Post Doctorat en génomique des populations

il y a 4 semaines


Montpellier, France IRD Temps plein

Génomes complets à faible couverture - Histoire démographique – associations génome/environnement

La structure que vous allez rejoindre

Vous serez affecté au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (), à Montpellier. Le CBGP est composé de 86 agents permanents d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro Montpellier. Les recherches conduites au CBGP s’inscrivent dans le cadre des nombreuses menaces, amplifiées par un contexte de changement global, qui pèsent aujourd’hui sur la sécurité alimentaire, la biodiversité et la santé. Parmi elles, les arthropodes qui attaquent les cultures, les espèces exotiques envahissantes, les réservoirs de zoonoses et leurs vecteurs, font l’objet d’une attention croissante. Le CBGP aborde la question de la gestion des populations de ces espèces animales selon les principes de la systématique intégrative, de l’écologie et des sciences de l’évolution.

Au sein du CBGP, vous rejoindrez l’axe « Écologie et évolution des zoonoses », qui développe des recherches sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage, en particulier des petits mammifères. Une partie de ces recherches vise à comprendre les causes éco-évolutives et les conséquences sanitaires des invasions biologiques impliquant des rongeurs exotiques. Au sein de cet axe, vous rejoindrez le collectif IRD impliqué dans le projet ANR « MICETRAL », dont un des objectifs est de décrire l’histoire d’invasion de la souris domestique en Afrique. Vous interagirez avec deux chercheurs, un ingénieur bio-informaticien, et un ingénieur en biologie moléculaire, ainsi qu’avec deux collaborateurs de .

Une mission attractive

Sous la responsabilité de Carine Brouat, chercheuse à l'IRD et spécialiste en biologie des invasions de rongeurs, vous développerez des analyses de génomique des populations pour comprendre l’histoire de l’invasion en Afrique d’une des pires espèces exotiques envahissantes du monde, la souris domestique (sous espèce Mus musculus domesticus). Vous chercherez à retracer l’histoire de son introduction, sa dynamique d’expansion en Afrique, et vous identifierez les régions du génome qui lui ont permis de s’adapter à de nouveaux environnements. Vous aurez à votre disposition environ 200 génomes complets séquencés à faible couverture de M. m. domesticus échantillonnées en Moyen Orient, en Europe, en Afrique du Nord et en Afrique de l’Ouest, que vous pourrez analyser avec la centaine de génomes déjà disponibles dans la littérature.

Dans ce cadre là, vos activités seront les suivantes :

Réaliser l’analyse bioinformatique des nouvelles données de séquences (240 génomes complets). Récupérer les données de génomes complets à faibles couverture déjà publiées sur la souris domestique, et les associer aux nouvelles données. Mettre en œuvre des analyses de génomique des populations pour retracer l’histoire de l’invasion de la souris en Afrique, et sa dynamique démographique post-introduction. Mettre en œuvre des analyses de détection de sélection et d’association gène-environnement pour déterminer quelles régions du génome ont pu évoluer en réponses à différents gradients environnementaux. Formaliser et valoriser les résultats au travers de publications. Formaliser et valoriser les résultats au travers d’actions de communication scientifique orale (ex. réunions, conférences). Participer aux réunions mensuelles de l’axe « Ecologie et évolution des zoonoses », et contribuer à animer le groupe ‘Bioinformatique » du CBGP.

Votre future équipe

Vous intégrerez un collectif à taille humaine IRD / INRAE composé de 8 chercheurs, 2 ingénieurs d’étude spécialisés respectivement en biologie moléculaire et bioinformatique, et de 2 agents spécialisés en biologie moléculaire.

Le profil que nous recherchons

Vous avez développé les compétences suivantes :

Excellentes connaissances en bio-informatique et des concepts de génomique des populations. Expérience des outils informatiques de traitement des données de séquençage, notamment haut débit. Maîtrise des outils de génomique des populations, notamment ceux adaptés à l’analyse des données de génomes complets à faible couverture pour retracer l’histoire démographique des populations. Maîtrise des outils de détection des signatures de sélection et d’associations génome / environnement.

Vous possédez les qualités suivantes :

Vous savez faire preuve d’autonomie et de dynamisme. Vous savez vous adapter à des interlocuteurs ou interlocutrices de différents niveaux. Vous faites preuve d'un excellent sens relationnel.

Vous êtes titulaire d'un Doctorat en génétique des populations ou génomique évolutive et avez moins de 2 ans d’expérience dans ce domaine après la thèse.



