Doctorant en biologie moléculaire et cellulaire H/F

Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Sujet de thèse :
Évolution de motifs d'ARN fonctionnels pour la biotechnologie

Le doctorant (H/F) développera des éléments d'ARN fonctionnels pour des applications biotechnologiques, notamment des aptamères fluorescents (light-up aptamers), des biocapteurs et des éléments d'ARN favorisant la traduction dans le contexte des vaccins à ARN messager. Le projet combinera l'analyse quantitative des relations structure–fonction de l'ARN, des essais sur puces à ARN, le criblage fonctionnel de très grandes bibliothèques de variants par microfluidique en gouttelettes, le séquençage à haut débit et la validation en cellules.

Les résultats contribueront à la conception d'éléments d'ARN plus robustes et contrôlables, utiles au développement de thérapies à ARN.
Contexte :
Le projet sera réalisé à l'Institut de biologie moléculaire et cellulaire (IBMC), au sein de l'unité CNRS UPR9002 Architecture et Réactivité de l'ARN. Le doctorant (H/F) bénéficiera d'un co-encadrement par Redmond Smyth, directeur de recherche au CNRS, et Michael Ryckelynck, professeur à l'Université de Strasbourg.

Ce projet de doctorat sera rattaché à l'École doctorale Sciences de la vie et de la santé de Strasbourg (ED-414), qui l'a validé. Ce projet de recherche est financé par la Région Alsace et le réseau de recherche NetRNA, et débutera en octobre 2026.

Afin d'assurer une prise de fonction immédiate et une progression efficace, le ou la candidat·e doit posséder des connaissances approfondies en biologie moléculaire et en biochimie des acides nucléiques, ainsi qu'une expérience préalable de la manipulation des acides nucléiques, notamment en sélection in vitro et en séquençage à haut débit. En outre, des connaissances de base des systèmes de microfluidique en gouttelettes sont requises.

Le doctorant (H/F) aura accès aux plateformes de microfluidique, de séquençage et de microscopie, ainsi qu'aux formations doctorales proposées par l'ED414, IMCBio+ et le réseau de recherche NetRNA. Une participation aux publications, conférences, activités d'innovation et, le cas échéant, au dépôt de brevets est attendue.

Le laboratoire est situé à proximité immédiate des transports en commun, notamment du tramway, ainsi que des structures de restauration universitaire. Aucune contrainte horaire spécifique, telle que des horaires décalés ou d'autres obligations, ne sera requise pour la réalisation des missions.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Contraintes et risques :
Le projet comprend des travaux expérimentaux de biologie moléculaire et cellulaire, incluant la manipulation d’ARN, la culture cellulaire, l’utilisation de réactifs chimiques et d’échantillons biologiques non pathogènes. Il implique également l’utilisation d’équipements de laboratoire, notamment de microfluidique et de séquençage, après une formation appropriée aux procédures et règles d’hygiène et de sécurité. Aucun risque spécifique au-delà de ceux habituellement associés à un laboratoire de biologie moléculaire n’est anticipé.