Doctorat (H/F) en développement de modèles de base pour les données multi-omiques unicellulaires
il y a 5 jours
Informations générales
Organisme de rattachement
CNRS
Référence
UMR3738-DEBPHI-005
Date de début de diffusion
/01/2026
Date de parution
/01/2026
Date de fin de diffusion
/01/2026
Versant
Fonction Publique de l'Etat
Catégorie
Catégorie A (cadre)
Nature de l'emploi
Emploi ouvert uniquement aux contractuels
Domaine / Métier
Recherche - Chercheuse / Chercheur
Statut du poste
Vacant
Intitulé du poste
Doctorat (H/F) en développement de modèles de base pour les données multi-omiques unicellulaires
Descriptif de l'employeur
Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l'Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d'éthique, de déontologie et d'intégrité scientifique.
Description du poste
Sujet de thèse :
Le séquençage haut débit à cellule unique, qui extrait d'énormes quantités de données moléculaires d'une cellule, crée des opportunités passionnantes pour l'apprentissage automatique afin de répondre aux questions biologiques en suspens. Le doctorant, qui sera recruté dans le cadre de l'ERC StG MULTI-viewCELL, travaillera sur le développement de modèles de fondation multimodaux intégrant des données omiques multi-cellules ou des informations spatiotemporelles.
Activités réalisées dans le cadre du doctorat :
- conception d'une nouvelle méthode mathématique
- veille documentaire de publications pertinentes pour le domaine
- programmation/codage en Python (Pytorch)
- présentation des résultats obtenus en conférence
- interaction avec les membres de l'équipe et les collaborateurs internationaux
Contexte :
L'équipe Machine Learning for Integrative Genomics genomics/) de l'Institut Pasteur, dirigée par Laura Cantini, travaille à l'interface de l'apprentissage automatique et de la biologie (outils développés par l'équipe : ). L'équipe est composée de 9 personnes : 4 doctorants, 3 post-doctorant, 1 Ingénieur de recherche et 1 assistante. L'équipe est associée au département de biologie computationnelle de l'Institut Pasteur, à l'UMR3738 et à l'Institut d'intelligence artificielle PRAIRIE. L'équipe a récemment remporté un financement ERC StG qui fait l'objet de ce recrutement.
MULTIview-CELL ERC StG :
Conditions particulières d'exercice
Le Centre national de la recherche scientifique est l'une des plus importantes institutions publiques au monde : femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l'Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l'international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l'innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.
Descriptif du profil recherché
Contraintes et risques :
Travail sur ordinateur
Temps plein
Oui
Rémunération contractuels (en € brut/an)
La rémunération est d'un minimum de 2300,00 € mensuel
Localisation du poste
Europe, France, Île-de-France, Paris (75)
Géolocalisation du poste
PARIS 15
Lieu d'affectation (sans géolocalisation)
75724 PARIS 15 (France)
Critères candidatNiveau d'études / Diplôme
Niveau 7 Master/diplômes équivalents
Spécialisation
Formations générales
Langues
Français (Seuil)
-
Ingénieur Bioinformatique
il y a 4 jours
Paris 15 Vaugirard, Île-de-France Institut Pasteur Temps pleinMétierBio info / biostat - Ingénieur de recherche confirmé (Bio info / biostat)Intitulé du posteIngénieur Bioinformatique - H/F/XMissions/ActivitésL'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement...
-
Paris, Île-de-France Institut de La Vision Temps pleinPublié le : 12 décembre 2025Postdoctorat en pathologie rétinienne et développement de traitements de nouvelle générationContexteL'Institut de la Vision est l'un des principaux centres de recherche européens spécialisés dans les maladies oculaires. Il réunit sous un même toit des chercheurs, des cliniciens et des partenaires industriels afin de...
-
Paris, Île-de-France CEA Temps pleinInformations générales Entité de rattachement La Direction des Applications Militaires (DAM) du CEA, au cœur des enjeux de la dissuasion nucléaire Française, cherche ses futurs talents. Organisme inclusif, le CEA est handi-accueillant : nos emplois sont ouverts à toutes et tous. Associer les forces et les compétences de chacun pour atteindre nos...
-
Administration Base de Données
il y a 1 semaine
Paris, Île-de-France ANDERSON RH Temps pleinNous recherchons un Administration Base de Données de 8 ans d'expérience minimumavec des compétences ci-dessous :BanqueSQL ServerPostgres SQLMySQLIBM Db2Vos missionsDescription de la mission :Assister les squads dans la création et l'évolution de leurs modèles de données :Réaliser des contrôles afin de garantir l'application des normes...
-
Paris 05 Panthéon, Île-de-France Choisir le Service Public Temps pleinInformations générales Organisme de rattachement CNRS Référence UMR8060-ILACIO-006 Date de début de diffusion /01/2026 Date de parution /01/2026 Date de fin de diffusion /01/2026 VersantFonction Publique de l'Etat CatégorieCatégorie A (cadre) Nature de l'emploiEmploi ouvert uniquement aux contractuels Domaine / MétierRecherche -...
-
Paris, Île-de-France CEA Temps pleinInformations générales Entité de rattachement La Direction des Applications Militaires (DAM) du CEA, au cœur des enjeux de la dissuasion nucléaire Française, cherche ses futurs talents. Organisme inclusif, le CEA est handi-accueillant : nos emplois sont ouverts à toutes et tous. Associer les forces et les compétences de chacun pour atteindre nos...
-
Stage - Data Scientist H/F
il y a 5 jours
Paris 15 Vaugirard, Île-de-France MEESCHAERT Temps pleinDescriptionMandarine Gestion, l'une des principales sociétés de gestion françaises, recherche un stagiaire H/F au sein de l'équipe Data.Mandarine Gestion est une des principales sociétés de gestion françaises. Sa mission est de proposer à ses clients des solutions d'investissement innovantes qui contribuent au financement responsable et durable de...
-
Administration Base de Données Sybase
il y a 5 jours
Paris, Île-de-France ANDERSON RH Temps pleinLa mission concerne le pilotage de la qualité de service avec la gestion des infrastructures informatiques, englobe les attentes des clients du métier, les paiements ainsi que les techniques de gestion de projet et du RUN. Le périmètre s'étend sur Ostrum Asset Management/NIM OS dans un environnement multi SGBD principalement composé de SQLServer, avec...
-
Ingénieur de Recherche Single Cell Biomarkers H/F
il y a 4 jours
Paris 15 Vaugirard, Île-de-France Institut Pasteur Temps pleinMétierAutres domaines Ingénierie de la recherche - Ingénieur de rechercheIntitulé du posteIngénieur de Recherche Single Cell Biomarkers H/FMissions/ActivitésL'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un...
-
postdoctoral researcher
il y a 5 jours
Paris 15 Vaugirard, Île-de-France Inserm Temps pleinLe poste Main mission:The successful candidate will work on an ANR-funded project aimed at studying the role of macrophages in cardiac fibrosis using single-cell and spatial transcriptomics methods.Main activities:Animal models of cardiovascular diseases (surgery)Management of transgenic mouse linesConducting and analysing single-cell and spatial...