  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 7 mai 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheuse ou chercheur post-doctorat en génétique quantittaive et génomique de la conservation (H/F)** Référence : UMR5554-OPHRON-006 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 16 février 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doc instabilité génomique des cellules souches embryonnaires (H/F).** Référence : UMR9002-CELPRO-014 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: Date Limite Candidature : lundi 28 août 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat sur les Interactions plantes-insectes : Développement d'approches de diversification et de co-biogéographie historique (H/F)** Référence : UMR5554-FABCON-006 Nombre de Postes : 1 Lieu...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 18 décembre 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant en biologie moléculaire (H/F)** Référence : UMR9002-ROSKIE-008 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : lundi 27 novembre...


  • Montpellier, France CEA Temps plein

    Description du poste **Domaine**: - Chimie **Contrat**: - Post-doctorat **Intitulé de l'offre**: - POST-DOCTORAT Développement de contacteurs liquide-liquide multi-étages miniatures H/F **Sujet de stage**: - Dans le cadre du développement de procédés de recyclage de métaux stratégiques par extraction liquide-liquide, ce projet de...

  • Post-doctorat (H/F)

    il y a 4 semaines


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 13 avril 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat (H/F) en Synthèse Totale** Référence : UMR5247-CAMOGE-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : jeudi 23 mars 2023 Type de...


  • Montpellier, France Qualtech Groupe Temps plein

    Situé au Nord de Montpellier, à Montferrier sur Lez dans une campagne typique du Sud de la France, ADNid est une société du Groupe Qualtech. - 330 collaborateurs, 10 sites sur toute la France, 28 M de CA. ADNid, c’est une équipe de 7 personnes (3 cadres et 4 techniciens) tous spécialisés en génomique. Le laboratoire propose des services sur mesure...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 6 juin 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur post-doctoral en biologie (H/F): Exploration de la réplication asynchrone de le l'ADN dans l'empreinte génomique.** Référence : UMR5535-SARADE-031 Nombre de Postes :...

  • H/F Doctorant

    il y a 5 jours


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : H/F Doctorant : Evaluation de l'impact sur la régulation de variants génomiques dans les régions non codantes Référence : UMR5506-LAUBRE-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : lundi 13 mai 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 8 septembre 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doc stress réplicatif et cancer (H/F)** Référence : UMR9002-DOMMAI-007 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : vendredi 18 août...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Date Limite Candidature : lundi 13 mars 2023 **Informations générales**: Référence : UMR5554-ELIHUC-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : lundi 20 février 2023 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 24 mois Date d'embauche prévue : 1 septembre 2023 Quotité de travail : Temps...


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  • Cdd Chercheur

    il y a 4 semaines


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 16 février 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:CDD Chercheur (H/F) instabilité génétique** Référence : UMR9002-PHIPAS0-008 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : vendredi 26...

  • Post-doctorant (H/F)

    il y a 4 semaines


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 14 mars 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-Doctorant (H/F): identification de variants impliqués dans la coopération chez le blé dur** Référence : UMR5554-FRAROU-007 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mardi 4 juillet 2023 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur post-doctoral en biologie moléculaire (H/F) - Étude du complexe polycomb-répressif (PRC) du cilié Tetrahymena.** Référence : UMR9002-KAZMOC-004 Nombre de Postes...

  • Chercheur Post-doctoral

    il y a 4 semaines


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 16 février 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur post-doctoral (H/F) en Phénotypage des Plantes** Référence : UMR5004-CECABA-052 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication :...


  • Montpellier, France Ville de NIMES Temps plein

    Filière **:Administrative** Métier **:Population-Administration Générale** Catégorie **:C** **Adjoint administratif territorial-AAT** CDD ou titulaire **NIMES** **(Gard 30)** **Titulaire ou contractuel** Expérience **:1 à 2 ans** Rémunération statutaire + régime indemnitaire Date limite **:29/03/2024** **Descriptif et...


  • Montpellier, France CNRS Temps plein

    Informations générales Intitulé de l'offre : Post-doctorant en humanités environnementales sur les flux de gènes assistés (H/F) Référence : UMR5175-VIRMAR-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : vendredi 8 mars 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 24 mois Date d'embauche prévue : 1...


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    **Description de l'entreprise** L’École de Diététique et Nutrition Humaine - EDNH est la seule école française spécialisée en Nutrition et habilitée à former des Bac+3 (Bachelor of Science) et Bac+5 (Master of Science) aux fonctions de Nutritionniste. Nous formons des étudiants en Nutrition Humaine et en Nutrition Sportive. À travers une...

  • (H/F) Doctorant

    il y a 4 jours


    Montpellier, France CNRS Temps plein

    Cette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 3 juin 2024 **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F Doctorant : Evaluation de l'impact sur la régulation de variants génomiques dans les régions non codantes** Référence : UMR5506-LAUBRE-001 Nombre de Postes : 1 Lieu de...