Ingénieur-e biologiste des plantes

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Vous rejoindrez l'unité Plant Health Institute of Montpellier (PHIM), spécialisée dans l'étude des interactions entre les plantes et leur environnement biotique. Cette unité rassemble environ 230 agents qui développent des approches de biologie et génétique moléculaires, de génétique et génomique des populations et d'épidémiologie.

Vous intégrerez les équipes Biologie évolutive des champignons pathogènes du riz et d'autres céréales (BLAST) et Cereal Immunity and Magnaporthe Effectors (CIME) de l'axe thématique Interactions plante pathogène : Evolution et Mécanismes (ITEM) travaillant sur les maladies fongiques des céréales et sur les mécanismes d'immunité des plantes. Vos activités seront focalisées sur le riz et vous participerez aux projets de recherche de diverses équipes de PHIM.

Votre mission s'inscrira dans un contexte de renforcement des capacités de l'unité pour étudier les interactions entre les plantes et les champignons pathogènes. Les projets menés visent à développer des approches innovantes de phénotypage, d'imagerie, d'analyse d'image et d'édition du génome afin de mieux comprendre les mécanismes biologiques impliqués dans les maladies des plantes et leur résistance.

Ce poste contribue directement à l'amélioration des connaissances sur la santé des plantes et à la mise au point de méthodes expérimentales de nouvelle génération. Vos travaux participeront au développement d'outils à haut débit pour caractériser les interactions plantes-pathogènes. Vous assurerez la caractérisation des lignées transgéniques de plantes tant au niveau génétique, que moléculaire et phénotypique.

Dans ce cadre, vous serez en charge des activités suivantes :

Phénotypage et expérimentation sur les interactions plantes-pathogènes

- Optimiser les processus de production des plantes depuis la production des plantes et des inocula fongiques.

- Concevoir, réaliser et superviser des expérimentations d'inoculation de plantes par des champignons pathogènes.

- Évaluer la résistance ou la sensibilité de lignées végétales et caractériser l'agressivité de souches fongiques.

- Développer et optimiser des méthodes innovantes d'observation et de mesure des interactions biologiques (approches d'imagerie visible, hyperspectrale ou par fluorescence) pour l'analyse des symptômes et du statut physiologique des plantes.

- Contribuer au déploiement d'outils d'analyse d'image fondés sur l'intelligence artificielle, avec l'appui de bioinformaticiens de PHIM et de collaborateurs externes (plateforme INRAE PHENOTIC, Angers).

Transformation génétique et édition du génome

- Réaliser et superviser des expériences de transformation génétique et d'édition du génome chez les plantes.

- Produire des lignées transgéniques ou à génome édité.

- Assurer la caractérisation génétique, moléculaire et phénotypique des lignées obtenues.

- Participer à l'amélioration des protocoles de culture in vitro, de microbiologie et de biologie moléculaire.

Gestion des données et diffusion des savoir-faire

- Formaliser et documenter les protocoles expérimentaux selon les principes FAIR.

- Assurer la sauvegarde, l'organisation et l'accessibilité des données produites.

- Former et accompagner les personnels scientifiques, techniques et les étudiants aux méthodes développées.

- Participer aux collaborations internes et externes de l'unité.

Vous avez une formation supérieure en biologie des plantes et/ou phytopathologie.

Une expérience en expérimentation végétale, interactions plantes-pathogènes, transformation génétique ou phénotypage des plantes sera appréciée.

Savoir-faire :

- Mettre en œuvre des techniques de culture et de biologie des plantes

- Utiliser des méthodes de biologie moléculaire et de microbiologie

- Réaliser des expérimentations de culture in vitro et de transformation génétique de plantes

- Concevoir et conduire des protocoles expérimentaux en phytopathologie

- Rédiger une documentation scientifique et technique

- Transmettre des méthodes et des savoir-faire techniques

Le poste nécessite la pratique de l'anglais scientifique à l'écrit et à l'oral (niveau B2).

Savoir-être :

- Rigueur et sens de l'organisation

- Fiabilité et sens des responsabilités

- Goût pour le travail en équipe

- Capacité à collaborer avec des interlocuteurs variés

- Autonomie dans la conduite des activités

- Sens du partage des connaissances