Postdoctorant (H/F) – Mécanique cellulaire par couplage AFM / confocal

Missions :
Le groupe « Développements méthodologiques en AFM pour la biologie » au CBMN (Bordeaux) recherche actuellement un chercheur postdoctoral spécialisé dans la caractérisation structurale, mécanique, et dynamique de cellules en interaction avec des assemblages peptidiques bactériens. Il s'agit d'un projet interdisciplinaire à la frontière entre biologie cellulaire / structurale et biophysique, financé par une ERC StG 2024, et combinant notamment microscopie à force atomique, et microscopie confocale.

Contexte du projet. Staphylococcus aureus, pathogène opportuniste et résistant à nombre d’antibiotiques, s’appuie notamment sur un arsenal de facteurs de virulence pour coloniser l’hôte et provoquer l’infection. Parmi eux, les phenol soluble modulins (PSMs) constituent une famille de peptides amphiphiles jouant un rôle clé dans (i) la structuration et la maturation des biofilms, (ii) la lyse des cellules hôtes par perturbation membranaire, et (iii) l’activation de la réponse inflammatoire via des récepteurs membranaires spécifiques (FPR2). Outre leurs fonctions biologiques, les PSMs présentent une forte propension à l’auto-assemblage en fibrilles amyloïdes aux architectures variées, potentiellement liées à leurs activités cytotoxiques et/ou pro-inflammatoire. Toutefois, les mécanismes moléculaires sous-tendant les fonctions des PSMs restent à ce jour largement incompris.

Objectif du projet. Nous souhaitons comprendre comment les propriétés physico-chimiques et la dynamique d’auto-assemblage des PSMs gouvernent leurs interactions avec les membranes cellulaires et, in fine, contrôlent la mort cellulaire. Plus particulièrement, le projet vise à caractériser l’impact des PSMs sur la mécanique cellulaire. Une attention particulière sera portée, outre les altérations membranaires, au réseau d’actine, le remodelage de ce dernier étant potentiellement associée à l’internalisation de FPR2 lors de son interaction avec les PSMs. Pour ce faire, le projet adoptera une approche in cellulo et multi-échelle, allant de la cellule vivante à la molécule unique, afin d’identifier les déterminants structuraux, physico-chimiques et dynamiques impliqués dans les interactions peptide-membrane. La microscopie confocale permettra notamment de suivre les réorganisations du cytosquelette et les altérations de la membrane plasmique, alors que la microscopie à force atomique (AFM) permettra l’analyse des propriétés mécaniques des cellules (rigidité, topographie, adhésion).
Activités :
• Culture cellulaire (cellules de mammifère HEK, bactéries)
• Méthodes biophysiques de caractérisation des peptides et protéines membranaires
• Microscopies de fluorescence : confocal, TIRF
• Spectroscopie de force - Microscopie à force atomique
• Analyse, mise en forme et présentation de résultats
Contexte de travail :
Ce projet mobilise des compétences en biophysique des membranes, biologie cellulaire, et imagerie avancée, de l’éch
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