Doctorant F/H Thèse en mathématiques sur la modélisation de l'effet de l'hétérogénéité dans les glioblastomes

il y a 4 semaines

Villeurbanne, France INRIA Temps plein

Contexte et atouts du poste

Dans le cadre d’un partenariat (vous pouvez choisir entre)

non pertinent

L’ objectif est de
modéliser la résistance (ou tolérance/adaptation) au stress de différentes cellules souches cancéreuses séparément et surtout en situation de mélange (co-culture).

Mission confiée

Etude de l'effet de l'hétérogénéité dans les glioblastomes en réponse aux stress.

Dans ce projet, le but sera de modéliser la résistance (ou tolérance/adaptation) au stress de différentes cellules souches cancéreuses séparément et surtout en situation de mélange (co-culture). En effet

Dans certaines situations de stress, les observations montrent sur des souches

- dite sensibles aux stress présents dans le microenvironnement tumoral (sensible si elle est seule)

- dite résistantes aux stress présents dans le microenvironnement tumoral (résistante si elle est seule)

ne se transfèrent pas de façon intuitive en réponse au mélange des deux souches. Ainsi lorsque les souches sont mélangées,
 (dans un même sphéroïde par exemple) on s'aperçoit que les sensibles peuvent adopter le comportement des résistantes. C'est notamment observé pour des études sur la capacité de migration. Le but de cette thèse est de caractériser cette résistance collatérale.

Le travail de la personne engagée consistera notamment à

- caractériser via un modèle paramétrique (à construire) des expériences de migration avec une seule souche

- identifier les mesures robustes pour quantifier la réponse au stress dans le cas monosouche

Cela impliquera de se pencher sur divers types de données, sur les trajectoires ou la répartition des cellules (les migrantes partent elles en ligne droite? Gardent elles leur vitesse? etc.). Le modèle envisagé est de type équations structurées (EDP pour la dynamique de population) avec une composante cinétique.

Une fois le modèle établi, le travail consistera:
- à étudier les caractéristiques des trajectoires dans les situations de mélanges pour commencer à étudier notamment leur hétérogénéité,
- à proposer divers modèles de mélanges
- quantifier le comportement des sensibles 'devenues' résistantes (le sont elles toutes devenues ou seulement celles qui ont suffisamment de résistantes autour d'elles par exemples (portée de l'effet)? Leur trajectoire est elle similaire à celle en abscence de stress ou loin du shpéroïde voit-on des changements (durée de l'effet)? etc. )

Ce travail sera mené en collaboration avec Michèle Romanos (CR CNRS en mathématiques) et Erika Cosset (CR CNRS en biologie au CRCL, Centre Léon Bérard)

Principales activités

Principales activés (5 maximum) :

Développer un modèle mathématique paramètrable décrivant la dynamique d'une seule souche Analyse du modèle EDP construit. Confrontation aux données expérimentales Simulation des modèles proposées (y compris en 3d)

Compétences

Compétences techniques et niveau requis :

Analyse des EDP niveau M2 connaissance en dynamiques de populations Experience en simulation numérique M2

Langues :FR

Compétences relationnelles : capacité à interagir (le travail impliquera de travailler aussi avec des non mathématiciens)

Avantages

Restauration subventionnée Transports publics remboursés partiellement Congés : 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement) Possibilité de télétravail (90 jours par an flottants) et aménagement du temps de travail (sauf pour les stagiaires et apprentis) Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria) Accès à la formation professionnelle Participation employeur mutuelle santé (sous conditions)

Rémunération

1ère et 2ème année : 2100 euros brut /mois
 
  3 ème année: 2190 euros brut / mois

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