Ingénieur en Bioinformatique
il y a 1 mois
Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur en Bioinformatique - Analyse de données de séquençage - H/F
Référence : UAR3426-HUGPAR-004
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : lundi 28 octobre 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 6 janvier 2025
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : à partir de 2491.65€ brut mensuel ajustable selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Missions
La personne recrutée participera aux conseils sur les designs expérimentaux, assurera le contrôle qualité des données NGS et réalisera des analyses bioinformatiques et biostatistiques des données produites sur la plateforme en suivant les pipelines existants. Elle sera également amenée à participer aux développements de nouveaux pipelines ou d’outils d’analyse des données. Elle participera à la démarche qualité NFX50-900 (ISO9001).
Activités
- Recueillir les données de séquençage haut débit et contrôler leur qualité ;
- Réaliser des analyses bioinformatiques et statistiques des données de séquençage haut-débit à l’aide des pipelines existants, en les adaptant si nécessaire, ou par la mise en place de nouveaux pipelines ;
- Rédiger des rapports destinés aux clients sur l'analyse qualité, le traitement bioinformatique et l'analyse statistique des données ;
- Rédiger des matériels et méthodes et déposer les éléments nécessaires dans des bases de données publiques en vue de leur publication;
- Gérer des projets clients, interagir et conseiller ces derniers.
- Assurer la veille technologique dans le domaine.
- Veiller à la mise en œuvre des procédures d’assurance qualité
- Assurer la formation, le support et la maintenance auprès des utilisateurs
Compétences
Savoir-faire :
- Langages : R, Python, bash, LaTeX
- Analyse de données de séquençage (notamment RNA-seq et single-cell RNA-seq)
- La connaissance d’un gestionnaire de workflow serait un plus (Snakemake, Nextflow)
- Connaissances générales dans le domaine de la biologie moléculaire et du séquençage haut-débit (NGS)
- Aisance sous Unix, Linux
- Des connaissances en administration système (Linux) seraient appréciées
- Anglais scientifique écrit, oral
- Très bonne communication écrite et orale, en français et en anglais
- Goût pour le travail en équipe
- Esprit d’analyse
Savoir-être :
Nous recherchons un candidat ou une candidate dynamique, aimant communiquer, rigoureux ou rigoureuse ayant le sens de l'organisation et qui sache faire preuve d'autonomie.
Contexte de travail
La plateforme MGX sert la communauté biomédicale montpelliéraine en proposant de nombreuses applications basées sur le séquençage haut débit : transcriptomique (RNA-seq, smallRNA-seq), y compris sur cellules uniques (scRNAseq), identification de variants (mutations ponctuelles, SNP, indels, CNV), génotypage (RADseq, GBS), architecture chromatinienne et épigénomique (ChIP-seq, RRBS, WGBS), y compris sur cellules uniques (scATAC-seq) …
La qualité des travaux réalisés et de l’organisation de la plateforme est attestée par sa participation à l’infrastructure nationale France Génomique en tant que membre du noyau central, par sa labélisation par le GIS IBiSA, par ses certifications ISO9001 et NFX50-900, et par les enquêtes satisfactions menées chaque année.
L’Institut de Génomique Fonctionnelle est une unité mixte INSERM-CNRS-Université de Montpellier composée d’environ 300 personnes qui travaillent en neurosciences, physiologie cardiaque et endocrine et en oncologie.
L'ingénieur ou ingénieure travaillera en interaction avec les bioinformaticiens et biologistes de la plateforme ainsi qu’avec les chercheurs et ingénieurs des équipes de recherche.
Au sein de la partie bioinformatique de l’équipe, la personne recrutée travaillera sous la responsabilité d’un ingénieur de recherche, ainsi qu’avec une ingénieure d’étude.
Contraintes et risques
Pas d’astreinte. 38H30 par semaine.
Risques liés au travail sur écran.
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Ingénieur bioinformatique
il y a 1 semaine
Montpellier, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur bioinformatique / informatique (H/F) Référence : UMR5506-ERIRIV-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : vendredi 22 novembre 2024 Type de contrat : IT en contrat CDD Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 6 janvier 2025 Quotité de travail...
