Post Doctorat en génomique des populations
Il y a 6 mois
Génomes complets à faible couverture - Histoire démographique – associations génome/environnement
La structure que vous allez rejoindre
Vous serez affecté au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (), à Montpellier. Le CBGP est composé de 86 agents permanents d'INRAE, de l'IRD, du Cirad et de l'Institut Agro Montpellier. Les recherches conduites au CBGP s’inscrivent dans le cadre des nombreuses menaces, amplifiées par un contexte de changement global, qui pèsent aujourd’hui sur la sécurité alimentaire, la biodiversité et la santé. Parmi elles, les arthropodes qui attaquent les cultures, les espèces exotiques envahissantes, les réservoirs de zoonoses et leurs vecteurs, font l’objet d’une attention croissante. Le CBGP aborde la question de la gestion des populations de ces espèces animales selon les principes de la systématique intégrative, de l’écologie et des sciences de l’évolution.
Au sein du CBGP, vous rejoindrez l’axe « Écologie et évolution des zoonoses », qui développe des recherches sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage, en particulier des petits mammifères. Une partie de ces recherches vise à comprendre les causes éco-évolutives et les conséquences sanitaires des invasions biologiques impliquant des rongeurs exotiques. Au sein de cet axe, vous rejoindrez le collectif IRD impliqué dans le projet ANR « MICETRAL », dont un des objectifs est de décrire l’histoire d’invasion de la souris domestique en Afrique. Vous interagirez avec deux chercheurs, un ingénieur bio-informaticien, et un ingénieur en biologie moléculaire, ainsi qu’avec deux collaborateurs de .
Une mission attractive
Sous la responsabilité de Carine Brouat, chercheuse à l'IRD et spécialiste en biologie des invasions de rongeurs, vous développerez des analyses de génomique des populations pour comprendre l’histoire de l’invasion en Afrique d’une des pires espèces exotiques envahissantes du monde, la souris domestique (sous espèce Mus musculus domesticus). Vous chercherez à retracer l’histoire de son introduction, sa dynamique d’expansion en Afrique, et vous identifierez les régions du génome qui lui ont permis de s’adapter à de nouveaux environnements. Vous aurez à votre disposition environ 200 génomes complets séquencés à faible couverture de M. m. domesticus échantillonnées en Moyen Orient, en Europe, en Afrique du Nord et en Afrique de l’Ouest, que vous pourrez analyser avec la centaine de génomes déjà disponibles dans la littérature.
Dans ce cadre là, vos activités seront les suivantes :
Réaliser l’analyse bioinformatique des nouvelles données de séquences (240 génomes complets). Récupérer les données de génomes complets à faibles couverture déjà publiées sur la souris domestique, et les associer aux nouvelles données. Mettre en œuvre des analyses de génomique des populations pour retracer l’histoire de l’invasion de la souris en Afrique, et sa dynamique démographique post-introduction. Mettre en œuvre des analyses de détection de sélection et d’association gène-environnement pour déterminer quelles régions du génome ont pu évoluer en réponses à différents gradients environnementaux. Formaliser et valoriser les résultats au travers de publications. Formaliser et valoriser les résultats au travers d’actions de communication scientifique orale (ex. réunions, conférences). Participer aux réunions mensuelles de l’axe « Ecologie et évolution des zoonoses », et contribuer à animer le groupe ‘Bioinformatique » du CBGP.
Votre future équipe
Vous intégrerez un collectif à taille humaine IRD / INRAE composé de 8 chercheurs, 2 ingénieurs d’étude spécialisés respectivement en biologie moléculaire et bioinformatique, et de 2 agents spécialisés en biologie moléculaire.
Le profil que nous recherchons
Vous avez développé les compétences suivantes :
Excellentes connaissances en bio-informatique et des concepts de génomique des populations. Expérience des outils informatiques de traitement des données de séquençage, notamment haut débit. Maîtrise des outils de génomique des populations, notamment ceux adaptés à l’analyse des données de génomes complets à faible couverture pour retracer l’histoire démographique des populations. Maîtrise des outils de détection des signatures de sélection et d’associations génome / environnement.Vous possédez les qualités suivantes :
Vous savez faire preuve d’autonomie et de dynamisme. Vous savez vous adapter à des interlocuteurs ou interlocutrices de différents niveaux. Vous faites preuve d'un excellent sens relationnel.Vous êtes titulaire d'un Doctorat en génétique des populations ou génomique évolutive et avez moins de 2 ans d’expérience dans ce domaine après la thèse.
-
Postdoctorant en génomique des populations
il y a 3 semaines
Montpellier, Occitanie, France IRD Temps pleinRechercheur en génomique des populationsVous rejoindrez l'équipe de recherche de l'IRD au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations à Montpellier. Vous travaillerez sur les arthropodes qui attaquent les cultures, les espèces exotiques envahissantes, les réservoirs de zoonoses et leurs vecteurs.MissionVous développerez des analyses de...
-
Postdoctorant en génomique des populations
il y a 4 semaines
Montpellier, Occitanie, France IRD Temps pleinMission et objectifsL'IRD recherche un postdoctorant pour rejoindre l'axe "Écologie et évolution des zoonoses" au Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier. Le candidat sélectionné travaillera sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage, en particulier des petits...
