INGENIEUR ETUDES en analyse de données de type « omics » H/F

La mission consiste en l’analyse de données de type « omics » (Hi-C, ChIP-Seq, MNase-Seq, etc) et en l’assistance des membres de l’équipe pour la réalisation de leurs propres analyses. Activités. Analyse et visualisation de données « omics ». Refactorisation et développement de pipelines pour les analyses de ChIP-seq et de MNase-seq. Rédiger des fiches guides pour la réalisation autonome d’analyses de données omics. Rédaction de fiches de travail à destination des membres de l’équipe pour la réalisation autonome de leurs analyses de données omics Compétences Savoir-faire. Expertise en programmation, notamment à usage des biologistes (Python et/ou R). Expertise dans l’analyse de données biologiques de type « omics ». Expertise dans le développement bioinformatique (packages) Savoir-être. Capacité à travailler en équipe et répondre aux besoins de ses collègues. Capacité gérer plusieurs projets distincts en parallèle Transverses. Capacité à se former sur de nouvelles technologies/langages. Veille technologique dans son domaine d’expertise. Transfert de compétences aux membres non-bioinfo de l’équipe Contexte de travail Localisé à l'ENS de Lyon, dans un environnement multidisciplinaire riche, le LBMC est un laboratoire de biologie expérimentale dont l'objet d'étude est la cellule, l'unité fondamentale du vivant. Les 15 équipes du LBMC intègrent dans leurs recherches différents aspects de la vie cellulaire comme la prolifération, la différentiation et l'interaction avec l'environnement cellulaire dans un contexte normal ou pathologique. La recherche fondamentale menée au laboratoire s'appuie sur une expertise en biologie cellulaire et moléculaire et est résolument tournée vers l'interdisciplinarité intégrant des approches en (bio)informatique, (bio)physique et (bio)mathématique. L’équipe « Chromatin Dynamics in Mitotic Chromosome Assembly » s’intéresse au processus d’assemblage des chromosomes mitotiques par le complexe Condensine, et son intersection avec la dynamique structurale de la chromatine. L’équipe mobilise des approches de génomique à haut-débit dans l’organisme modèle S.pombe. Les avantages attachés à cette collaboration : • Un environnement de travail interdisciplinaire stimulant aux contacts des personnels de la recherche • Un accompagnement professionnel avec des formations. • Un restaurant d'entreprise qui permet de bien déjeuner à un prix intéressant. • Le remboursement partiel des titres de transport (75%) ou forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an • Un site accessible en transport en commun (Métro + Trams + bus) et vélo Localisé à l'ENS de Lyon, dans un environnement multidisciplinaire riche, le LBMC est un laboratoire de biologie expérimentale dont l'objet d'étude est la cellule, l'unité fondamentale du vivant. Les 15 équipes du LBMC intègrent dans leurs recherches différents aspects de la vie cellulaire comme la prolifération, la différentiation et l'interaction avec l'environnement cellulaire dans un contexte normal ou pathologique. La recherche fondamentale menée au laboratoire s'appuie sur une expertise en biologie cellulaire et moléculaire et est résolument tournée vers l'interdisciplinarité intégrant des approches en (bio)informatique, (bio)physique et (bio)mathématique. L’équipe « Chromatin Dynamics in Mitotic Chromosome Assembly » s’intéresse au processus d’assemblage des chromosomes mitotiques par le complexe Condensine, et son intersection avec la dynamique structurale de la chromatine. L’équipe mobilise des approches de génomique à haut-débit dans l’organisme modèle S.pombe. Les avantages attachés à cette collaboration : • Un environnement de travail interdisciplinaire stimulant aux contacts des personnels de la recherche • Un accompagnement professionnel avec des formations. • Un restaurant d'entreprise qui permet de bien déjeuner à un prix intéressant. • Le remboursement partiel des titres de transport (75%) ou forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an • Un site accessible en transport en commun (Métro + Trams + bus) et vélo Contraintes et risques R.A.S. R.A.S.