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Ingénieur en Bioinformatique
il y a 2 semaines
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinPrésentation de l'Offre L'Institut de Génomique Fonctionnelle, unité mixte INSERM-CNRS-Université de Montpellier, cherche un Ingénieur en Bioinformatique pour rejoindre son équipe de travail. La plateforme MGX offre des applications basées sur le séquençage haut débit à la communauté biomédicale montpelliéraine. Missions et...
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Ingénieur en Bioinformatique
il y a 4 semaines
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinMissionsLa personne recrutée travaillera sur la plateforme de séquençage haute débit, étant donné que l'institut est un centre de recherche en biomédicine. La personne recrutée contribueraà la conception des expériences, aux conseils sur les designs expérentaux, et s'assurera du contrôle de la qualité des données NGS. Elle réalisera des...
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Ingénieur de recherche en bioinformatique
il y a 3 semaines
Montpellier, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche en bioinformatique (H/F) Référence : UMR9002-ANDOLD-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : mercredi 13 novembre 2024 Type de contrat : CDD Technique/Administratif Durée du contrat : 6 mois Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025 Quotité...
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Ingénieur de recherche en bioinformatique
il y a 2 semaines
Montpellier, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche en bioinformatique (H/F) Référence : UMR9002-ANDOLD-005 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : mercredi 13 novembre 2024 Type de contrat : IT en contrat CDD Durée du contrat : 6 mois Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025 Quotité de travail...
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Spécialiste en bioinformatique pour l'analyse de données
il y a 2 semaines
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinÀ propos du posteL'ingénieur de recherche en bioinformatique recherché travaillera dans une équipe de chercheurs au sein du CNRS. Le candidat sélectionné analysera des données de séquençage génomique déjà produites, notamment ATAC-seq, ChIP-seq et RNA-seq.Missions clésRéanalyzer et homogénéiser les données d'ATAC-seq, de ChIP-seq et...
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Post Doctorat en génomique des populations
Il y a 6 mois
Montpellier, France IRD Temps pleinGénomes complets à faible couverture - Histoire démographique – associations génome/environnement La structure que vous allez rejoindre Vous serez affecté au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (), à Montpellier. Le CBGP est composé de 86 agents permanents d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro Montpellier. Les...
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Postdoctorant en génomique des populations
il y a 3 semaines
Montpellier, Occitanie, France IRD Temps pleinVous rejoindrez l'équipe du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les arthropodes qui attaquent les cultures et les espèces exotiques envahissantes.Vous serez chargé de l'analyse bioinformatique des données de séquences génomiques pour comprendre l'histoire de l'invasion de...
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Product Owner for Genomic Interpretation Software
Il y a 3 mois
Montpellier, France SeqOne Genomics Temps pleinPRODUCT OWNER FOR GENOMIC INTERPRETATION SOFTWARE (H/F) SeqOne est une entreprise dynamique fondée en 2017 et basée à Montpellier, spécialisée dans la génomique et l’analyse des données génétiques. Elle développe des solutions logicielles de pointe pour aider les professionnels de santé, les chercheurs et les laboratoires à analyser,...
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Ingénieur d’études en biologie moléculaire H/F
Il y a 6 mois
Montpellier, France IRD Temps pleinMéthodique – Efficace – Dynamique La structure que vous allez rejoindre (Développement d’une démarche intégrée pour la production maitrisée et durable d’aliments de qualités organoleptique, sanitaire et nutritionnelle optimales) œuvre dans le domaine de la transformation de l’aliment, de son processus d’élaboration après...
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Ingénieur en méthodes de gestion, Alternance
il y a 4 semaines
Montpellier, Occitanie, France VINCI Energies en France Temps pleinDéveloppez vos compétences en méthodes opérationnelles avec VINCI Energies en FranceVous êtes en recherche d'une alternance complète qui vous permettra de mettre en pratique vos connaissances en ingénierie des méthodes. VINCI Energies en France vous offre un poste d'ingénieur en méthodes de gestion, basé à Montpellier, où vous serez en...