-
Postdoctorant en génomique des populations
il y a 1 semaine
Montpellier, Occitanie, France IRD Temps pleinVous rejoindrez l'équipe du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les arthropodes qui attaquent les cultures et les espèces exotiques envahissantes.Vous serez chargé de l'analyse bioinformatique des données de séquences génomiques pour comprendre l'histoire de l'invasion de...
-
Postdoctorant en génomique des populations
il y a 4 semaines
Montpellier, Occitanie, France IRD Temps pleinMission scientifiqueVous rejoindrez l'équipe du Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (CBGP) à Montpellier, où vous travaillerez sur les maladies infectieuses ayant pour réservoir des animaux de la faune sauvage.Objectifs de la missionVous développerez des analyses de génomique des populations pour comprendre l'histoire de...
-
Chargé-e de Recherche en Génomique Structurale
Il y a 5 mois
Montpellier, France INRAE Temps plein34398 MONTPELLIER _ **RETOUR À LA LISTE DES POSTES DE LA CAMPAGNE** **Présentation d'INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche placé sous la double tutelle du ministère en charge de l’agriculture et du ministère en charge de la...
-
Post-doctorat en Génétique
il y a 3 semaines
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 22 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-Doctorat en génétique (H/F)** Référence : UMR9002-JERMAN-003 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication :...
-
Post-Doctorat en génétique
il y a 3 semaines
Montpellier, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : Post-Doctorat en génétique (H/F) Référence : UMR9002-JERMAN-003 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : vendredi 1 novembre 2024 Type de contrat : CDD Scientifique Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025 Quotité de travail : Temps...
-
Post-Doctorat en génétique
il y a 1 jour
Montpellier, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : Post-Doctorat en génétique (H/F) Référence : UMR9002-JERMAN-003 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : vendredi 1 novembre 2024 Type de contrat : Chercheur en contrat CDD Durée du contrat : 12 mois Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025 Quotité de travail :...
-
Thèse de Doctorat
Il y a 2 mois
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 14 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Thèse de doctorat (H/F) en biologie: visualiser les choix cellulaires par l'imagerie de la transcription** Référence : UMR9002-EDOBER-008 Nombre de...
-
Post-doctorant (H/F)
Il y a 2 mois
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : lundi 30 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant (H/F) en phylogénomique des mammifères xénarthres** Référence : UMR5554-FREDEL-006 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...
-
Post-doctorat (H/F)
il y a 2 jours
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 11 décembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorat (H/F) « Résilience des écosystèmes steppiques de la région du Petit Caucase à l’Holocène »** Référence :...
-
Offre de thèse
Il y a 2 mois
Montpellier, France CNRS Temps pleinInformations générales Intitulé de l'offre : Offre de thèse (H/F) : Profilage Intégratif de Virus par Analyse Mutationnelle de Génome Entier Référence : UMR5048-MANLEP-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : jeudi 3 octobre 2024 Type de contrat : CDD Doctorant/Contrat doctoral Durée du contrat : 36 mois...
-
Ingénieur en Bioinformatique
il y a 7 jours
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinPrésentation de l'Offre L'Institut de Génomique Fonctionnelle, unité mixte INSERM-CNRS-Université de Montpellier, cherche un Ingénieur en Bioinformatique pour rejoindre son équipe de travail. La plateforme MGX offre des applications basées sur le séquençage haut débit à la communauté biomédicale montpelliéraine. Missions et...
-
Cdd Chercheur
Il y a 2 mois
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 4 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:CDD Chercheur - Informaticien/statisticien pour l’analyse de réarrangements génomiques d’Anopheles (H/F)** Référence :...
-
Post-doctorant en Bio-informatique
il y a 2 semaines
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : mercredi 27 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Post-doctorant en bio-informatique (H/F)** Référence : UMR9002-HERSEI-004 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication :...
-
(H/F) Post-doctorat
il y a 1 mois
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 7 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:(H/F) Post-doctorat (12 mois) - Préparation et caractérisation de membranes renforcées pour piles à combustible** Référence :...
-
(H/F) Thèse en Génétique de La Drosophile Et en
Il y a 3 mois
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : jeudi 26 septembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:H/F Thèse en génétique de la Drosophile et en Biologie moléculaire** Référence : UMR9002-JERMAN-002 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail :...
-
Chercheur Post-doctoral
il y a 3 semaines
Montpellier, France CNRS Temps pleinCette offre est disponible dans les langues suivantes: - Français - Anglais Date Limite Candidature : vendredi 22 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris **Informations générales**: **Intitulé de l'offre **:Chercheur Post-doctoral (H/F)** Référence : UMR9002-JERDEJ-007 Nombre de Postes : 1 Lieu de travail : MONTPELLIER Date de publication : vendredi 1...
-
Chercheur post-doctoral dans le cadre du projet ANR Deep Pep
il y a 4 semaines
Montpellier, Occitanie, France CNRS Temps pleinMissionL'objectif principal de ce poste est de développer un modèle d'apprentissage profond capable de prédire des peptides synthétiques capables d'interagir avec une protéine cible donnée. Ces peptides naturels et synthétiques seront ensuite appliqués aux plantes afin d'enregistrer leurs effets sur les réponses développementales et...
-
Postdoc en Ecogénomique Microbienne
Il y a 5 mois
Montpellier, France INRAE Temps pleinMontpellier _ **RETOUR À LA LISTE DES RÉSULTATS** **Présentation INRAE**: L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées...
