Chercheur postdoctorant en génétique microbienne

Informations générales

Intitulé de l'offre : Chercheur postdoctorant en génétique microbienne (H/F)
Référence : UMR5100-OLAREN-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : TOULOUSE
Date de publication : mercredi 5 juin 2024
Type de contrat : CDD Scientifique
Durée du contrat : 29 mois
Date d'embauche prévue : 1 octobre 2024
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2991 et 4166€ brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 8 - (Doctorat)
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
Section(s) CN : Organisation, expression, évolution des génomes

Missions

Développent d'un projet multidisciplinaire qui abordera l'hétérogénéité phénotypique d'un facteur de virulence majeur à différents niveaux d'organisation cellulaire (de la cellule unique aux populations), sur des échelles de temps (courte-terme à la microévolution) et à travers divers environnements. Il contribuera à identifier les tendances adaptatives bactériennes afin de mieux prédire les résultats évolutifs dans les contextes sauvages et cliniques.
Comme système modèle on utilise Klebsiella pneumoniae, une bactérie pathogène nosocomiale productrice des carbapénamases et causant des infections pulmonaires, urinaires et hépatiques

Activités

1.Construction de mutants (fusions fluorescence) et analyse de phénotypes
2.Mesure d'expression génétique
3.Mesure de taux de transfert horizontale
4.Expériences d'évolution sous différentes pression de sélection
5.Présentation des résultats lors de congrès
6. Supervision des nouveaux membres de l'équipe et des stagiaires sur les aspects liés à la génétique microbienne.

Compétences

Le candidat /la candidate devra:
-Avoir des connaissances approfondies en génétique microbienne,
-Avoir des connaissances en single-cell / Cytométrie de flux /Microscopie à fluorescence
-Expérience de l'analyse de données et des statistiques
-Maitrise de la langue anglaise (Niveau B1) et un intérêt par l'évolution est aussi très important et essentiel
-Très bonne organisation pour gérer un grand nombre de souches en parallèle

- Avoir une capacité à travailler de manière indépendante et en équipe
- Connaître les règles d'hygiène et de sécurité liées à la pratique de la biologie moléculaire et manipulation de microorganismes en L2
- Avoir des compétences en matière de rédaction et de présentation en anglais.

-Connaissance en bio-informatique, compétences en génomique comparative seront un plus.

Contexte de travail

Le travail sera effectué dans une nouvelle équipe bien financée et récemment installée à Toulouse, au Centre de Biologie Integrative (CBI).
Le CBI est un important centre de recherche en biologie fondamentale géré par l'Université de Toulouse (UT) et le Centre national français de la recherche scientifique (CNRS). Il est situé dans le sud-ouest de la France sur le campus principal de l'Université Toulouse III-Paul Sabatier qui offre une formation pluridisciplinaire dans tous les domaines de la science, de la santé, de l'ingénierie et de la technologie.

Le CBI rassemble actuellement 400 scientifiques travaillant dans des groupes de recherche internationalement reconnus, qui étudient les aspects fondamentaux de la structure et de la fonction des systèmes biologiques complexes. La recherche au CBI couvre toutes les échelles, des molécules individuelles aux organismes entiers et aux groupes d'animaux. La recherche au CBI est multidisciplinaire, combinant un large éventail de domaines tels que la biologie structurale, la biochimie et la biophysique, la génétique, la génomique et l'épigénétique, ainsi que la biologie cellulaire, la biologie du développement, la neurobiologie, le comportement collectif des animaux, et la biologie computationnelle et systémique.

L'unité de microbiologie du CBI, le LMGM, accueille 7 groupes internationalement reconnus pour leurs recherches sur l'évolution et la biologie moléculaire et cellulaire des bactéries à travers l'analyse intégrative de mécanismes fondamentaux clés.

Informations complémentaires

Votre candidature devra contenir un CV, une lettre de motivation et idéalement deux lettres de recommandation.