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Ingénieur Méthodes Apprenti F/H
il y a 1 mois
Montpellier, Occitanie, France VINCI Energies en France Temps pleinRejoignez VINCI Energies en France et découvrez l'un de nos postes d'apprenti ingénieur méthodes !Vous êtes à la recherche d'une alternance qui vous donnera l'opportunité de développer vos compétences en ingénierie et de travailler dans un environnement dynamique et innovant ?Nous sommes à la recherche d'un(e) apprenti(e)...
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Apprenti Ingénieur Méthodes F/H
Il y a 6 mois
Montpellier, France VINCI Energies en France Temps pleinEt si vous intégriez une entreprise à taille humaine, appartenant à un groupe de forte notoriété, animée par des projets passionnants ? Basée à Montpellier, VINCI Facilities Occitanie Méditerranée fait partie du réseau d’entreprises de VINCI Energies et a pour mission de gérer tout ou partie des installations techniques et des services aux...
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Apprenti Ingénieur Méthodes F/H
il y a 3 semaines
Montpellier, Occitanie, France VINCI Energies en France Temps pleinMissions PrincipalesLe candidat sélectionné assurera la mise en œuvre des méthodes, des standards, des modes opératoires et des dispositifs de management de la performance opérationnelle, conformément au référentiel de la Direction.Responsabilités détaillées Piloter le démarrage d'un contrat multitechnique sur site posté; Mettre en œuvre et...
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Data Steward, Et Animateur de Communautés
Il y a 2 mois
Montpellier, France CNRS Temps pleinDate Limite Candidature : jeudi 17 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Data steward, et animateur de communautés thématique (H/F) - Montpellier** Référence : UAR3601-ANILEF-024 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : jeudi 26 septembre 2024 Type de contrat : CDD...
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Ingénieur de recherche en microfluidique
il y a 3 semaines
Montpellier, France Université de Montpellier Temps pleinÀ propos de nousUne université d’excellenceUniversité de recherche intensive, leader mondial en écologie, l’Université de Montpellier est un établissement public expérimental qui figure dans le top 200 du classement de Shanghai. Elle couvre plusieurs champs disciplinaires sciences et techniques, droit, économie, environnement, administration,...
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Ingénieur technique de second oeuvre F/H
il y a 4 semaines
Montpellier, Occitanie, France VINCI Energies en France Temps pleinProfil recherché : Vous êtes un.e professionnel.e expérimenté.e dans le domaine de la maintenance technique, avec une solide connaissance en serrurerie, plomberie, électricité, peinture, etc. ? Vous avez une formation technique spécialisée en agent d'entretien du bâtiment ou équivalent et une expérience de au moins 3 ans dans des missions de...
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Business Analyst
Il y a 6 mois
Montpellier, France Amiltone Agence d'Aix en Provence Temps plein**Présentation** **Qui sommes-nous ?** Nous sommes passionnés par les nouvelles technologies, et vous ? Rejoindre Amiltone, c’est intégrer des équipes dynamiques et soudées dans le cadre de projets novateurs et ambitieux. Nous relevons les challenges techniques de nos clients et les accompagnons dans leur transformation digitale. **Pourquoi...
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Responsable Bureau D'études
Il y a 5 mois
Montpellier, France Brainfield Recrutement - Aix-en-Provence - Brainfield Temps pleinCher(e) Candidat(e), Nous sommes à la recherche d'un(e) Responsable Bureau d'Études talentueux(se) et expérimenté(e) pour rejoindre notre équipe dynamique. Ce poste clé offre une opportunité passionnante de diriger et de développer notre bureau d'études, en contribuant à la conception et à la réalisation de projets...
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[e-ethylene] Valorisation Du Co2, Recherche de Cso
Il y a 6 mois
Montpellier, France [E-ETHYLENE] Valorisation du CO2 en e-ethylène et autres e-produits Temps plein**Contexte marché et proposition de valeur** Les émissions de CO2 croissantes ont un impact considérable sur le climat de notre planète. Au regard de l’urgence de la situation, de nombreuses équipes de recherche imaginent et développent des technologies, notamment dans la conversion du CO2 en CO, en acide formique ou en méthanol. Cependant, la...