avoir un niveau de connaissance en anglais suffisant pour l'encadrement d'étudiants non francophones Niveau B1-B2.


Vous faites preuve des qualités humaines suivantes :

  • Vous êtes consciencieux, rigoureux et patient.
  • Vous avez un goût prononcé pour le travail en équipe.
  • Vous avez des capacités d'adaptation fortes à un nouveau collectif et un environnement multiculturel.

De formation approfondie en biologie moléculaire, une expérience en bio-informatique appliquée est essentielle.



Langues
  • Anglais
    Seuil


Éléments de candidature

Documents à transmettre

Pour postuler à cette offre, l'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire

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