Chercheur postdoctorant

Il y a 5 jours

Paris, Île-de-France CNRS Temps plein

Vos missions en quelques mots

Missions :
Le chercheur ou la chercheuse postdoctorale étudiera les mécanismes moléculaires à l’origine de la formation des orifices olfactifs chez le poisson-zèbre, en se concentrant sur les interactions entre la placode olfactive et l’épithélium cutané sus-jacent.
Un objectif majeur sera d’identifier l’identité moléculaire et la fonction de cellules cutanées spécialisées qui subissent un remodelage au-dessus de la placode olfactive, et de déterminer comment elles acquièrent les propriétés nécessaires à la formation de l’orifice. Le projet étudiera également la contribution des cellules placodales, notamment des cellules non neuronales (« mantle cells »), au remodelage de la peau et à l’ouverture de l’orifice.
Le projet combine des approches de biologie du développement et de biologie moléculaire, de transcriptomique unicellulaire, de bioinformatique, de génétique du poisson-zèbre et d’imagerie en temps réel.
Activités :
Le chercheur ou la chercheuse postdoctorale devra :
• caractériser les profils moléculaires des cellules cutanées remodelées et les comparer à ceux des cellules cutanées voisines à l’aide de la cytométrie en flux (FACS) et de la transcriptomique unicellulaire (Smart-seq3), l’analyse sera réalisée en collaboration avec la plateforme Inforbio ;
• identifier et valider les régulateurs moléculaires candidats impliqués dans le remodelage épithélial et les interactions entre la peau et la placode, en utilisant des approches moléculaires, d’imagerie et de génétique ;
• caractériser les populations de cellules placodales et étudier les signaux moléculaires qu’elles pourraient utiliser pour communiquer avec l’épithélium cutané ;
• analyser les conséquences de la perturbation de gènes candidats à l’aide de la génétique du poisson-zèbre, de l’imagerie en temps réel et de l’analyse quantitative d’images ;
• intégrer les données moléculaires, transcriptomiques et d’imagerie, et contribuer aux publications scientifiques ainsi qu’aux présentations scientifiques.
Contexte de travail :
Le poste est basé à l’Institut de Biologie Paris-Seine (IBPS), Sorbonne Université / CNRS / INSERM, au sein de l’unité Développement, Adaptation et Vieillissement (Dev2A ; CNRS UMR8263 / INSERM U1345).
Le chercheur ou la chercheuse rejoindra le projet de recherche dirigé par Marion Baraban, coordinatrice du projet ANR OPEN, au sein de l’équipe de Marie Breau. Le projet réunit des expertises en biologie du développement, génétique du poisson-zèbre, biologie moléculaire, génomique unicellulaire, imagerie quantitative et mécanobiologie.
Le chercheur ou la chercheuse travaillera en étroite collaboration avec la plateforme de bioinformatique Inforbio, ainsi qu’avec les équipes techniques et d’ingénierie spécialisées dans la génétique du poisson-zèbre et l’imagerie. Le projet comprend également des collaborations avec l’Institut Curie et avec des biophysiciens de l’IBPS.
Le poste est financé par le projet ANR OPEN p
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Profil recherché

Competences :
• Doctorat (PhD) en biologie du développement, biologie cellulaire, biologie moléculaire, génétique ou dans un domaine connexe ;
• Solide expérience en transcriptomique et en analyse bioinformatique, de préférence en séquençage d’ARN unicellulaire (single-cell RNA sequencing) ;
• Intérêt pour la biologie du développement, le remodelage épithélial et la morphogenèse tissulaire ;
Une expérience du poisson-zèbre, de la cytométrie en flux (FACS), de la biologie moléculaire, de la génétique, de l’imagerie ou de l’analyse quantitative d’images serait un atout, mais n’est pas indispensable.
Contraintes et risques :
Le poste implique des activités expérimentales au sein d’un laboratoire de recherche en biologie, notamment la manipulation de poissons-zèbres ainsi que de réactifs biologiques et chimiques, et l’utilisation d’équipements de laboratoire et d’imagerie. Les activités devront être réalisées conformément aux procédures institutionnelles en matière de santé et de sécurité, ainsi qu’à la réglementation en vigueur. Le poste comprend également l’analyse informatique de données transcriptomiques et d’imagerie.

Niveau d'études minimum requis

  • Niveau Niveau 8 Doctorat/diplômes équivalents
  • Spécialisation Formations générales

Langues

  • Français Seuil